(Microsoft PowerPoint - Annexe n03

Annexe n°3 – PV CS du 9 mars 2009
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Proposition de création d’une Fédération de Recherche
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Plan
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
- Pourquoi la diversité et l’évolution ?
- Le contexte national
- Le contexte local
- Les unités fondatrices et les équipes associées
- Les tutelles
- Les thèmes de recherche
- Structure de la fédération
- Interactions existantes
- L’enseignement
- L’IDEV demain
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Pourquoi la diversité et l’évolution ?
Genèse
- Mutations ponctuelles
- Insertions/délétions
- Cassures
- Remaniements chromosomiques
-…
Evolution
Adaptation
Diversité génétique
Maintien
- Equilibre Sélection/Dérive/migration
- Structuration des populations
- Avantages des hétérozygotes
-…
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Pourquoi la diversité et l’évolution ?
Diversité et Evolution
Thème transversal à toute la biologie
“Nothing in Biology Makes Sense
Except in the Light of Evolution” (1973)
Theosodius Dobzhansky
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Pourquoi la diversité et l’évolution ?
Thème qui n’est pas purement académique
Fondamental
- Spéciation
- Mise en place de barrières
aux flux de gènes
- Evolution des génomes
- Plasticité structurale et fonctionnelle
- Métagénomique
- Exploration des organismes
non cultivables
- Evo-Devo
- Emergence d’innovation
phénotypique
- Modélisation – simulation
- dynamique des génomes,
des populations, des écosystèmes…
Appliqué
- Santé
- Evolution des résistances
(des bactéries aux antibiotiques)
- Evolution des populations
- Epidémiologie
- Agronomie
- Domestication et
amélioration des espèces
- Ecologie
- Biodiversité et Ecosystèmes
- Questions sociétales
- Impact des changements globaux
- Diffusion des transgènes…
L’IDEV
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Le contexte national
Instituts, laboratoires, équipes
travaillant sur l’évolution et la Biodiversité
- Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier
- Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive de Montpellier
- Laboratoire Evolution et Diversité Biologique de Toulouse
- Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive de Lyon I
- Lille, Chizé, Grenoble, Roscoff, Poitiers, Tours, Strasbourg, etc.
- Paris Intra-muros : MNHN
+ équipes ENS, P6, P7, AgroParisTech
Pas de structuration en région parisienne
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L’IDEV
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Le contexte local
Pôle principal : Orsay + Gif
Potentiel présent sur le Grand Campus
en recherche et enseignement
Diversité des approches
moléculaires, cellulaires, populationnelles, comparatives, théoriques, etc.
Diversité des modèles biologiques
la majeure partie des grands groupes du vivant
Archées, Bactéries, Plantes, Champignons, animaux, virus, etc.
Diversité des niveaux d’étude
Séquences codantes ou non, génomes, individus, populations, écosystèmes
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
•
•
Le contexte local
Régulation de l’expression des gènes, réseaux de gènes
Evolution structurelle et fonctionnelle des génomes
Caractères complexes : comportement, morphologie, physiologie
Evo-Devo (animal et végétal)
• Relations génotype – phénotype
•
•
L'évolution sur le
grand Campus
Orsay-Gif
Génétique et écologie évolutive
Génétique de l’adaptation
• Acquisition de nouvelles fonctions
•
•
Macro et micro évolution, domestication
Relations hôtes-parasites et symbioses
• OGM – Flux de transgènes
•
•
•
Approches métagénomiques
Phylogénies (gènes vs espèces…)
•
Biodiversité
•
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Les unités et équipes
Les membres fondateurs
Diversité, Ecologie et Evolution des
Insectes Tropicaux (IRD)
IGM
Les équipes associées
DEPSN (IAF)
~ 250 personnes, 29 équipes
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Les unités et équipes
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Les unités et équipes
Un institut sans mur… dans un premier temps
L’IDEV
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Les tutelles
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Les thèmes de recherche
Origine de la biodiversité
Organisation et plasticité des génomes
Origine des innovations phénotypiques
Conflits génétiques et systèmes de reproduction
Dynamique de la biodiversité
Adaptation, Spéciation, Co-évolution
Dispersion des gènes et des transgènes
Invasions biologiques
Interactions entre les changements climatiques et la biodiversité
Evaluation, Gestion et Valorisation de la Biodiversité
Modélisation
Biologie des systèmes
L’IDEV
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Structure de la Fédération
Directeur – Directeurs-Adjoints
Secrétariat
Gestion administrative
Site web
Communication
Conseil Scientifique
Directeurs des unités
et des équipes
Responsable enseignement (LMD)
Responsable plateaux communs (fragments, séquençages…)
Responsable plateforme (protéomique)
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L’IDEV
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Interactions existantes
- Réflexion commencée il y a 3 ans
- Début de structuration autour du thème de l’Evolution d’ Unités
et d’équipes du CNRS et l’UPS11, avec un fort soutien du
Département de Biologie de l’UPS11
- Colloque annuel : EvoSud (réseau informel)
- Site Internet EvoSud
- Les unités et équipes
- Les axes de recherches
- Les enseignements
- Les séminaires, colloques, conférences…
L’IDEV
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Interactions existantes
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Interactions existantes
3ème journées EvoSud
26 – 27 mars 2009
UPS – IFR 115 – IFR 87 – GDR 1928
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Interactions existantes
38 - 40 au cours des 10 dernières années
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Interactions existantes
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Enseignement
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L’IDEV
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Enseignement
Licence Sciences Technologie Santé : Mention de Biologie
UE communes à l’ensemble des 6 parcours de Biologie
- Cycles biologiques chez les animaux et les végétaux (Biol101)
- Diversité du Vivant et Evolution (Biol102)
- Approche génétique et écologique du monde vivant (Biol103)
-Sciences de l'environnement et écologie (Biol261)
UE spécifiques aux parcours Biologie des Organismes aux Ecosystèmes
ou à celui de Biologie Intégrative
- Gènes, mutants et mutations (Biol154)
- Introduction à l'analyse génétique (Biol202)
- Biologie du développement animal et végétal (Biol203)
- Evolution et diversité des Métazoaires (Biol308)
- Génétique des Populations et Quantitative (Biol312)
- Botanique systématique (Biol322)
- Evolution des métazoaires (Biol307)
- Biologie animale (Biol301)
- Botanique appliquée aux milieux naturels (Biol321)
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Enseignement
Master Sciences Technologie Santé
Une mention et une spécialité font explicitement référence à l’Evolution:
- Génomes, Cellules, Développement, Evolution
- Ecologie, Biodiversité, Evolution (Spécialité de la mention Environnement)
- Biologie et Génétique Evolutives (P. Capy)
- Ecologie Evolutive (J. Lecomte)
- Génétique Evolutive (B. Albert)
- Génétique multifactorielle (D. de Vienne)
- Déterminisme de la Variabilité des Caractères Complexes (C. Dillmann et D. de Vienne
- Génomique Comparée et Evolutive (O. Lespinet et B. Labedan)
- Plasticité des Génomes (P. Capy)
- Evolution en questions (P. Capy, D. de Vienne, O. Lespinet)
- Les grands défis de l’Environnement (R. Paugam)
- Biodiversité et Fonctionnement des Ecosystèmes (F. Hulot)
- Biologie et Ecologie des Milieux Aquatiques (L. Barthes)
-Modélisation du fonctionnement des Ecosystèmes (E. Dufrêne et P. Leadley)…
Plusieurs de ces UE sont ouvertes aux doctorants des écoles doctorales.
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Enseignement
Ecoles Doctorales de rattachement
ED 426 : Gènes, Génomes, Cellules
Dir : G. Baldacci – Institut Curie Orsay et P. Capy – LEGS
ED 145 : Sciences du Végétal –
Dir. M. Dron – IBP et J. Shykoff – ESE
ED 419 : Signalisation, Neurosciences, Endocrinologie, Reproduction
Dir. M. Misrahi - Université Paris-Sud 11
ED 249 : ABIES – AgroParisTech
Dir. M. Lefort – AgroParisTech
ED 392 : Diversité du Vivant
Dir. H. Le Guyader – Université Paris 6
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Valeur ajoutée
« Valeur ajoutée » de l’IDEV
Lisibilité/attractivité vis-à-vis de l’extérieur
Colloque annuel
Séminaires « midipile »
Plateaux & plates-formes mutualisés
Financement de projets transversaux
Etc.
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L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Et demain ?
L’IDEV demain
La décision récente de déplacer tout ou partie de l’Université sur le plateau de Saclay, en
commençant pas la biologie, fournit l’occasion d’une opération cohérente et ambitieuse
de regroupement.
La biologie d’Orsay-Gif se structure autour de 6 grandes thématiques :
• Neurosciences
• Biodiversité - Écologie
• Biologie et physiologie végétales
• Biologie cellulaire et développement
• Biologie des microorganismes
• Macromolécules et Fonctions cellulaires
L’IDEV
Institut Diversité et Evolution du Vivant
Et demain ?
Thème Biodiversité - Écologie
Institut Diversité et Evolution du vivant
Ecologie (ESE)
CNRS - Université Paris Sud - IRD - INRA – AgroParisTech
Ecologie des communautés et des
écosystèmes
Origine de la biodiversité
Dynamique de la biodiversité
Evaluation, Gestion et Valorisation de la Biodiversité
Ecophysiologie, Ecotoxicologie
IDEV « avec murs » ?
Où ?
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