pour guérir les maladies génétiques
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pour guérir les maladies génétiques
Imagine, pour guérir les maladies génétiques RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Sommaire 2 ÉDITOS Le mot du Président............................................................................................................................................................... 2 Le mot du Directeur............................................................................................................................................................... 3 IMAGINE EN QUELQUES LIGNES .................................................................................................................. 4 4 missions ................................................................................................................................................................................................. 5 Chiffres clés ..........................................................................................................................................................................................6 8 NOS AVANCÉES 2013 Synthèse des faits marquants par mission ............................................................................10 RECHERCHE ET SOINS INNOVANTS .................................................................................................. 11 Tableau de synthèse des publications ........................................................................................... 12 Exemples de publications ...................................................................................................................................... 12 Création de synergies .................................................................................................................................................... 15 Prix et récompenses ......................................................................................................................................................... 16 Avancées en recherche clinique .............................................................................................................. 18 ENSEIGNEMENT .........................................................................................................................................................................20 Les programmes de soutien aux jeunes talents ........................................................ 20 Un nouveau centre de séminaires ........................................................................................................ 21 VALORISATION ............................................................................................................................................................................. 22 26 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS DÉVELOPPEMENT DES PLATEFORMES TECHNOLOGIQUES ............................................................................................................................................................ 29 RENFORCEMENT DU PERSONNEL ...................................................................................................... 42 ANIMATION ET RAYONNEMENT SCIENTIFIQUES ................................................. 43 "Nos enfants c’est notre éternité" NOUVEAU BÂTIMENT : UN CHANTIER ABOUTI DANS LES DÉLAIS ET LE BUDGET ........................................................................... 43 46 NOTRE GOUVERNANCE NOS INSTANCES : FAITS MARQUANTS 2013 ...................................................................49 NOS FINANCES .............................................................................................................................................................................. 51 BILAN SOCIAL ................................................................................................................................................................................. 55 COMMUNICATION ET LEVÉE DE FONDS ................................................................................ 