Curriculum Vitae

Curriculum Vitae
INFORMATIONS GENERALES
Nom et prénom : Ahmed ELBAKKALI
Né le : 02/03/1980 à Salé - Maroc
Nationalité : Marocaine
Recrutée à l'Institut National de la Recherche Agronomique, Novembre 2006
Affectée au : Centre Régional de la Recherche Agronomique, Meknès. UR: Amélioration des Plantes et
Conservation des Ressources Phytogénétiques.
Grade : Chargé de Recherche grade C
Fonction : Chercheur en amélioration génétique des plantes et Biotechnologie
E-mail : [email protected]
CHAMPS DE COMPETENCES
● Domaines d’intérêt : Marquage moléculaire, génétique des populations, génétique quantitative, agronomie,
cartographie génétique, amélioration génétique des plants, conservation des ressources génétiques,
Bioinformatique, culture in vitro, Histologie
● Techniques de laboratoire : extraction d’ADN, génotypage (SSR, ISSR, AFLP, SNP,…), embryogenèse
somatique, coupes histologiques, colorations des tissus
● Langues :
- Arabe : Langue maternelle
- Français : lu, écrit et parlé correctement
- Anglais : lu, écrit et parlé moyennement.
● Logiciels professionnels :
- Statistique: R, SAS, SPSS, PAST, STATISTICA
- Génétique: Ntsys-pc, Arbequin, Genepop, Darwin, Genetix, MStools, Phylip, GenAlEx, Spagdi, Tassel, Structure,
Distruct, Powercore, Cervus, GeneMapper, Mstrat, CoreHunter
- Géométrie morphométrie: Geometrica, TPS series, Benoit, Shape
DIPLOMES
2014 : Doctorat (Ph.D.), Sciences Biologiques Appliquées. Université de Gand, Belgique.
2004 : Diplôme d’Ingénieur d’Etat en Agronomie, spécialité : Sciences et Techniques en Productions Fruitières
(STPF), Ecole Nationale d’Agriculture de Meknès, Maroc.
1998 : Baccalauréat en sciences expérimentales, Salé, Maroc.
STAGES ET EXPERIENCES
2009 : Stage au Laboratoire du marquage moléculaire de l’INRA de Montpellier, Analyse moléculaire des
échantillons d’olivier (Olea europaea L.) prospectés. Durée : un mois, Projet PRAD 08/01.
2008 : Stage aux Laboratoire de Biotechnologie des microorganismes de l’ISA – Lille et Laboratoire MycologiePhytopathologie-Environnement (LMPE), Université du Littoral Côte d’Opale (Calais), Utilisation des techniques
biotechnologiques pour caractériser les populations marocaines de Septoria tritici . Durée : un mois, Projet PRAD
08/06.
2008 : Workshop « Wheat Breeding and Biotechnology », organisé par INRA-ICARDA-CIMMYT, 5-12 Mai 2008,
Rabat, Maroc.
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2007 : Formation au laboratoire de marquage moléculaire, Unité de Biotechnologie, étude de la variabilité chez
l’olivier (Olea europaea L.) au Maroc, juillet- Août 2007, Rabat, Maroc,
2007 : Cours de courte durée en Bioinformatique (Basics Genome Informatics), Faculté des Sciences de Rabat,
Maroc, 2-6 avril 2007.
2006 : Stage au Laboratoire de biologie cellulaire de l’équipe AFEF de l’INRA de Montpellier et à la plate-forme
d’imagerie cellulaire CIRAD : Mise en place une propagation conforme de l’olivier (Olea europaea L.) par
l’embryogenèse somatique et conformité génétique des embryons somatiques obtenus, France, Montpellier,
Durée : 6 mois, Projet PRAD 05/08.
2006 : Stage aux laboratoires de culture in vitro et d’histochimie à l’Ecole Nationale d’Agriculture de Meknès,
Maroc, Etude des conditions optimales d’embryogenèse somatique chez l’olivier (Olea europaea L.), Durée : 4
mois.
2005 : Stage au Laboratoire de biologie cellulaire de l’équipe AFEF de l’INRA de Montpellier et à la plate-forme
d’imagerie cellulaire CIRAD : Mise au point d’un protocole expérimental de multiplication conforme par
l’embryogenèse somatique chez l’olivier (Olea europaea L.) ; approche histochimique, Montpellier-France, Durée :
4mois, Projet PRAD 05/08.
2005 : Stage au laboratoire de culture in vitro à l’Ecole Nationale d’Agriculture de Meknès, Etude de la
callogénése chez l’olivier (Olea europaea L.) en vue de l’obtention d’embryons somatiques, Durée : 3mois.
2004 : Stage au laboratoire de transformation génétique à l’unité de Recherche de Biotechnologie au Centre
Régional de Recherche Agronomique de Rabat, INRA Maroc, Apprentissage des techniques de transformation
génétique, de régénération des plantes, extraction et tests d’analyse d’ADN Durée : 2 mois.
PUBLICATIONS
El Bakkali, A. 2013. Etude de la diversité génétique et construction de core collections en vue de la génétique
d’association chez l’olivier (Olea europaea L.). Thèse de doctorat. Faculté de Bio-ingénierie, Université de Gand,
Belgique. ISBN: 978-90-5989-678-9.
El Bakkali A., Essalouh L., Santoni S., Lochon-Menseau S., Van Damme P., Costes E.,Khadari B. 2013. How olive
domestication and diversification history can facilitate selection of plant material suitable for association mapping
studies: the case of French germplasm. Tree Genetics and Genomes (soumis).
Besnard G., El Bakkali A. 2014. Sequence analysis of single-sopy genes in two wild olive subspecies (Olea
europaea L.): nucleotide diversity and potential use for testing admixture. Genome (accepté).
Mamouni A., El Bakkali A., Lambert P, Krichen L., Oukabli A., Audergon J.M., El Modafar C., Khadari B. 2013.
Evolution of seed-propagated apricot populations in the Moroccan oasis agro-ecosystems under bottleneck and
gene flow effects. Plant Genetic Resources (accepté).
Khadari B., El Bakkali A., Zine El Aabidine A., Essalouh L., Contreras S., Ben Sadok I., Moukhli A., Costes E.
2013. How Can We Efficiently Characterize Genes of Agronomic Interest in Olive: Towards the Genetic Association
Studies? Acta Horticulturae (accepté).
Besnard G., El Bakkali A., Haouane H., Baali-Cherif D., Moukhli A., Khadari B. 2013. Population genetics of
Mediterranean and Saharan olives: geographic patterns of differentiation and evidence for early generations of
admixture. Annals of Botany. doi: 10.1093/aob/mct196.
El Bakkali A., Haouane H., Moukhli A., Van Damme P., Costes E., Khadari B. 2013. Construction of core
collections suitable for association mapping to optimize use of Mediterranean olive (Olea europaea L.) genetic
resources. Plos One 8(5): e61265. doi:10.1371/journal.pone.0061265.
El Bakkali A., Haouane H., Van Damme P. 2013. Khadari B. Testing different approaches to construct olive (Olea
europaea L.) core subset suitable for association genetic studies. 2013. Acta Horticulturae 976.
ElBakkali A., Haouane H, Hadidou A., Oukabli A., Santoni S., Udupa S.M., Van Damme P., Khadari B. 2013.
Genetic diversity of on-farm selected olive trees in Moroccan traditional olive orchards. Plant Genetic Resources
11(02): pp 97-105. doi. http://dx.doi.org/10.1017/S1479262112000445.
Besnard G., Khadari B., Navascue´s M., Fernandez-Mazuecos M., El Bakkali A., Arrigo N., Baali-Cherif D.,
Brunini-Bronzini de Caraffa V., Santoni S, Vargas P., Savolainen V. 2013. The complex history of the olive tree:
from Late Quaternary diversification of Mediterranean lineages to primary domestication in the northern Levant.
Proceedings of the Royal Society B 280 (1756): 20122833. http://dx.doi.org/10.1098/rspb.2012.2833
Hicham H., ElBakkali A., Moukhli A., Tollon Ch., Santoni S., Oukabli A., El Modafar Ch., Khadari B., Genetic
structure and core collection of the World Olive Germplasm Bank of Marrakech: towards the optimised
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management and use of Mediterranean olive genetic resources. 2011. Genetica 139(9):1083-94. doi:
10.1007/s10709-011-9608-7.
Mazri M.A., Elbakkali A., Belkoura M., Belkoura I Embryogenic competence of calli and embryos regeneration
from various explants of Dahbia cv, a Moroccan olive tree (Olea europaea L.). 2011. African Journal of
Biotechnology 10(82).
COMMUNICATIONS
Khadari B., El Bakkali A., Zine El Aabidine A., Essalouh L., Contreras S., Ben Sadok I., Moukhli A., Costes E.
2012. How can we efficiently characterize genes of agronomic interest in Olive: Developing genetic association
studies? VII International Symposium on Olive Growing. San Juan-Argentina, 25-29 Septembre 2012.
ElBakkali A., Haouane H, Van Damme P., Khadari B., Testing different approaches to construct olive (Olea
europaea L.) core subset suitable for association genetic studies, XIII Eucarpia Symposium on Fruit Breeding and
Genetics. Warsaw-Poland, 11-15 Septembre 2011.
Haouane H., El Bakkali A., Moukhli A., Oukabli A., Santoni S., El Modafar C., Khadari B. 2011. Structure de la
diversité génétique des variétés méditerranéennes d’olivier et construction d’une collection de référence en vue de
la conservation des ressources génétiques et de l’amélioration génétique, Actes du 3éme Congrès international sur
l’Amélioration de la Production Agricole, Settat-Maroc 2011.
Haouane H., ElBakkali A., Moukhli A., Oukabli A., Santoni S., El Modafar C et Khadari B., Origins and
domestication process of olive, Olea europaea L., in south west Mediterranean area: a study of gentic relationships
between Moroccan and Mediterranean olive, OliveBioteq 2009 international seminar, Sfax-Tunisia, 15-19
Décembre 2009.
PARTICIPATION A DES PROJETS
PRAD 08/01 (2008-2010) : Nouvelles approches méthodologiques de la caractérisation et de l'évaluation des
ressources génétiques chez l'olivier au Maroc: pour une valorisation d'un matériel végétal local à fort potentiel
adaptatif.
PRAD 08/06 (2008-2010) : Utilisation des techniques classiques et biotechnologiques pour caractériser les
populations marocaines de Septoria tritici et recherche de sources de résistance.
PRAD 190/89 (2008-2010) : Exploitation des ressources génétiques arboricoles locales : cas du poirier de la
Mâamoura (Pyrus mamorunsis) pour la sélection de porte greffe de rosacées à pépins.
PROFERD (2009-2011) : Sélection de génotypes locaux d’olivier (Olea europaea L.) pour les principales zones
agro-écologiques dans le système de culture pluviale.
PROFERD (2007-2009) : Amélioration de la productivité de la culture de l’amandier par la mise au point de
technologies appropriées aux maillons faibles de la filière (carte variétale, réhabilitation, organisation
professionnelle).
PRAD 05/08 (2006-2008) : Recherche sur l’embryogenèse somatique chez l’olivier (Olea europaea L.) : culture de
différents tissus et approche histologique.
FINANCEMENTS
Bourse de Mérite pour les sciences et la technologie de la Banque Islamique de Développement (BID), 20102013.
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