ENDNOTE 7 initiation
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ENDNOTE 7 initiation Elisabeth AMBERT IRD Montpellier mars 2004 ENDNOTE 7 - logiciel bibliographique personnel ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ Alimenter ces fichiers de façon manuelle Importer des références issues d ’autres bases Gérer des fichiers de références bibliographiques Faire des recherches dans une base de données EndNote ou dans une base de données distante Exporter des références dans différents formats Editer des bibliographies: Formater et reformater à volonté les références pour les éditer ou les intégrer à des publications. EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 2 Présentation Générale ¾ ¾ ¾ Voir site de la documentation IRD http://www.mpl.ird.fr/documentation : Menu « Aides » section Manuels / Endnote nous y ajoutons régulièrement des informations d ’assistance Adresse directe http://www.mpl.ird.fr/documentation/Faq_Endnote.html Installation à partir du CDROM Si installation réseau : (cas de la salle Formation) copier les répertoires Libraries, Styles, Filters, Connections et Term Lists dans son répertoire de travail personnel. EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 3 Répertoires et fichiers Fichier exécutable (endnote7.exe) sous c:\Program files\Endnote\ par défaut Bibliothèque = Base de données : suffixe en .enl Fichiers de filtres : filter .enf (PC) .hqx (mac) Fichiers de connections : connection.enz (PC) .hqx (mac) Fichiers de styles : style .ens (PC) .hqx (mac) Localisation des répertoires : indiquer le chemin d ’accès aux filtres, styles et fichiers de connexions : Menu Edit, option preferences, Folder Locations EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 4 bases de données de références = Librairies Une base de données peut contenir 32 000 références, chacune assimilée à une fiche Différents types de fiches : 1 type de base (Generic) non modifiable et 25 prédéfinis (journal article, book, thesis …) et modifiables et 3 types à définir (unused) 1 type peut contenir jusqu ’à 40 champs Possibilité de gérer plusieurs bibliothèques (bases de données) simultanément EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 5 Fenêtres EndNote Fenêtre principale : Barre de menu (a changé avec la v.6), Barres d ’outils (Tools / Show toolbar) Fenêtre d ’une base : Barre de titre (nom de la base de données), colonnes d ’affichage des références (une référence par ligne), barre d ’état (réf. affichées, réf. totales), pré-visualisation des fiches : Show/hide (selon un format (style) d ’édition choisi). EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 6 Barre de menu ¾ ¾ File : création/ouverture/fermeture des bibliothèques, importations, exportations Edit : commandes classiques Windows sur les fiches de la librairie : copier/coller, choix des paramètres des polices de caractères (idem barre d ’outils). Sélections, créations de filtres, styles, fichiers de connexion. Preferences : Paramétrages par défaut de EndNote : ouverture d ’une bibliothèque au lancement d ’EndNote, type de référence par défaut, préférences d ’affichage, activation des listes de termes ... EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 7 Barre de Menu ¾ ¾ References : travailler dans une bibliothèque, ajouter, supprimer, rechercher, trier les références Tools : . Connect (z3950) Interrogation de bases distantes . Subject bibliography éditer et imprimer une bibliographie organisée par thèmes (Nouveau v.7) . Terms Lists : Open, define, link : travailler sur les listes d ’autorités auteurs, revues, descripteurs ... Les créer, les supprimer, les mettre à jour, les lier à des champs EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 8 Barre de Menu ¾ Tools : . Show toolbar : Affichage des barres . Manuscript Templates : format de l ’article dans une revue particulière (.dot) . Cwyw = module pour citer les références dans le texte (s ’active si traitement de texte, word par ex., ouvert). ¾ help : outre l ’aide classique, lien sur support technique sur le web, style finder et web support, informations sur les mises à jour EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 9 Barres d’outils ¾ Tools / Show toolbar : Affichage des Raccourcis pour travailler dans les bases : . Main = barre principale de commandes . barre de styles d’écriture (cf Edit de barre Menu) . barre du CwYw (Cite while you write) à partir de endnote 5 (add-in pour endnote 4). Ne s ’affiche que si traîtement de texte ouvert. EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 10 