resume du sejour a l`observatoire thonier de l`ird a sete

SCRS/2011/180
Collect. Vol. Sci. Pap. ICCAT, 68(3): 1250-1252 (2012)
RESUME DU SEJOUR A L’OBSERVATOIRE
THONIER DE L’IRD A SETE
Fambaye Ngom Sow
SUMMARY
The training was carried out at the Observatoire thonier (OT) of the IRD. The training on
processing tools and the analysis of tuna data lasted two months (from 2 May to 1 July 2011)
and was financed by ICCAT. The Observatoire thonier (OT) is a system of collection,
management, processing and analysis of statistical data of French tropical tuna fishing. In
order to better respond to its objectives, the OT has established collaboration with other
research institutes on fishing such as the CRODT in Senegal. Such collaboration is centered on
the monitoring of fishing as well as the resources and the monitoring tools. Being responsible
for a short time for the monitoring of tunas from Dakar, for the CRODT, IRD and IEO it is very
important to become familiar with the various tools implemented by the OT to obtain, generate
and process these data. In fact, the utilization of the tools for introduction, storage, processing
and analysis of the data is of primary importance to guarantee good monitoring of the quality
of the data, which is essential for adequate management of the fisheries. Thus, a command of
the control of the structure of the tuna data and the processing allows me to complete the
ICCAT Task I and Task II (catch and effort and size) and to contribute effectively to the
research on tunas.
RÉSUMÉ
Le stage s’est déroulé en France auprès de l’Observatoire thonier (OT) de l’IRD. La formation
aux outils de traitement et d’analyse des données thonières a durée deux mois (du 2 mai au 1er
juillet 2011) et a été financée par l’ICCAT. L’Observatoire thonier (OT) est un dispositif de
collecte, de gestion, de traitement et d’analyse des données statistiques de la pêche thonière
tropicale française. Afin de mieux répondre à ses objectifs, l’OT a mis en place des
collaborations avec d’autres institutions de recherche sur les pêches dont le CRODT au
Sénégal. Les collaborations portent à la fois sur le suivi des pêches et des ressources et les
méthodes et outils de suivi. Etant responsable depuis peu du suivi thonier de Dakar pour le
CRODT, IRD et IEO, il s’avère important de se familiariser avec les différents outils mis en
place par l’OT pour acquérir, générer et traiter ces données. En fait, l’appropriation des outils
de saisie, de stockage, de traitement et d’analyse des données constitue un point majeur pour
garantir un bon suivi de la qualité des données, condition préalable à une bonne gestion des
pêcheries. Par ailleurs, la maîtrise de la structure des données thonières et des outils de
traitement et d’analyse me permet d’accomplir la tâche I et la tâche II (prise et effort et taille)
de l’ICCAT et de contribuer efficacement à la recherche sur les thonidés.
RESUMEN
La formación se realizó en Francia, en el Observatoire thonier (OT) del IRD. La formación
sobre herramientas de procesamiento y análisis de datos sobre túnidos tuvo una duración de
dos meses (del 2 de mayo al 1 de julio de 2011) y fue financiada por ICCAT. El Observatoire
thonier (OT) es un dispositivo de recopilación, gestión, procesamiento y análisis de datos
estadísticos de la pesca de túnidos tropicales francesa. Para responder mejor a sus objetivos, el
OT ha establecido colaboraciones con otras instituciones de investigación pesquera, entre ellas
el CRODT, en Senegal. Las colaboraciones se centran tanto en el seguimiento de la pesca y de
los recursos como en los métodos y herramientas de seguimiento. Como responsable desde
hace poco tiempo del seguimiento de los túnidos de Dakar, para el CRODT, el IRD y el IEO, es
importante familiarizase con las diferentes herramientas utilizadas por el OT para obtener,
generar y procesar estos datos. De hecho, los conocimientos de las herramientas de
introducción, almacenaje, procesamiento y análisis de datos son indispensables para
garantizar un buen seguimiento de la calidad de los datos, condición esencial para una
ordenación adecuada de las pesquerías. De hecho, el dominio de la estructura de datos
atuneros y de las herramientas de tratamiento y análisis me permite completar la Tarea I y la
1250
Tarea II (captura /esfuerzo y talla) de ICCAT y contribuir eficazmente a la investigación sobre
túnidos.
KEYWORDS
Fishery statistics, capacity building
Contenu de la formation
Au cours de la formation, les notions nécessaires pour l'utilisation des bases de données thonières ont été
abordées. Les exemples et les travaux pratiques sont réalisés avec les bases SARDARA et AVDTHv33,
(Acquisition et Validation des Données Thonières), de l'Observatoire Thonier.
Le programme de formation comprend :
 Présentation des bases de donnees (Avdth, Sardara, Tucaw ) et installation des outils de l'Observatoire
Thonier (Babys et T3).
 Bases de données
• Logique des Système de Gestion des Bases de Données (SGBD) avec un rappel des théories des bases
de données relationnelles et les modèles de données (hiérarchique, réseau...).
• Techniques de modélisation : le modèle conceptuel, les concepts de base (entités, associations..), le
niveau conceptuel avec Merise, la démarche et la prise en compte des règles métier et contraintes.
• Modèle logique de données : le modèle logique (la structure des tables et des contraintes ; le modèle
relationnel (concepts, notations, terminologie) et du conceptuel au logique.
 Les outils d’accès aux données
• pgAdmin est un gestionnaire de bases de données Open Source pour l'administration des bases
PostgreSQL. Il comprend une interface graphique administrateur, et permet d'écrire des requêtes SQL
simples comme complexes. Un éditeur de code procédural est également intégré. Une documentation
fournie l'accompagne.
• DSN ODBC (Open Database Connectivity) est une norme de protocole permettant aux applications
d'accéder à des systèmes de bases de données. Le langage de requête utilisée est le SQL (Structured
Query Language).
• Implémentation avec SQL.
 Le langage SQL
C'est un langage fourni avec tout SGBD relationnel. C'est un standard reconnu par l'IS0 depuis 87
(standard donc portabilité). SQL est un LDD et un LMD. Il est aussi utilisé pour définir des vues, les
droits d'accès, manipulation de schéma physique.
• Restriction, les calculs élémentaires, la projection, les calculs d’agrégats, la fonction de groupe.
• Calculs statistiques (variance, écart type, …).
• Restrictions sur agrégats.
• Travaux pratiques avec Microsoft Access et une base AVDTH.
• Export de données au format csv.
 Application T3
• Installation de l’application.
• Export de données à partir d’AVDTH.
1251
• Mise en place de ces données dans l’arborescence T3.
• Exécution du traitement.
• Découverte des formats de sorties (ecd, m11,…) et des tableaux de synthèse pour l’ICCAT.
 Programme R
Initiation et utilisation de la bibliothèque de requêtes de l’OT (Production de cartes de distribution des
captures).
A l’issue de cette formation un document de synthèse sur la pêcherie des canneurs de Dakar de 1960 à 2010 est
produit. De plus les données des canneurs sénégalais de 2005 à 2010 ont été traitées par T3 et les taches I et II
soumises au secrétariat de l’ICCAT.
1252