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Cv - Sophia Antipolis - Méditerranée
Valérie Lemesle 69, avenue Franklin Roosevelt 06 110 Le Cannet Née le 25/09/76 (28ans) Nationalité Française Tél. : 06 81 53 80 96 [email protected] DOCTEUR EN MATHÉMATIQUES Formation 2000–2004 1999–2000 1997–1999 Doctorat en Mathématiques–Université de Nice (Soutenance le 27/02/04) “Modélisation mathématique structurée de la croissance cellulaire en chemostat.” Institut National en Automatique et Informatique (INRIA), Sophia Antipolis. ,→ Mention Très Honorable DEA Systèmes Dynamiques et Turbulence Institut Non Linéaire de Nice (INLN). ,→ Mention Bien Licence et Maı̂trise de Mathématiques Pures Université de Nice. Expériences 2004 2000– 2004 2000 1999 Stage Postdoctoral. Étude de modèles de croissance cellulaire de phytoplancton. INRIA, Sophia Antipolis–Laboratoire d’Océanologie Villefranche sur Mer. Projet de thèse. Construction de modèles compartimentaux basés sur la mise en évidence de phénomènes biologiques caractéristiques. Analyse mathématique de ces modèles: étude du comportement asymptotique et des bifurcations éventuelles. Estimation des variables mesurées en utilisant celles qui le sont et la connaissance du modèle. ,→ EDO non linéaires. Dynamique des populations. Théorie de Lyapounov. Systèmes compétitifs. Critère de Bendixson. Théorème de Poincaré-Bendixson. Systèmes Lent-Rapide. Observateurs non linéaires. Estimateurs hybrides utilisant la connaissance partielle du modèle. Simulations et calculs sous Matlab et Maple. INRIA Sophia Antipolis. Stage DEA (4 mois). Construction d’observateurs et d’estimateurs pour les systèmes non linéaires. Application aux bioréacteurs. ,→ Étude bibliographique et développement théorique : observation et observateurs non linéaires. Estimateurs hybrides de dimension 1. Simulations et calculs sous Matlab. INRIA Sophia Antipolis. Stage de Maı̂trise (3 mois). Cinétique chimique et systèmes dynamiques. ,→ Modélisation en EDO et EDP de cinétique chimique. Étude du comportement asymptotique et existence de solution. Caractérisation de l’attracteur par la variété instable de ces points stationnaires. Laboratoire J-A. Dieudonné–Université de Nice. Enseignements 2000-2004 1998-2000 Enseignant vacataire Cours de Mathématiques (104h), d’Analyse et d’Analyse–Probabilités (78h) en DEUG. ,→ Soit 182h de TD enseignées. Laboratoire J-A. Dieudonné–Université de Nice. Tuteur en Mathématiques Soutien hebdomadaire aux étudiants de 1ère année de DEUG. Université de Nice. Divers Anglais: Opérationnel. Espagnol: À réactiver. Informatique: Matlab, Maple, LaTex. PUBLICATIONS Publications dans des revues internationales avec comité de lecture – V. Lemesle and J-L. Gouzé. A biochemically based structured model for phytoplankton growth in the chemostat. Ecological Complexity. (In press). – V. Lemesle and J-L. Gouzé. An hybrid bounded error observer for uncertain bioreactor models. Bioprocess and Biosystems Engineering. (In press). – V. Lemesle and J-L. Gouzé. Structured cell growth models in a chemostat. Mathematical Modelling and Computing in Biology and Medicine, MIRIAM 1,p. 186-192, 2003. Contributions à des conférences internationales avec comité de lecture – V. Lemesle and J-L. Gouzé. Growth models for cells in the chemostat. Mathematical Theory of Networks and Systems (MTNS 04), Louvain La Neuve, Belgium. July 2004. – V. Lemesle and J-L. Gouzé. A two dimensional bounded error observer for a class of bioreactor models. European Conference on Control(ECC 03), Cambridge, UK. September 2003. – V. Lemesle and J-L. Gouzé. A structured model of phytoplankton growth in the chemostat. International Conference on Mathematical Ecology (ALCALA 03), Alcala de Henares, Spain. September 2003. – V. Lemesle and J-L. Gouzé. Structured cell growth models in a chemostat. Conference on Applied Mathematics and Applications of Mathematics (AMAM), Nice, France. February 2003. – V. Lemesle and J-L. Gouzé. Structured cell growth models in a chemostat. European Conference on Mathematical and Theoretical biology (ECMTB 02), Milan, Italy. July 2002. – J. L. Gouzé and V. Lemesle. A bounded error observer for a class of bioreactor models. European Conference on Control (ECC 01) Porto, Portugal. September 2001. – V. Lemesle and J-L. Gouzé. A bounded error observer for a class of bioreactor models. 