d`information - Interreg Sudoe

Présenta.on!
Atelier sur l'utilisation, la
manipulation et la gestion des
ressources génomiques
Programme!
Inscrip.on!
22'<24'Avril'2013'
Logement!
Centro'de'Supercomputación'y'Bioinformá5ca'
Parque'tecnológico'de'Málaga'
Accès!
Présenta5on'
Le!déploiement!et!l’u.lisa.on!des!nouvelles!technologies!de!séquençage!(NGS)!s’est!généralisé!
dans!la!communauté!scien.fique!ce!qui!permet!l’étude!et!la!caractérisa.on!à!grande!échelle!des!
génomes,!transcriptomes!ainsi!que!de!leurs!varia.ons!autant!chez!les!procaryotes!que!chez!les!
eucaryotes.!Actuellement,!ceHe!technologie!permet!de!réaliser!de!grandes!avancées!dans!les!
systèmes!de!produc.ons!animales!et!végétales!en!par.culier!lors!de!l’applica.on!de!cellesIci!à!
l’op.misa.on!et!la!manipula.on!des!produc.ons!mais!également!aux!plans!de!sélec.on!et!
d’améliora.on.!
!
Une!des!difficultés!rencontrées!par!les!techniciens!et!les!chercheurs!qui!manipulent!les!données!
NGS!réside!dans!le!grand!volume!d’informa.on!généré!ainsi!que!dans!le!main.en!et!la!mise!à!jour!!
des!procédés!et!des!ou.ls!nécessaires!pour!.rer!le!rendement!maximum!des!données!obtenues.!
L’objec.f!de!cet!atelier!est!d’introduire!d’une!façon!très!pra.que!les!stratégies!principales!et!les!
ou.ls!d’analyses!bioinforma.ques!pour!l’analyse!de!NGS.!Pour!cela,!les!données!générées!par!le!
projet!AQUAGENET!ainsi!que!les!superordinateurs!du!SCBI!seront!u.lisés.!Cet!atelier!sera!orienté!
vers!l’applica.on!et!la!mise!en!pra.que!pour!.rer!profit!de!toute!l’informa.on!générée!par!les!
NGS.!
Manuel'Manchado'
IFAPA,!Junta!de!Andalucia!
Coordonnateur!d’AQUAGENET!
Première'SESSION:'22'Avril'
10:30I11:00!
Welcome!Desk!/!Registra.on!
11:00I11:15!
Opening!session!(M.#Gonzalo#Claros#&#Manuel#Manchado)!
11:15I12:15!!
How!to!use!the!PAB!resources!(Darío#Guerrero)!
!
12:00I13:00!
Browsing!SoleaDB!(Hicham#Benzekri)#
!
13:00I14:30!
Lunch!
14:30I16:15!
Ra.onale!of!rea!preIprocessing!(M.#Gonzalo#Claros)!
Prac.sing!SeqTrimNext!for!transcriptomics!(M.#Gonzalo#Claros)!
Coffee!break!
16:15I16:30!
16:30I18:00!
SeqTrimNexPrac.sing!SeqTrimNext!for!transcriptomics!II!(M.#Gonzalo#Claros)!
Discussion!about!SeqTrimNext!results!(M.#Gonzalo#Claros)!
!
Deuxième'SESSION:'23'Avril'
9:00-11:00!
Assembling!longIread!transcriptomics!(Rocío#Bau<sta)!
How!to!use!MIRA3,!EULERISR,!CAP3!(Rocío#Bau<sta)!
11:00I11:30!
Coffee!break!
11:30I13:00!!
13:00I14:30!
14:30I16:15!
16:15I16:30!
16:30I18:00!
How!to!use!Bow.e,!FullLengtherNext!(Rocío#Bau<sta)!
Uses!of!FulLengtherNext!in!assemblies!(M.#Gonzalo#Claros)!
Lunch!
Assembling!shortIread!transcriptomics!(Hicham#Benzekri)#
How!use!oases,!CDIHit,!artefact!script!(Hicham#Benzekri)!
Coffee!break!
Annota.on!in!transcriptomics:!Sma3s!vs!Blast2GO!(Pedro#Seoane)!
Annota.on!in!genomics:!Maker!&!Maker!for!Conifers!(Pedro#Seoane)'
Troisième'SESSION:'24'Avril'
9:00-11:00!
Analysing!RNAISeq!(Rocío#Bau<sta)#
How!to!use!SAM!files,!Robina!(Rocío#Bau<sta)!
11:00I11:30!
Coffee!break!
11:30I13:00!!
13:00!
Differen.al!gene!expression!using!RNAISeq!(Rocío#Bau<sta)#
Func.onal!interpreta.on!of!RNAISeq!results!(Rocío#Bau<sta)!
Closing!session!(M.#Gonzalo#Claros)'
L'enregistrement'doit'se'faire'sur'le'site'web'suivant:'
hHp://www.scbi.uma.es/cursoaquagenet!
Pour'toute'ques5on,'vous'pouvez'contacter'le'numéro'suivant:'
+34I(671)!532088!
Il'est'recommandé'que'chaque'par5cipant'apporte'son'ordinateur'portable'
L'inscrip5on'sera'réalisée'dans'l'ordre'strict'de'l'arrivée'de'courriels'jusqu'à'un'maximum'de'20'personnes.'Un'
email'de'confirma5on'sera'envoyé.'
1.'Hotel'Posadas'de'España***'
C/!Graham!Bell,!s/n!Parque!Tecnologico!De!Andalucia,!29590!Campanillas!(Málaga)!
hHp://www.quehoteles.com/hotelIdeImalagaIPosadasIDeIEspanaI
MalagaI4C15P155D562Z13340EF.htm'
2.'Hotel'Málaga'Centro****'
C/!Mármoles,!6,!29007!p!Málaga!
Tlf:!+34!95!207!02!16!
eImail:[email protected]!
hHp://www.salleshotels.com/es/seccion/32/hotelImalagaIcentro.html'
3.'Hotel'Tryp'Alameda****'
Centro!Comercial!Larios.!Avda.!de!la!Aurora,!25!,!29002,!Málaga!!
Tel:+34!902!14!44!40!!
hHp://es.melia.com/hoteles/espana/malaga/trypImalagaIalamedaIhotel/home.htm!
3.'Hotel'Don'Curro***'
C/!Sancha!de!Lara,!7!p!29015!Málaga!!
Tel:+34!952!22!72!00!!
hHp://www.hoteldoncurro.com!
Pour!obtenir!des!informa.ons!pra.ques!sur!le!parc!technologique!de!Malaga!et!les!possibilités!de!
logement!,!veuillez!consulter!les!liens!suivants!::!
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Aéroport'de'Málaga'
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Gare'María'Zambrano'
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