58 64 NOS PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES ROBERT DEBRÉ Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 1 ÉDITO Le mot du Président Le mot du Directeur « NOTRE RÊVE DE VOIR ENFIN RÉUNIS EN UN MÊME LIEU, LE MEILLEUR DE LA RECHERCHE ET LE MEILLEUR DE LA MÉDECINE, DEVIENT RÉALITÉ. » En 2013, Imagine a franchi de nouvelles étapes décisives. Avec la remise des clés de l’Institut, le 3 décembre, notre projet se concrétise. Il aura fallu cinq ans pour le concevoir, vingt-six mois pour le construire. L’Institut a des décennies devant lui, bourré d’espoirs autant que de futurs succès. L’institut des Maladies Génétiques, lieu unique à la pointe de la recherche et des soins innovants, est enfin prêt à ouvrir ses portes et à accueillir les chercheurs et les patients. Notre rêve de voir enfin réunis en un même lieu, le meilleur de la recherche et le meilleur de la médecine, devient réalité, pour, ensemble, guérir les maladies génétiques. Cette année encore, de nombreux soutiens ont permis à Imagine d’avancer plus vite, d’aller plus loin. Notre plus important mécène, la Fondation Bettencourt Schueller, a financé la Chaire pour la Biologie du Développement et l’aménagement du centre de séminaires, lieu de propagation des savoirs. Le partenariat avec la maison Hermès et l’édition spéciale d’un carré Hermès Imagine ont permis, non seulement de récolter des fonds pour la recherche, mais aussi d’offrir une grande visibilité à Imagine. Par ailleurs, le Comité du Faubourg Saint Honoré a souhaité reconduire la tombola de Noël, avec notre parrain Teddy Riner. Nous pouvons également mentionner nos nouveaux partenaires, le LYCEUM Club international et le Rotary Club de Paris. Imagine est fier de pouvoir compter sur autant de soutiens de qualité avec qui nous partageons des valeurs communes d’excellence, d’innovation et de créativité, au service des enfants. Pr. Claude Griscelli Président 2 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 « LA QUALITÉ DES RÉSULTATS A ÉTÉ SOULIGNÉE LORS DE LA VISITE DES EXPERTS DE L’AGENCE D’EVALUATION DE LA RECHERCHE ET DE L’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR. » A l’heure d’écrire ce mot d’introduction au rapport 2013 de l’Institut, nous avons rejoint notre nouveau bâtiment. Grâce au dévouement de notre équipe administrative sous la férule efficace de Karine Rossignol et Guillaume Huart, grâce à l’implication de beaucoup de personnes « Imagine » en particulier Corinne Antignac, les équipes sont au travail et dans de très bonnes conditions. Beaucoup reste à faire pour optimiser notre fonctionnement mais l’essentiel est acquis. Le rêve formulé il y a plus de 10 ans est devenu réalité. Les équipes d’Imagine n’ont pas chômé en 2013, la liste des publications ci-jointe, les résultats acquis sont remarquables, résultats dont la qualité a été soulignée lors de la visite des experts de l’Agence d’Evaluation de la Recherche et de l’Enseignement Supérieur (AERES) au printemps 2013. Nous continuerons à nous renforcer en 2014-2015 par l’accueil de nouveaux groupes conformément au plan initialement prévu. Les résultats de l’appel à candidatures seront connus fin octobre 2014. Ce sera aussi le moment de célébrer l’ouverture d’Imagine par l’organisation d’un séminaire, le 20 octobre, où plusieurs des membres éminents de notre Conseil scientifique international (SAB) exposeront leurs travaux. C’est aussi l’occasion de saluer les nouveaux membres du SAB qui nous ont rejoint : Fiona Powrie (Université d’Oxford), Denis Duboule (Université de Genève) et Anthony Monaco (Président de la Tufts University) et de remercier aussi ceux qui le quittent : Eric Olson et Emil Unanue. Formulons le vœu que 2014, année 1 intramuros, soit à la hauteur de nos aspirations pour la qualité de nos travaux menés au sein des laboratoires et des entités de recherche clinique et que chacun des Imagine y trouve son épanouissement. Pr. Alain Fischer Directeur Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 3 Imagine en quelques lignes PREMIER PÔLE EUROPÉEN DE RECHERCHE, DE SOIN ET D’ENSEIGNEMENT SUR LES MALADIES GÉNÉTIQUES, L’INSTITUT IMAGINE A POUR MISSION DE LES COMPRENDRE ET LES GUÉRIR. 35 millions de personnes en Europe sont atteintes de maladies génétiques, dont 3 millions en France où l’on recense chaque année 30 000 nouveaux cas. Au-delà de ces chiffres, ce sont des familles entières qui sont touchées : les maladies génétiques sont souvent handicapantes, elles engagent parfois le pronostic vital. On ne sait pas toujours les nommer, ni les soigner. 60% des enfants qui sortent de consultation en génétique repartent sans diagnostic. Le défi est double : diagnostiquer puis guérir. C’est la raison d’être de l’Institut des maladies génétiques Imagine, qui réunit en ses murs 850 médecins, chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels de santé autour de cette cause commune, et accueillera chaque année 20 000 enfants en consultation au rez-de-chaussée du nouveau bâtiment. QUATRE MISSIONS 1 Soutenir et développer la recherche, au service des patients Pour pouvoir prétendre guérir une maladie génétique, il faut d’abord pouvoir identifier les gènes responsables, caractériser leurs mutations et comprendre les perturbations qu’elles génèrent dans les systèmes biologiques essentiels. Ces trois étapes sont primordiales dans l’approche de la maladie. Aussi, Imagine accueille des équipes mixtes Inserm / Université Paris Descartes. L’interdisciplinarité et le décloisonnement sont indispensables pour arriver plus rapidement à des avancées majeures. 