8th International Conference on Computer Applications in Biotechnology (CAB8), Québec, Canada. June 2001. Autres publications – V. Lemesle. Modélisation mathématique structurée de la croissance cellulaire en chemostat: analyse et estimation. Thèse de l’Unversité de Nice-Sophia Antipolis, 2004. Travail en préparation – V. Lemesle. A cyclic structured cell growth model. En préparation. – V. Lemesle. Observability and classical observers for a size structured ODE model of the chemostat. En préparation. THÈSE Résumé L’objet de cette thèse est la formulation, l’étude de modèles structurés de croissance cellulaire dans un chemostat, appareil de culture de micro-organismes en laboratoire, et l’estimation de certaines variables d’état pour ces modèles. Après de bref rappels sur la biologie des espèces considérées et la présentation du dispositif expérimental, nous introduirons les modèles classiques utilisés pour décrire le chemostat ainsi que les modèles structurés prenant en compte la division cellulaire notamment. Nous construirons et étudierons alors deux modèles en équations différentielles ordinaires de dimension 3 mettant en valeur la croissance et la division d’une cellule. Pour l’un d’entre eux, un comportement oscillatoire est observé. En effet, des expériences ont montré la possibilité de telles oscillations; dans la littérature (Nisbet et al., Pascual et al.), les modèles existants permettant d’obtenir de tels phénomènes étaient donnés en utilisant des EDP. Ici, c’est avec un formalisme mathématique assez simple (en EDO) que nous avons pu obtenir ces oscillations. Pour obtenir un modèle plus descriptif, un modèle basé sur des réactions biochimiques décrivant le stockage d’une cellule est alors construit. Une comparaison avec le modèle classique (Droop) basé uniquement sur l’expérience montre que les deux modèles sont équivalents. En ayant une approche mécaniste donc descriptive des phénomènes biologiques mis en jeu, on retrouve un modèle empirique basé sur des données expérimentales uniquement. La deuxième partie de cette thèse concerne l’estimation de certaines variables d’état. Ainsi, les notions d’observabilité et d’observateur seront introduites. Des observateurs classiques seront construits pour les modèles de croissance décrits dans la première partie. Enfin, comme en biologie les modèles sont souvent mal connus, nous construirons des estimateurs hybrides, donnant les variables d’états non mesurables en utilisant les variables mesurées et la connaissance partielle du modèle. Mots-clés : dynamique des populations, cycle cellulaire, chemostat, modèles structurés, observateurs, modèles mal connus, estimateur hybride. Jury de Thèse Soutenue le 27 février 2004 devant le jury international composé de: – M. P. BERNHARD. Professeur à l’Université de Nice. Examinateur (CNU 61). – M. J-L. GOUZÉ. Directeur de Recherche INRIA Sophia Antipolis. Directeur de thèse. – M. F. HOULLIER. Directeur de Recherche INRA Montpellier. Examinateur. – M. M. LANGLAIS. Professeur à l’Université de Bordeaux 2. Rapporteur (CNU 26). – M. J-C. POGGIALE. Maı̂tre de Conférence COM Marseille. Rapporteur (CNU 67). – M. S. RINALDI. Professeur au Politecnico di Milano. Président du jury. ,→ Mention Très Honorable (Mention la plus haute existante)