Types de références Masques de saisie ou Reference Types - un masque de base (Generic) non modifiable, 25 types définis personnalisables (Journal article, Book section, Thesis, Conference proceeding, Report, Patent, Figure, Equation …) + 3 types à définir (v.6) - un type de référence peut contenir jusqu ’à 40 champs Modification/Création d ’un masque de saisie - Accès au tableau des types de références par Menu Edit, Preferences, Reference Types - Pour définir par défaut un masque de saisie - Default reference type (en général « Journal article ») EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 11 Modification des types de référence et des champs - Pour ajouter/supprimer/renommer des champs et/ou des types de références : bouton : « Modify reference types ... » - masquer un type à la saisie : taper un point (.) devant son nom (ex : .Artwork), créer un type à partir d ’un type « unused »… - traduire les noms des champs en français, créer un nouveau champ à partir d ’un champ « custom », - Etre Cohérent dans les modifications, elles s’appliqueront à toutes les bases EndNote EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 12 Fonctions de base Créer une base : File>New choisir un répertoire, enregistrer la base : endnote library (*.enl) ouvrir une base : File>Open (ctrl + O) Fermer une base : File>Close Library (ctrl + W) ou cliquer sur la croix en haut à droite de la fenêtre Ajouter un champ dans la fenêtre de visualisation de la base de données : Edit>Preferences>Display Fields puis choisir le(s) champ(s) à afficher EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 13 Gestion des références Sélectionner une référence : cliquer une fois sur sur sa ligne Sélectionner des notices qui se suivent SHIFT+Clic Sélectionner des notices aléatoirement CTRL+Clic Consulter une référence : la sélectionner puis References>Edit (Ctrl+E) ou double clic sursa ligne Prévisualiser une référence : la sélectionner puis cliquer sur Show Preview Sauvegarder une référence : la fermer (clic sur X) ou fermer la base File>save ou (clic sur X) ou (ctrl +S) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 14 Gestion des références Eliminer les doublons : References>Find duplicates puis suppression References>Delete References Supprimer des notices : les sélectionner puis Edit>Clear ou Edit>Cut Copier/coller des notices d ’une base dans une autre. Sélectionner puis Edit>Copy/Edit>Past (CTRL+C) (CTRL+V) ou glisser/déposer avec la souris EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 15 Modification du contenu d ’un champ sur un lot de notices Extraire le sous ensemble contenant les références à modifier (References>Show selected References) Modifier = Rechercher et remplacer le contenu d ’un champ : ATTENTION ces opérations ne peuvent pas être annulée : References>Change and move text>change fields>choisir le champ>choisir l ’opération à effectuer Déplacer le contenu d ’un champ dans un autre champ : References>Change and move text>move fields>choisir les champs EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 16 Commandes de saisie Raccourcis claviers. Clic droit avec la souris Glisser-déposer avec la souris couper/copier/coller (Menu Edit ou ctrl+X/ctrl+C/ctrl+V) dans une notice, d ’une notice à l ’autre, d ’une notice à un traitement de texte ... copier des références d ’une base à une autre : sélectionner les références, copier/coller ou Sélectionner- Glisser-déposer/souris EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 17 Saisie de références Menu References/New Reference (ctrl+N) choisir un « reference type » /ex. Journal Article ¾ Attribution automatique d ’un Record Number à chaque notice (non modifiable) ¾ Champs Author et Editor, un nom par ligne [Entrée], deux écritures possibles : - Nom, Prénom1 Prénom2 ou Nom, P1 P2 ou Nom, P1.P2 ou Nom, P1. P2. Cas part. : Collectivités auteur, - Prénom1 Prénom2 Nom ou P1 P2 Nom ou P1.P2 Nom ou P1. P2. Nom (la liste d ’autorité ne sera pas activée) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 18 Saisie de références ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ Si auteur est une collectivité il faut ajouter une virgule à la fin du nom ex. Ministère de l ’Agriculture, espace ou . entre les initiales des prénoms Si plus de 3 auteurs, les inscrire, EndNote génèrera le et al. automatiquement à l ’édition si prescrit par le style. Si plus de 3 auteurs mais seulement un ou deux connus, les inscrire et mettre « et al. » dans la dernière ligne Si l ’auteur est anonyme, laisser le champ vide Passage au champ suivant [Tab] EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 19 Saisie de références ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ Year (Année) sur 4 caractères ou (sous presse, etc …) Tous les champs Title (titre) : ni point final, ni retour chariot. Mettre les lettres majuscules si nécessaires Journal Name (Titre de revue) : Saisie facilitée par l ’affichage de la liste des titres associée (Term List) en utilisant la combinaison des touches CTRL+1 choisir le titre, insert term (les abréviations doivent être saisies dans le champ Alternate Journal) pages : au choix 524-529 ou 524-9 (formatage géré) Edition : sans mention « ed. » contenu non modifié EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 20 Saisie de références ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ ¾ Keywords : séparateur \ ; / , ou _ entre les mots clés Notes et abstracts : maxi 32000 caractères (8 pages) avec une limite de 64 000 caractères (16 pages) par référence Short title (titre court) Si plusieurs documents sont écrits par le même auteur, cette forme abrégé sera utilisée par certains styles bibliographiques pour différencier les références citées dans le texte. Date (date d ’édition) Reprint edition (Réimpression d ’édition) Reviewed Item (Critique) Titre du document critiqué EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 21 Saisie de références ¾ ¾ ¾ ¾ Call Number (Cote) : pour retrouver le document sur les rayons de la bibliothèque. Label (libellé) : Utilisation variée (cote, date de saisie, citations/ex.) Accession Number : no d ’enregistrement propre à la base de donnée d ’où est extraite la réf. URL : adresse internet ou chemin à lier à un fichier (local ou distant) par Menu References, Link to. Accès direct au fichier par Menu References, Open Link => lancement de l ’application (navigateur, Acrobat, word …) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 22 Saisie de références ¾ ¾ 2 Nouveaux champs EndNote 6. Dans les Types Figure, Chart et Equation : . Image : contient un fichier lié (graphique, ill., …) le fichier lié est copié dans un répertoire portant le nom de la base.DATA un seul fichier attaché par référence Pour lier le fichier : Clic droit souris ou Menu References/Insert Picture ou Object . Caption : contient la légende du fichier lié Dans EndNote 7. Nouveau Type Chart /Table permet d ’insérer des tableaux dans word et d ’en éditer le liste EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 23 Saisie de références - Polices - Par défaut « Plain font » « Plain size » in fine ce sera la police du traitement de texte qui prévaudra. Modifications / ex. noms d ’espèces en italiques, lettres grecques « Symbol », exposants, ... seront conservées. - Si choix de police par Menu Edit/Preferences ou Menu Tools/Show toolbar/Text Style. Police sélectionnée prévaut sur la police utilisée par défaut par le traitement de texte EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 24 Saisie de références - Polices - Caractères spéciaux possibles : Caractères ASCII ou ANSI : Alt + code Copier/coller à partir de la table de caractères Windows (dans Accessoires) - raccourcis claviers (pc ou mac) : ctrl ou pomme b = gras. Ctrl ou Pomme i = italique, etc ... EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 25 Tri des doublons Détection par défaut par comparaison des champs auteur, année, title et ref. type Paramétrable : Edit, preferences, duplicates Commande : Menu References, Find Duplicates Suppression de références : References/Delete references ou Edit/Cut ou Edit/Clear EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 26 Listes de termes Facilitent la saisie, la recherche des données et améliorent la cohérence de la base de données. Pour chaque base de données, 3 listes sont générées automatiquement : authors, journals, keywords liées à des champs. Menu Tools /Open Term list - Mises à jour automatiques : Edit/ Preferences/ Term lists/ update lists during data entry et update lists when importing ... (bien envisager les conséquences cf. Term Lists Journals) - Mises à jour manuelles: Tools/Define Term List/ Create List ou Update List . copier/coller possible EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 27 Listes de termes Création de nouvelles listes de termes: Tools/Define Term List /Create List /Term List Name (jusqu ’à 31 listes par base) Chaque liste doit être liée à (un)des champs et à une(des) base(s) Tools/Link Term List importation de liste : tout fichier texte présentant une liste, un élément par ligne Tools/Open ou Define Term Lists/Import List exporter ou imprimer : Tools/ Open ou Define Term Lists/ Export List /sauvegarder fichier texte (ouvrir dans un traitement de texte par ex.) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 28 listes de termes Suggestion automatique de termes à la saisie : Edit/Preferences/Term Lists cocher Suggest…OK Choix manuel de termes à la saisie : CTRL+1 dans le champ (Affiche la liste liée au champ) /double clic sur le terme ou sélection + bouton « insert term » Particularité des Term Lists Journals permettent la gestion des différentes formes des titres de revues (abréviations) Endnote fournit 3 listes thématiques. D ’autres listes sont récupérables voir Faq_Endnote.html EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 29 Recherche dans une base o o o o o o o o Menu References/Search ouvre une fenêtre de recherche opérateurs booléens : And, Or, Not opérateurs de comparaison sauvegarde/rappel d ’une stratégie de recherche : save search/load search champs interrogés : ceux du type generic Recherche sur tout ou partie de la base. Distinction majuscules/minuscules (match case) recherche sur mots entiers (match words), troncature implicite à droite et à gauche si option non cochée EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 30 Recherche dans une base o o o o o o o Recherche supporte les accents. Penser aux différentes graphies Pas de troncature explicite Annuler une recherche : touche « ESC » Priorité des opérateurs = ordre d ’apparition du haut vers le bas Ex. : (xxx OR yyy) AND zzz Les mots d ’une case sont cherchés comme une expression Recherche d ’un champ vide, utiliser « Is » case vide Utilisation des listes de termes : (affichage) CTRL+1 /(sélection) double clic sur le terme EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 31 Edition : styles - 1 • • • Style bibliographique : Format de présentation de citation dans un texte et de références dans une bibliographie (Choix et présentation des éléments bibliographiques à éditer, style du texte, ponctuation, ordre des citations et des références) Répertoire c:\program files\endnote\Styles (sauf réseau) Styles prédéfinis : 700 styles fournis, mises à jour récupérables sur le site de EndNote http://www.endnote.com/support/ensupport.asp Style identifié par son nom et sa catégorie. Voir Style manager. EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 32 Styles d ’édition - 2 • • • • • Catégorie Generic : 5 formats d ’édition standard proposés Styles de revues : fichier de définition d ’un format de citation de références bibliographiques, chaque style est un fichier dont le nom se réfère à la revue ou à l’éditeur qui a défini le format bibliographique Show preview : visualiser une référence dans le style choisi Recherche d ’un style File, Open Style Manager, Find Edition d ’un style File, open Style Manager, Edit EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 33 Styles d ’édition - 3 • • • • Création d ’un nouveau style File, Output Styles, New Style copie d ’un style existant File, save as , lui donner un nom, pour le modifier Formatage selon des Règles d ’écriture, police, formatage auteur, titre, revue, tri, caractères spéciaux … exemples des Styles imposés par les revues. Utilisation avec le Module extérieur de Endnote « Cite While You Write » (cwyw) word 97 ou 2000 = évolution de Menu Add-in depuis word 95 EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 34 Exportation/impression de Références Sélectionner les références 1) les Visualiser, Menu References/Show selected (fenêtre de visualisation) 2) Trier les références, Menu References/Sort References, 3) Sélectionner un format d ’édition, Menu Edit/Output Styles (ou barre d ’Outils) 4) Exporter le fichier en .txt, .rtf ou .htm : Menu File/Export ou 4) Imprimer directement les références : Menu File/Print Les références sont triées selon l ’ordre de tri de la base EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 35 Impression de bibliographie seule Sélectionner les références à formater, 1) les visualiser 2) sélectionner le format d ’édition : Menu Edit/Output Style ou directement sur Barre d ’outils. 3 ) Création d ’un fichier : Menu Edit/Copy Formated (press papier) 4) Sous traitement de texte insertion à l ’endroit voulu Ctrl+V Les références sont triées et formatées selon le Style choisi EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 36 Bibliographie par thèmes Nouveauté EndNote 7 : Menu Tools "Subject Bibliography" permet de créer des bibliographies organisées par thèmes, mais également de générer automatiquement des listes de lecture et des curriculum vitae … 1) Sélectionner les références à prendre en compte 2) Choisir le(s) champs 3) Choisir les termes utiles cliquer sur OK : le fichier est constitué vous pouvez alors choisir un style d ’édition et imprimer EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 37 Importer des références issues d ’une base de données : A - Filtres Transfert d ’un autre système vers EndNote : Pour que les données soient transférables il faut un fichier structuré. Transfert à l ’aide de Filtres fournis avec le logiciel EndNote. Les fichiers filtres sont classés dans le répertoire Filters, accès par menu Edit / Import Filter/ Filters Manager. Les filtres sont classés dans des catégories, chaque filtre est un fichier dont le nom précise le couple : base source (distributeur) /ex : CAB Abstract (SP) (Sauf les filtres de la catégorie Generic) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 38 Transferts : Filtres ¾ ¾ ¾ ¾ Sélection d ’un filtre : Menu Edit, import filters, choix Open Filter Manager, sélectionner en cochant vos filtres favoris Edition : Menu Edit, Import Filters, Open Manager, Edit travail sur templates, reference types … par templates on a une table de correspondance entre les champs de la base source et les champs de la base EndNote par type de documents. Importation : menu File, Import choisir le fichier à importer et le filtre correspondant (Voir site Webdoc IRD : Faq EndNote) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 39 Transferts : Filtres A-) Transfert de références issues d ’une autre base EndNote : - Filtre Generic EndNote Import (balisage par étiquette TAG (%A %B …) sauvegarde par Menu Save, Save a copy - ou Utilisation du copier/coller et du glisser/déposer - ou Déplacement de base .enl dans répertoires Compatibilité entre toutes les versions de EndNote B-) Transfert dans EndNote d ’une bibliographie sous traitement de texte : copier/coller ou utilisation du filtre Generic Endnote Import (après balisage des références par une étiquette (TAG) au début de chaque champ) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 40 Transferts : Filtres C-) Transferts de références issues de bases de données commerciales (CAB, CC...) ou gratuites (cas de Pubmed) ¾ Exemple des CAB Abstracts (SP) = via Webspirs ¾ Exemple de Pubmed (nouveau filtre voir FAQ sur le site de la doc IRD Webdoc http://www.mpl.ird.fr/documentation/Faq_Endnote D-) Transfert de références issues d ’un autre logiciel de gestion de bibliographies exemple référence Manager : http://www.mpl.ird.fr/documentation/Faq_Endnote.html Modifications, créations de filtres possibles EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 41 B - Transferts : télédéchargement. Connexion norme z3950 ¾ ¾ ¾ Fichiers de connexion : fichier permettant à partir de EndNote la connexion à une base de données utilisant le protocole z3950 et le déchargement direct de notices dans une bibliothèque Endnote. A chaque base de données (payante ou gratuite) correspond un fichier de connexion contenant tous les paramétrages nécessaires. Répertoire de fichiers de connexions Connections c:\program files\endnote\Connections (sauf install reseau) EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 42 Interrogation de bases distantes avec EndNote o o connexion : Menu Tools/ Connect, commande connect ou clic direct sur liste favoris. Une fois la connexion établie ouverture d ’une fenêtre de recherche EndNote dans la base distante. Exemples Pubmed (gratuit) , CC / CAB / Francis (mot de passe nécessaire. Abonnement Payant voir FAQ_Endnote) Les références sont affichées dans une nouvelle fenêtre « connected to : nom de la base de données ». Marquer les références pertinentes et les Sauvegarder « copy references to » choisir/créer une base de données. EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 43 Interrogation de bases distantes avec EndNote o o o Toujours vérifier que les contenus des notices sont bien dans les bons champs (en général plus grande fidélité qu ’avec un filtre) Procédure plus rapide que le passage par les filtres mais moins souple à l ’interrogation pour des questions complexes (voir diapos nos 42-44 : « recherche dans une base ») Sauvegarder de l ’équation de recherche (en local) nom_fichier.enq Demande de mot de passe pour un accès direct aux abonnements de l ’IRD (CC, CAB Abstracts, Francis et Georef) + Engagement de Confidentialité à signer voir : http://www.mpl.ird.fr/documentation/prive/endnotez3950.html EndNote 7 initiation E.Ambert - IRD Montpellier mars 2004 44