Recherche en génomique fonctionnelle et computationnel

Recherche en génomique fonctionnelle et computationnel

Dr EVENO Eric
Né le 18 janvier 1965, Versailles
Marié, un enfant
Adresse personnelle
484 rue haute,
45590 Orléans.
Tél : +33 (0)2 38 66 76 40
[email protected]
Recherche en génomique fonctionnelle et computationnelle
R&D et applications
DOUBLE FORMATION
1996-1997
: DESS d’Informatique en Biologie. Institut Pasteur, Paris.
1995-1996
: Post-doctorat. Leiden, Pays-bas.
1991-1995
: Doctorat de Génétique et Biologie Moléculaire, Université Paris VII.
1990-1991
: DEA de Biologie du Vieillissement, Université Paris VII.
1989-1990
: Maîtrise de Génétique et Biologie Moléculaire, Université Paris XI-Orsay.
1985
: Bac F7 bis Sciences et Technologie de Laboratoire, Lycée Pierre et Marie Curie, Versailles.
EXPERIENCES PROFESSIONNELLES DANS LE DOMAINE DE LA RECHERCHE
2002-2011: Statutaire ingénieur de recherche IR1 CNRS comme superviseur de la plate-forme bioinformatique
de l’équipe Genexpress de génomique fonctionnelle et biologie systémique pour la santé (CNRS FRE3375)
dirigée par le Dr Charles Auffray. J’assure la direction de l’équipe bioinformatique et assure un rôle
d’interface entre les aspects expérimentaux et informatiques du laboratoire. Je fais office de chef de projet,
aussi bien au niveau du laboratoire que dans des collaborations nationales et internationales. Notamment :
- Biologie systémique
Cette activité s’inscrit dans le cadre des projets du réseau SYSTEMOSCOPE (http://www.systemoscope.net/)
de biologie systémique intégrative qui concerne la physiologie musculaire en relation avec les maladies
pulmonaires et cardiaques (collaboration avec les Prs Christophe PISON et Valdur SAKS, Laboratoire de
Bioénergétique Fondamentale et Appliquée, Inserm U884, Grenoble). Cette activité a précédé la mise en place
de cahier des charges, de suivi et d’orientation du travail dans des projets à l interface de la physique, de la
biologie et de l'informatique dans le cadre de projets européens : IMI U-BIOPRED (Unbiased BIOmarkers in
PREDiction of respiratory disease outcomes http://www.ubiopred.european-lung-foundation.org/) sur l’asthme
sévère et FP7 MeDALL (Mechanisms of the Development of ALLergy , http://medall-fp7.eu/) sur les
mécanismes d'initiation de l'allergie de la petite enfance aux jeunes adulte. Par ailleurs, je participe à la mise en
place d’un prototype expérimental de biophysique visant à appliquer la théorie de la relativité d’échelle à
plusieurs problématiques biologique en collaboration avec le Dr Laurent NOTTALE (LUTH-UMR 8102,
Observatoire de Paris-Meudon). Notamment l'application de la relativité d'échelle en biologie à l'analyse du
chimiotactisme, des maladies pulmonaires et cardiaques, ainsi qu’une réflexion sur le cerveau.
- Génomique fonctionnelle de l’hématopoïèse et des leucémies (Chine)
En collaboration avec les équipes du Professeur Zhu Chen, Institut d’Hématologie, Shanghai, Chine, dans le
cadre du pôle sino-français en génomique et sciences du vivant. Ce projet vise à établir le profil d'expression
des gènes dans les cellules souches et progénitrices du système hématopoïétique, afin d'identifier ceux qui y
sont exprimés préférentiellement ou spécifiquement. La caractérisation fonctionnelle de ces gènes a contribué à
la compréhension des mécanismes de l'hématopoïèse, ainsi qu’à la mise en évidence d’un processus impliquant
la contribution des sels d’arsenic (utilisés en médecine chinoise traditionnelle) pour le traitement des leucémies.
- Consortium H-Invitational (Japon)
Coordinateur: Professeur Takashi Gojobori, Integrated Database Group, Biological Information Research
Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Tokyo, Japon. Ce projet a pour but
de constituer une base internationale d’annotations intégrées du génome, du transcriptome, du protéome et des
pathlogies humaines. Je suis membre du réseau international de collaboration scientifique du Consortium qui
comprend les programmes:
Human Full-length cDNA Annotation Invitational (H-Invitational): Etablir un jeu unique de transcrits
humains issus de collections de clones d’ADNc de haute qualité. Développer une approche supervisée
standardisée d’annotation génomique et fonctionnelle (http://www.h-invitational.jp/).
Human-Anatomical Gene Expression Library (H-ANGEL) : Produire et intégrer des données issues du
transcriptome humain normal collectées sur 7 plates-formes de génomique fonctionnelle différentes et incluant
40 tissus distincts (http://www.jbirc.aist.go.jp/hinv/h-angel/).
Human-Disease-Edition Invitational (H-Invitational DE) : Développer des méthodologies intégratives
de traitement et d’exploitation de données publiques pour l’exploration de pathologies humaines.
- Résistance des tumeurs colorectales à la chimiothérapie
En collaboration avec l’Institut de Biotechnologie et Pharmacologie (CNRS UMR 5094, Montpellier), le Centre
Régional de Lutte contre le Cancer (CRLC, Montpellier), Aventis (Vitry s/Seine).
Ce projet a identifié les gènes ayant un rôle effecteur dans l’émergence de la résistance à un agent anti-tumoral,
la camptothécine ou Irinotecan, dans les cancers colorectaux. Nous avons démontré que des différences
intrinsèques de l’expression de certains gènes sont à l’origine du processus de chimiorésistance spontanée chez
les 50 % des patients ne répondant pas au traitement. Le profil génomique spécifique ainsi défini permet
d’envisager un diagnostic de pré-traitement chimio-thérapeutique.
1997-2002: CDD 5 ans CNRS/Synthélabo/Rhône-Poulenc comme bio-informaticien dans l’équipe Genexpress
de l’Unité de Génétique Moléculaire et Biologie du Développement (CNRS UPR420/ERS1984/FRE2376,
Villejuif) dirigée par le Dr Charles Auffray : Développement de la base de connaissances IMAGE de
Genexpress au niveau de la bioinformatique et de la génomique computationnelle. Le travail de l’équipe
que je dirigeais a consisté à intégrer des résultats de l’exploration des transcriptomes musculaire, cérébraux,
colorectaux, humains et animaux obtenus par hybridation différentielle de réseaux d’ADNc avec les
données de séquence et de cartographie d’ADN. Ceci pour constituer une ressource interrogeable pour la
génomique fonctionnelle de la physiologie et de la pathologie disponible sur un serveur dédié (
http://annotimg.vjf.cnrs.fr/). Cette ressource est ensuite utilisée pour mettre en évidence des cibles
thérapeutique. Notamment :
- Exploration fonctionnelle de protéines impliquées dans le fonctionnement du système musculaire
Caractérisation de gènes exprimés différentiellement dans les muscles de patients atteints de dystrophie
musculaire; caractérisation du profil d’expression de 2.000 gènes dans différents tissus et dans les cellules
satellites musculaires humaines au cours du vieillissement et de la différenciation; caractérisation fonctionnelle
des nouvelles protéines musculaires ainsi mises en évidence.
- Exploration fonctionnelle de protéines impliquées dans le fonctionnement du système nerveux
Mise en évidence et examen approfondi des gènes dont l’expression est spécifique ou restreinte au système
nerveux par l’étude de 10.000 gènes à l’aide de la technologie des macro-réseaux d’ADNc. Caractérisation
d’un gène exprimé spécifiquement dans les oligodendrocytes, et de groupes de quelques dizaines de gènes dont
l’expression est modulée au cours de l’apoptose neuronale. Ceci dans un modèle animal de l’amyotrophie
latérale sclérosante en partenariat avec la société Rhône-Poulenc-Aventis et dans un modèle animal de
l’ischémie cérébrale en partenariat avec la société Synthélabo-Sanofi.
- Génomique fonctionnelle animale
Dans le domaine de la génomique fonctionnelle animale, nous avons participé à l’exploration du répertoire de
gènes bovins dont l’expression est régulée en partenariat avec des équipes de l’INRA pour la recherche
d’indicateurs de la qualité des viandes, la compréhension de la différenciation et du fonctionnement du tissu
mammaire des ruminants laitiers et l’étude de la tremblante naturelle ovine.
1997-1997: Séjour expérimental de 3 mois à l’Institut Pasteur dans le service informatique dirigé par Laurent
Bloch, en collaboration avec l’Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA) :
- Mise à disposition sur le réseau Internet d’un serveur SAMBA (Systolic Accelerator for Molecular Biological
Applications : Blast, Smith and Waterman, développement d’interfaces en HTML et CGI en PERL).
1995-1996: Séjour post-doctoral, Department of Genetic Radiation, Laboratoire du Professeur Leon
Mullenders, Université de Leiden, Pays-Bas :
- Etude de la réparation préférentielle des lésions UV dans les maladies humaines de la réparation de l’ADN
1991-1995: Thèse de doctorat dans le Laboratoire de Génétique Moléculaire (CNRS UPR42, Villejuif) dirigé
par le Pr Alain Sarasin :
- Etude de la réparation des lésions UV dans les maladies humaines de la réparation de l’ADN.
- Recherches des gènes humains impliqués dans la trichothiodystrophie et le xeroderma
- Test biochimique pour l’industrie pharmaceutique.
1990-1991: Stage de DEA, Inserm U129, ICGM, Paris sous la direction du Pr Axel Khan.
- Etude du transcrit des anti-oncogènes au cours du vieillissement cutané.
ORGANISATION DE COLLOQUE
- Membre du Comité local d’organisation des conférences inaugurales du Consortium International
SYSTEMOSCOPE organisées à Paris, France (18-21 juin 2003).
- Membre du Comité d’organisation des Conférences TRANSCRIPTOME 2000 et TRANSCRIPTOME 2005 “From
Functional Genomics to Systems Biology” organisées par le Consortium IMAGE à l’Institut Pasteur, Paris,
France (6-9 novembre 2000) et Shangai, Chine (10-15 novembre 2005). Responsable chargée des relations avec
les intervenants et financiers ainsi que de la mise en place des sessions satellites (10 novembre 2000).
- Organisation d’un congrès de DEA.
ANIMATION SCIENTIFIQUE
- Encadrement d’étudiants en DESS et école d’ingénieur en informatique.
- Tuteur dans la formation d’informatique en biologie enseigné à l’institut Pasteur de Paris.
- Encadrement d’étudiants en thèse.
- Encadrement technologique d’étudiants en BTS de biotechnologie.
- Evaluation de publications.
PARTONARIATS, VALORISATION et TRANSFERT DE TECHNOLOGIE
- Conception et mise en place d’une structure d’ingénierie de projets proposant à des partenaires académiques
(CNRS, Inserm, INRA), associatifs (AFM, Ligue Nationale Contre le Cancer) et industriels (Aventis) des
expertises et solutions technologiques adaptées à leurs programmes en génomique fonctionnelle. Conception de
projets, établissement des cahiers des charges et des budgets prévisionnels, développement des procédures
adaptées.
- Établissement de cahiers des charges et budgets prévisionnels, pour la mise en place de projets dans le cadre
de partenariats.
- Passage d’un prototype expérimental a un produit fini avec la société d informatique Logilab.
PUBLICATIONS (Voir Annexe)
- 27 publications originales dans des revues internationales à comité de lecture (624 citations, h-index=13).
- Communications (séminaires, colloques, congrès), présentations orales, communications affichées.
DIVERS.
Membre de la Société Française de Biologie Théorique.
Vice-président d’une association de cinéma amateur. http://www.lunerouge.org/
Plongée sous-marine, Karaté-do.
Annexe. Liste des publications dans Medline:
1: Bousquet J, Anto J, Auffray C, Akdis M, Cambon-Thomsen A, Keil T, Haahtela T, Lambrecht BN, Postma DS,
Sunyer J, Valenta R, Akdis CA, Annesi-Maesano I, Arno A, Bachert C, Ballester F, Basagana X, Baumgartner U,
Bindslev-Jensen C, Brunekreef B, Carlsen KH, Chatzi L, Crameri R, Eveno E, Forastiere F, Garcia-Aymerich J, Guerra
S, Hammad H, Heinrich J, Hirsch D, Jacquemin B, Kauffmann F, Kerkhof M, Kogevinas M, Koppelman GH, Kowalski
ML, Lau S, Lodrup-Carlsen KC, Lopez-Botet M, Lotvall J, Lupinek C, Maier D, Makela MJ, Martinez FD, Mestres J,
Momas I, Nawijn MC, Neubauer A, Oddie S, Palkonen S, Pin I, Pison C, Rancé F, Reitamo S, Rial-Sebbag E, Salapatas
M, Siroux V, Smagghe D, Torrent M, Toskala E, van Cauwenberge P, van Oosterhout AJ, Varraso R, von Hertzen L,
Wickman M, Wijmenga C, Worm M, Wright J, Zuberbier T. MeDALL (Mechanisms of the Development of ALLergy):
an integrated approach from phenotypes to systems medicine. Allergy. 2011 May;66(5):596-604. doi: 10.1111/j.13989995.2010.02534.x. Epub 2011 Jan 24. Review. PubMed PMID: 21261657.
2: Debily MA, Marhomy SE, Boulanger V, Eveno E, Mariage-Samson R, Camarca A, Auffray C, Piatier-Tonneau D,
Imbeaud S. A functional and regulatory network associated with PIP expression in human breast cancer. PLoS One.
2009;4(3):e4696. Epub 2009 Mar 5. PubMed PMID: 19262752; PubMed Central PMCID: PMC2650800.
3: Genome Information Integration Project And H-Invitational 2, Yamasaki C, Murakami K, Fujii Y, Sato Y, Harada E,
Takeda J, Taniya T, Sakate R, Kikugawa S, Shimada M, Tanino M, Koyanagi KO, Barrero RA, Gough C, Chun HW,
Habara T, Hanaoka H, Hayakawa Y, Hilton PB, Kaneko Y, Kanno M, Kawahara Y, Kawamura T, Matsuya A, Nagata
N, Nishikata K, Noda AO, Nurimoto S, Saichi N, Sakai H, Sanbonmatsu R, Shiba R, Suzuki M, Takabayashi K,
Takahashi A, Tamura T, Tanaka M, Tanaka S, Todokoro F, Yamaguchi K, Yamamoto N, Okido T, Mashima J,
Hashizume A, Jin L, Lee KB, Lin YC, Nozaki A, Sakai K, Tada M, Miyazaki S, Makino T, Ohyanagi H, Osato N,
Tanaka N, Suzuki Y, Ikeo K, Saitou N, Sugawara H, O’Donovan C, Kulikova T, Whitfield E, Halligan B, Shimoyama
M, Twigger S, Yura K, Kimura K, Yasuda T, Nishikawa T, Akiyama Y, Motono C, Mukai Y, Nagasaki H, Suwa M,
Horton P, Kikuno R, Ohara O, Lancet D, Eveno E, Graudens E, Imbeaud S, Debily MA, Hayashizaki Y, Amid C, Han
M, Osanger A, Endo T, Thomas MA, Hirakawa M, Makalowski W, Nakao M, Kim NS, Yoo HS, De Souza SJ, Bonaldo
Mde F, Niimura Y, Kuryshev V, Schupp I, Wiemann S, Bellgard M, Shionyu M, Jia L, Thierry-Mieg D, Thierry-Mieg
J, Wagner L, Zhang Q, Go M, Minoshima S, Ohtsubo M, Hanada K, Tonellato P, Isogai T, Zhang J, Lenhard B, Kim S,
Chen Z, Hinz U, Estreicher A, Nakai K, Makalowska I, Hide W, Tiffin N, Wilming L, Chakraborty R, Soares MB,
Chiusano ML, Suzuki Y, Auffray C, Yamaguchi-Kabata Y, Itoh T, Hishiki T, Fukuchi S, Nishikawa K, Sugano S,
Nomura N, Tateno Y, Imanishi T, Gojobori T. The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation
resource for human genes and transcripts. Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D793-9. Epub 2007 Dec 18.
PubMed PMID: 18089548;
4: Graudens E, Boulanger V, Mollard C, Mariage-Samson R, Barlet X, Grémy G, Couillault C, Lajémi M, PiatierTonneau D, Zaborski P, Eveno E, Auffray C, Imbeaud S. Deciphering cellular states of innate tumor drug responses.
Genome Biol. 2006;7(3):R19. Epub 2006 Mar 15. PubMed PMID: 16542501; PubMed Central PMCID: PMC1557757.
5: Du Y, Wang K, Fang H, Li J, Xiao D, Zheng P, Chen Y, Fan H, Pan X, Zhao C, Zhang Q, Imbeaud S, Graudens E,
Eveno E, Auffray C, Chen S, Chen Z, Zhang J. Coordination of intrinsic, extrinsic, and endoplasmic reticulummediated apoptosis by imatinib mesylate combined with arsenic trioxide in chronic myeloid leukemia. Blood. 2006 Feb
15;107(4):1582-90. Epub 2005 Oct 25. PubMed PMID:16249384.
6: Zheng PZ, Wang KK, Zhang QY, Huang QH, Du YZ, Zhang QH, Xiao DK, Shen SH, Imbeaud S, Eveno E, Zhao
CJ, Chen YL, Fan HY, Waxman S, Auffray C, Jin G, Chen SJ, Chen Z, Zhang J. Systems analysis of transcriptome and
proteome in retinoic acid/arsenic trioxide-induced cell differentiation/apoptosis of promyelocytic leukemia. Proc Natl
Acad Sci U S A. 2005 May 24;102(21):7653-8. Epub 2005 May 13. PubMed PMID: 15894607; PubMed Central
PMCID: PMC1140456.
7: Imbeaud S, Graudens E, Boulanger V, Barlet X, Zaborski P, Eveno E, Mueller O, Schroeder A, Auffray C. Towards
standardization of RNA quality assessment using user-independent classifiers of microcapillary electrophoresis traces.
Nucleic Acids Res. 2005 Mar 30;33(6):e56. PubMed PMID: 15800207; PubMed Central PMCID:
8: Bortoli S, Renault V, Mariage-Samson R, Eveno E, Auffray C, Butler-Browne G, Piétu G. Modifications in the
myogenic program induced by in vivo and in vitro aging. Gene. 2005 Feb 28;347(1):65-72. PubMed PMID: 15716035.
9: Tanino M, Debily MA, Tamura T, Hishiki T, Ogasawara O, Murakawa K, Kawamoto S, Itoh K, Watanabe S, de
Souza SJ, Imbeaud S, Graudens E, Eveno E, Hilton P, Sudo Y, Kelso J, Ikeo K, Imanishi T, Gojobori T, Auffray C,
Hide W, Okubo K. The Human Anatomic Gene Expression Library (H-ANGEL), the H-Inv integrative display of
human gene expression across disparate technologies and platforms. Nucleic Acids Res. 2005 Jan 1;33(Database
issue):D567-72. PubMed PMID: 15608263; PubMed Central PMCID: PMC540058.
10: Imanishi T, Itoh T, Suzuki Y, O’Donovan C, Fukuchi S, Koyanagi KO, Barrero RA, Tamura T, Yamaguchi-Kabata
Y, Tanino M, Yura K, Miyazaki S, Ikeo K, Homma K, Kasprzyk A, Nishikawa T, Hirakawa M, Thierry-Mieg J,
Thierry-Mieg D, Ashurst J, Jia L, Nakao M, Thomas MA, Mulder N, Karavidopoulou Y, Jin L, Kim S, Yasuda T,
Lenhard B, Eveno E, Suzuki Y, Yamasaki C, Takeda J, Gough C, Hilton P, Fujii Y, Sakai H, Tanaka S, Amid C,
Bellgard M, Bonaldo Mde F, Bono H, Bromberg SK, Brookes AJ, Bruford E, Carninci P, Chelala C, Couillault C, de
Souza SJ, Debily MA, Devignes MD, Dubchak I, Endo T, Estreicher A, Eyras E, Fukami-Kobayashi K, Gopinath GR,
Graudens E, Hahn Y, Han M, Han ZG, Hanada K, Hanaoka H, Harada E, Hashimoto K, Hinz U, Hirai M, Hishiki T,
Hopkinson I, Imbeaud S, Inoko H, Kanapin A, Kaneko Y, Kasukawa T, Kelso J, Kersey P, Kikuno R, Kimura K, Korn
B, Kuryshev V, Makalowska I, Makino T, Mano S, Mariage-Samson R, Mashima J, Matsuda H, Mewes HW,
Minoshima S, Nagai K, Nagasaki H, Nagata N, Nigam R, Ogasawara O, Ohara O, Ohtsubo M, Okada N, Okido T, Oota
S, Ota M, Ota T, Otsuki T, Piatier-Tonneau D, Poustka A, Ren SX, Saitou N, Sakai K, Sakamoto S, Sakate R, Schupp I,
Servant F, Sherry S, Shiba R, Shimizu N, Shimoyama M, Simpson AJ, Soares B, Steward C, Suwa M, Suzuki M,
Takahashi A, Tamiya G, Tanaka H, Taylor T, Terwilliger JD, Unneberg P, Veeramachaneni V, Watanabe S, Wilming
L, Yasuda N, Yoo HS, Stodolsky M, Makalowski W, Go M, Nakai K, Takagi T, Kanehisa M, Sakaki Y, Quackenbush
J, Okazaki Y, Hayashizaki Y, Hide W, Chakraborty R, Nishikawa K, Sugawara H, Tateno Y, Chen Z, Oishi M,
Tonellato P, Apweiler R, Okubo K, Wagner L, Wiemann S, Strausberg RL, Isogai T, Auffray C, Nomura N, Gojobori
T, Sugano S. Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones. PLoS Biol. 2004
Jun;2(6):e162. Epub 2004 Apr 20. Erratum in: PLoS Biol. 2004 Jul;2(7):e256.
PubMed PMID: 15103394; PubMed Central PMCID: PMC393292.
11: Riou L, Eveno E, van Hoffen A, van Zeeland AA, Sarasin A, Mullenders LH. Differential repair of the two major
UV-induced photolesions in trichothiodystrophy fibroblasts. Cancer Res. 2004 Feb 1;64(3):889-94. PubMed PMID:
14871817.
12: Bortoli S, Renault V, Eveno E, Auffray C, Butler-Browne G, Piétu G. Gene expression profiling of human satellite
cells during muscular aging using cDNA arrays. Gene. 2003 Dec 4;321:145-54. Erratum in: Gene. 2004 Mar
31;329:205. PubMed PMID: 14637002.
13: Blanchard P, Mahé D, Cariolet R, Truong C, Le Dimna M, Arnauld C, Rose N, Eveno E, Albina E, Madec F, Jestin
A. An ORF2 protein-based ELISA for porcine circovirus type 2 antibodies in post-weaning multisystemic wasting
syndrome. Vet Microbiol. 2003 Jul 17;94(3):183-94. PubMed PMID: 12814886.
14: Chuquet J, Benchenane K, Liot G, Fernández-Monreal M, Toutain J, Blanchet S, Eveno E, Auffray C, Piétu G,
Buisson A, Touzani O, MacKenzie ET, Vivien D. Matching gene expression with hypometabolism after cerebral
ischemia in the nonhuman primate. J Cereb Blood Flow Metab. 2002 Oct;22(10):1165-9. PubMed PMID: 12368653.
15: Decraene C, Brugg B, Ruberg M, Eveno E, Matingou C, Tahi F, Mariani J, Auffray C, Pietu G. Identification of
genes involved in ceramide-dependent neuronal apoptosis using cDNA arrays. Genome Biol. 2002 Jul
31;3(8):RESEARCH0042. Epub 2002 Jul 31. PubMed PMID: 12186649; PubMed Central PMCID: PMC126236.
16: Piétu G, Eveno E, Soury-Segurens B, Fayein NA, Mariage-Samson R, Matingou C, Leroy E, Dechesne C, Krieger
S, Ansorge W, Reguigne-Arnould I, Cox D, Dehejia A, Polymeropoulos MH, Devignes MD, Auffray C. The
genexpress IMAGE knowledge base of the human muscle transcriptome: a resource of structural, functional, and
positional candidate genes for muscle physiology and pathologies. Genome Res. 1999 Dec;9(12):1313-20. PubMed
PMID: 10613854; PubMed Central PMCID: PMC310996.
17: Piétu G, Mariage-Samson R, Fayein NA, Matingou C, Eveno E, Houlgatte R, Decraene C, Vandenbrouck Y, Tahi
F, Devignes MD, Wirkner U, Ansorge W, Cox D, Nagase T, Nomura N, Auffray C. The Genexpress IMAGE
knowledge base of the human brain transcriptome: a prototype integrated resource for functional and computational
genomics. Genome Res. 1999 Feb;9(2):195-209. PubMed PMID: 10022985;PubMed Central PMCID: PMC310711.
18: Zeng L, Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Eveno E, Sarasin A, Mezzina M. Retrovirus-mediated gene transfer
corrects DNA repair defect of xeroderma pigmentosum cells of complementation groups A, B and C. Gene Ther. 1997
Oct;4(10):1077-84. PubMed PMID: 9415314.
19: Stojkovic T, Defebvre L, Quilliet X, Eveno E, Sarasin A, Mezzina M, Destée A. Neurological manifestations in
two related xeroderma pigmentosum group D patients: complications of the late-onset type of the juvenile form. Mov
Disord. 1997 Jul;12(4):616-9. PubMed PMID: 9251090.
20: Weeda G, Eveno E, Donker I, Vermeulen W, Chevallier-Lagente O, Taïeb A, Stary A, Hoeijmakers JH, Mezzina
M, Sarasin A. A mutation in the XPB/ERCC3 DNA repair transcription gene, associated with trichothiodystrophy. Am
J Hum Genet. 1997 Feb;60(2):320-9. PubMed PMID: 9012405; PubMed Central PMCID: PMC1712398.
21: Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Eveno E, Stojkovic T, Destée A, Sarasin A, Mezzina M. Long-term
complementation of DNA repair deficient human primary fibroblasts by retroviral transduction of the XPD gene. Mutat
Res. 1996 Dec 2;364(3):161-9. PubMed PMID: 8960128.
22: Carreau M, Quilliet X, Eveno E, Salvetti A, Danos O, Heard JM, Mezzina M, Sarasin A. Functional retroviral
vector for gene therapy of xeroderma pigmentosum group D patients. Hum Gene Ther. 1995 Oct;6(10):1307-15.
PubMed PMID: 8590735.
23: Eveno E, Bourre F, Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Roza L, Eker AP, Kleijer WJ, Nikaido O, Stefanini M,
Hoeijmakers JH, et al. Different removal of ultraviolet photoproducts in genetically related xeroderma pigmentosum
and trichothiodystrophy diseases. Cancer Res. 1995 Oct 1;55(19):4325-32. PubMed PMID:7671243.
24: Carreau M, Eveno E, Quilliet X, Chevalier-Lagente O, Benoit A, Tanganelli B, Stefanini M, Vermeulen W,
Hoeijmakers JH, Sarasin A, et al. Development of a new easy complementation assay for DNA repair deficient human
syndromes using cloned repair genes. Carcinogenesis. 1995 May;16(5):1003-9. PubMed PMID: 7767957.
25: Eveno E, Quilliet X, Chevallier-Lagente O, Daya-Grosjean L, Stary A, Zeng L, Benoit A, Savini E, Ciarrocchi G,
Kannouche P, et al. Stable SV40-transformation and characterisation of some DNA repair properties of fibroblasts from
a trichothiodystrophy patient. Biochimie. 1995;77(11):906-12. PubMed PMID: 8824772.
26: Mezzina M, Eveno E, Chevallier-Lagente O, Benoit A, Carreau M, Vermeulen W, Hoeijmakers JH, Stefanini M,
Lehmann AR, Weber CA, et al. Correction by the ERCC2 gene of UV sensitivity and repair deficiency phenotype in a
subset of trichothiodystrophy cells. Carcinogenesis. 1994 Aug;15(8):1493-8. PubMed PMID:
8055625.
27: Hugnot JP, Gilgenkrantz H, Chafey P, Lambert M, Eveno E, Kaplan JC, Kahn A. Expression of the dystrophin
gene in cultured fibroblasts. Biochem Biophys Res Commun. 1993 Apr 15;192(1):69-74. PubMed PMID: 8476435.