14th Seminar on Modeling 3 June 2014

14th Seminar on Modeling
3 June 2014
Modélisation du climat à haute résolution sur le
supercalculateur Curie
Sébastien Masson
Researcher at Université Pierre et Marie Curie
La modélisation du climat est devenu l'un des principaux défis techniques et scientifiques du siècle, une
vive polémique ayant surgi sur les questions du changement climatique. Une des limitations les plus
importantes des modèles climatiques, couplant composante océanique et atmosphérique, est la faible
résolution spatiale (~ 100 km) imposée par le coût de calcul. Cette contrainte limite considérablement le
réalisme des processus physiques paramétrés dans les modèles. L'arrivée imminente des machines pétaflopiques en France
offre l'occasion unique d'élaborer de nouveaux modèles climatiques, dans le but de réduire les biais et les incertitudes
récurrentes, dans des simulations climatiques et pour des projections à long terme du changement global.
Notre approche vise à construire une plate-forme de modélisation pour la réalisation de simulations couplées océanatmosphère multi-échelle, en introduisant des modèles dit « zooms » océaniques et atmosphériques à haute résolution, dans
ces deux régions, au sein d'un modèle climatique global. En suivant cette stratégie, nous serons en mesure de représenter les
fines échelles océaniques et atmosphériques des processus dynamiques, et de permettre aux processus régionaux de
rétroagir sur le climat global.
Cette présentation introduira les problème techniques et scientifiques liés à la modélisation du climat en général et à ce
projet en particulier. Nous illustrerons ensuite les premiers résultats obtenus à partir de simulations réalisées sur Curie.
HPC and computational biochemistry
Thomas Simonson
Associate professor at BIOC, Polytechnique
High performance computing has helped raise computational biochemistry to new levels of accuracy and
power, recognized last year by the Nobel prize awarded to Karplus, Levitt, and Warshel: the first Nobel
prize ever to reward simulation work. Ressources like GPUs, volunteer computing
and specialized computers allow protein folding and ligand binding within
simulation timescales. Today's computers also allow us to upgrade our physical models and introduce
very sophisticated treatments of the molecular interactions. Nevertheless, it is still a major challenge
to simulate large cellular machines over realistic timescales. Another challenge is to explore the vast
space of possible protein mutations, in search of new proteins or biocatalysts. We will illustrate some
of these achievements and challlenges, with examples from the literature and our own work.
Applications from our lab include theoretical issues with the calculation of biomolecular
thermodynamics, and volunteer distributed computing for the design of new proteins.
Tuesday, June 3rd 9:30AM (coffee offered, talks at 10AM)
Maison de la Simulation, Digiteo building (565), room 33
Contact: [email protected] - ☎: 01 69 08 59 67
Mailing list: https://groupes.renater.fr/sympa/info/mdls-seminar
http://www.maisondelasimulation.fr/seminar/