2 Diagnostiquer et soigner les malades De nombreux médecins et chercheurs travaillent au sein de l’Institut Imagine sur les « thérapies innovantes » comme la thérapie cellulaire, les « bio médicaments » ou encore la thérapie génique dont le premier essai a été réalisé en 2000 par Marina Cavazzana et Alain Fischer. Les équipes travaillent également à la mise au point des diagnostics prénatals et préimplantatoires. Imagine associe aux équipes de recherche plus de 400 professionnels de santé rattachés à 7 services cliniques de l’hôpital Necker-Enfants malades. 4 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 3 Développer la formation À travers la formation de jeunes talents, et la formation continue des médecins et des personnels de santé, l’Institut partage ses découvertes, favorise au sein des équipes la double compétence médecine/recherche. Cette mission est partagée de manière forte avec l’Université Paris Descartes, membre fondateur d’Imagine. Imagine initie également des projets d’enseignement pluridisciplinaires, en partenariat avec de grandes écoles. 4 Valoriser les découvertes Les résultats des recherches effectuées par les chercheurs de l’Institut Imagine sont valorisés à travers des partenariats avec des entreprises industrielles existantes ou créées à cet effet. Imagine a créé un département « valorisation et transfert de technologies » et développe des moyens en recherche clinique pour aider ses chercheurs et médecins à valoriser le fruit de leur découvertes et accélérer la mise en place de nouveaux essais cliniques. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 5 Le budget 12,8 millions d’euros : apports financiers pour la constitution de la dotation de la Fondation par les membres fondateurs CHIFFRES CLÉS 38 Les hommes, les outils, les avancées Les maladies génétiques en chiffres 850 6,5 6 21 2 8 357 30 7 11 32 000 2 1,5 chercheurs, médecins, techniciens et professionnels de santé Parmi les maladies rares membres fondateurs Maladies génétiques 80 Autres maladies rares 20 millions d’euros : budget annuel de fonctionnement et d’investissement laboratoires de recherche millions d’euros : subvention annuelle reçue dans le cadre des investissements d’Avenir au titre du label IHU. millions d’euros : besoin en fonds privés par an 13 millions d’euros investis sur les plateaux techniques depuis 2007 laboratoires associés 35 000 000 3 000 000 30 000 5 000 personnes touchées par des maladies génétiques en Europe personnes touchées par des maladies génétiques en France nouveaux cas par an diagnostiqués en France maladies sévères, chroniques et complexes plateformes technologiques de pointe publications en 2013 brevets et licences en vigueur services cliniques associés centres de référence maladies rares consultations par an au sein du bâtiment Le bâtiment 19 000 m2 dédiés à la recherche et aux soins innovants 60 millions d’euros : budget de construction du bâtiment 26 mois : durée des travaux, d’octobre 2011 à décembre 2013 centres d’investigation clinique 6 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 7 NOS AVANCÉES 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 9 SYNTHÈSE DES FAITS MARQUANTS PAR MISSION LA MISSION PREMIÈRE DE L’INSTITUT IMAGINE EST D’OPTIMISER LES CONDITIONS DE RECHERCHE DES CHERCHEURS ET DES MÉDECINS POUR LEUR PERMETTRE D’ACCÉLÉRER LES DÉCOUVERTES ET DE TROUVER DE NOUVEAUX TRAITEMENTS. 2013 EST LA DERNIÈRE ANNÉE « HORS MURS » POUR LES ÉQUIPES IMAGINE. CELLES-CI ONT CONTINUÉ À MENER À BIEN LEURS RECHERCHES TOUT EN CONSACRANT DU TEMPS À LA FUTURE ORGANISATION AU SEIN DU BÂTIMENT. LES FONDS INVESTIS ET LES RECRUTEMENTS ONT PERMIS D’ACCÉLÉRER LES AVANCÉES SUR LES MISSIONS DE SOINS ET DE VALORISATION. ENFIN, LA MISSION D’ENSEIGNEMENT POURSUIT LES PROGRAMMES RÉCEMMENT MIS EN PLACE ET PRÉPARE LA CRÉATION D’UN NOUVEAU MASTER. Nous présentons ici les principales avancées des 23 laboratoires de recherche, leurs publications, leurs prix et récompenses, un exemple de création de synergies entre les laboratoires ainsi que les investissements réalisés par Imagine sur les plateformes technologiques et les personnes recrutées en 2013. RECHERCHE • 357 publications dont 50 d’impact majeur • 11 prix et récompenses • 8 personnes recrutées pour renforcer les équipes de recherche. ENSEIGNEMENT NOS AVANCÉES 2013 Recherche et soins innovants SOINS INNOVANTS • 1 étude clinique sur l’évaluation d’une nouvelle technique de détection de pathogènes • 3 essais cliniques en dermatologie, maladies métaboliques et transplantation rénale • 2 nouvelles études en préparation sur la caractérisation du microbiome chez les patients atteints d’entéropathie à début précoce. • 3 lauréats du programmes MD PhD et 1 étudiant renouvelé pour sa 3e année de thèse • 2 lauréats du programme « Temps protégé pour la recherche » VALORISATION • 1 projet de master valorisation • 11 discussions scientifiques organisées • 6 séminaires internationaux co-organisés Valorisation • 7 accords de collaboration et 1 contrat de recherche clinique signés • 11 accords de confidentialité signés ou en négociation • 6 demandes de brevet déposées et 3 en cours d’investigation • 2 projets relatifs aux brevets Imagine soutenus par le SATT IDFInnov dans le cadre d’études de preuve de concept. 10 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 11 En 2013, les équipes Imagine ont participé à 357 publications dont la liste exhaustive est disponible à la fin de ce rapport d’activité. Nombre de leurs travaux, répertoriés ci-après, ont été publiés par des revues d’impact majeur. 2009-2011 1 3 5 2 5 2 2 1 2 2 6 4 9 3 2 2 7 5 3 1 - Nature Science New England Journal of Medicine Lancet Nature Immunology Nature Genetics Nature Medicine Nature Structural & Molecular Biology Annual Review of Immunology Nature Reviews Immunology Immunity Journal of Clinical Investigation Journal of Experimental Medicine American Journal of Human Genetics Proceedings of the National Academy of Sciences PLoS Genetics Journal of the American Society of Nephrology Blood Human Molecular Genetics Gastroenterology Bone Journal of Investigative Dermatology Molecular Cell Biology 2012 1 2 1 1 3 1 10 1 15 5 5 1 1 2013 1 2 3 3 1 3 5 9 1 1 1 9 7 1 2 EQUIPE DE JEANNE AMIEL Mutations in endothelin 1 cause recessive auriculocondylar syndrome and dominant isolated question-mark ears L’équipe de Jeanne Amiel au sein du laboratoire 408 Embryologie et génétique des malformations dirigé par Stanislas Lyonnet travaille sur les malformations des dérivées de cellules de la crête neurale. Le syndrome Auriculocondylaire est une malformation cranio faciale rare classée dans les dysostoses mandibulofaciales par anomalie du développement des 1er et 2ème arcs pharyngés. Sa caractéristique est une anomalie du pavillon de l’oreille (en forme de point d’interrogation) et une transformation homéotique de la mâchoire inférieure en mâchoire supérieure. Le syndrome est génétiquement hétérogène et les 2 premiers gènes identifiés pointaient la voie de signalisation de l’endothéline 1 (EDN1) et de son récepteur A (EDNRA). L’identification par notre équipe de mutations d’EDN1 transmises sous un mode autosomique dominant ou récessif dans le syndrome Auriculocondylaire et les oreilles en point d’interrogation isolées confirme le rôle clef de cette voie dans le développement de la mâchoire et du pavillon de l’oreille et illustre la nécessité d’une régulation fine pour un développement normal. Ce travail a été réalisé à Imagine, publié dans Am J Hum Genet en 2013, présenté aux Assises de Génétique et à l’ESHG à Milan en 2014 par Chris Gordon, post-doc au laboratoire. NOS AVANCÉES 2013 PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES MAJEURES EXEMPLES DE PUBLICATIONS EQUIPE D’ANNE PUEL Deep dermatophytosis and inherited CARD9 deficiency L’équipe d’Anne Puel, au sein du laboratoire de Génétique Humaine des maladies infectieuses, dirigé par Laurent Abel a identifié, chez 17 patients d’Afrique du Nord, un déficit autosomique récessif en CARD9 à l’origine d’une maladie fongique très sévère et parfois mortelle appelée dermatophytose invasive. Ces patients n’ont par ailleurs développé aucune autre maladie infectieuse sévère. Les dermatophytes, à l’origine de la maladie, sont des champignons filamenteux qui sont fréquemment responsables d’infections bénignes superficielles de la peau et des ongles. Chez les patients avec un déficit en CARD9, molécule impliquée dans la signalisation de récepteurs capables de reconnaître des motifs conservés exprimés à la surface de certains champignons, la réponse immunitaire spécifique de ces champignons est profondément affectée. En revanche, les cellules sanguines des patients présentent une réponse normale après activation avec d’autres microorganismes (des bactéries, des virus ou des mycobactéries). Ces résultats expliquent la vulnérabilité spécifique et restreinte des patients à des infections causées par des champignons. Ces travaux sont publiés dans la revue New England Journal of Medicine en octobre 2013. EQUIPE DE CORINNE ANTIGNAC LMX1B mutations cause hereditary FSGS without extrarenal involvement L’équipe de Corinne Antignac, laboratoire des Maladies Rénales Héréditaires, a identifié par séquençage à haut débit des mutations du gène /LMX1B/ dans trois familles avec une maladie rénale appelée syndrome néphrotique héréditaire, sans anomalie extrarénale associée. Ce résultat était tout à fait inattendu car les mutations du gène /LMX1B/ sont responsables du syndrome Nail-Patella, caractérisé par une anomalie des rotules, des ongles et des épaules, avec dans certains cas seulement une atteinte rénale associée. /LMX1B /code pour un facteur de transcription qui régule l’expression des gènes durant le développement. Un modèle informatique en trois dimensions suggère que les deux mutations identifiées diminueraient l’interaction de LMX1B avec l’ADN. Ces résultats soulignent la complexité d’expression des maladies monogéniques et ont été publiés dans le Journal of the American Society of Nephrology en 2013. DR Novartis / Journal of the American Society of Nephrology Biopsie de peau d’un patient avec une dermatophytose invasive qui montre le champignon avec une structure filamenteuse (un dermatophyte) dans un granulome (structure composée de cellules du système immunitaire comme des macrophages) au cours de l’invasion de la peau par le champignon. 12 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 13 NOS AVANCÉES 2013 EXEMPLES DE PUBLICATIONS EQUIPE DE GENEVIÈVE DE SAINT-BASILE TTC7A mutations disrupt intestinal epithelial apicobasal polarity L’équipe de Geneviève de Saint Basile, laboratoire Homéostasie normale et pathologique du système immunitaire, a identifié chez plusieurs enfants présentant dès la naissance l’association d’obstructions étagées de la lumière de l’intestin et un déficit immunitaire sévère (susceptibilité aux infections), un déficit autosomique récessif du gène TTC7A. L’étude des conséquences de ce défaut génétique, en particulier à l’aide de « mini-intestins » reconstitués à partir des cellules de biopsies intestinales, a permis de montrer le rôle de la molécule TTC7A dans la voie de signalisation RhoA qui intervient dans la réorganisation des éléments du cytosquelette des cellules. En inhibant cette voie, TTC7A module différentes fonctions des cellules telles que leur polarisation, leur prolifération, leur différenciation et leur mort. Un inhibiteur pharmacologique de la voie RhoA a permis de corriger les défauts fonctionnels des cellules de patients, permettant d’envisager une éventuelle thérapie ciblée de cette affection. EQUIPE DE SOPHIE SAUNIER Septins 2, 7 and 9 and MAP4 colocalize along the axoneme in the primary cilium and control ciliary length L’équipe de Sophie Saunier, Bases moléculaires de la néphronophtise et des hypodysplasies rénales, étudie les maladies génétiques rénales liées à des dysfonctionnements du cil primaire (ciliopathies), une antenne sensorielle constituée de microtubules présente sur la plupart des cellules des vertébrés. Alexandre Benmerah au sein de cette équipe s’est intéressé au rôle du trafic vésiculaire et du cytosquelette d’actine dans la morphogenèse des cils et plus récemment aux septines, protéines jusque-là connues pour leur fonction clef dans la séparation des cellules filles au cours de la mitose. Il a mis en évidence le rôle des septines 2, 7 et 9 dans la formation des cils et plus précisément dans leur élongation, une fonction contrebalancée par l’action de MAP4 sur les microtubules. Cette nouvelle fonction des septines a été depuis pconfirmée chez le poisson zèbre et sont donc des gènes candidats pour les ciliopathies. Cet article a été publié dans Journal of Cell Science en 2013. CRÉATION DE SYNERGIES : UN EXEMPLE EMBLÉMATIQUE IDFix : une puce pour le diagnostic des déficiences intellectuelles et des syndromes autistiques d’origine génétique La recherche d’une cause génétique à un syndrome autistique ou une déficience intellectuelle (ID) est l’un des motifs les plus fréquents de consultation dans Imagine. Dans notre institut, comme dans les autres grands centres européens comparables au nôtre, on considère que cette question représente près de 20-25% des demandes de consultations. Si on se souvient que l’IHU accueille 20 000 enfants par an, ce sont près de 5 000 familles qui chaque année nous consultent dans l’espoir d’obtenir enfin une réponse à ces questions : de quoi souffre mon enfant ? Pouvez-vous mettre un nom sur sa maladie ? Avons-nous un risque d’avoir un autre enfant atteint ? Que peut-on faire pour l’aider ? Ces situations sont d’une extraordinaire hétérogénéité génétique. On compte aujourd’hui plus de 250 gènes connus pour rendre compte d’une déficience intellectuelle de l’enfant et il en existe beaucoup d’autres à découvrir. Chaque enfant est différent, chaque cas est singulier. Cette complexité, jointe au nombre immense de demandes diagnostiques rendaient totalement insoluble la tâche du laboratoire hospitalier de génétique moléculaire dirigé par Jean-Paul De novo gain-of-function KCNT1 channel mutations cause malignant migrating partial seizures of infancy. Barcia G, Fleming MR, Desguerre I, Munnich A, Dulac O, