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deux séquences. La matrice attribue un score à l'alignement de toutes les paires possibles de résidus.
La matrice utilisée dans une recherche BLAST peut être adaptée selon le type de séquence rech...
Analyses de séquences - Pages Persos Chez.com
R
F
Y
I
K
A
Q
D
Y
à 5 acides aminés sont les mêmes, les chaînes sont différentes
1 +1 - Céline Brochier
• Toutes les paires ayant servi a construire une matrice
BLOSUMk ont une identité ≥ à k %.
• Matrices plus adaptées pour des protéines distantes du point
de vue évolutif.
Blast Algorithme de blast
Algorithme de Blast
Alignement optimal (Smith & Waterman)
- Sélection des HSPs avec score suffisant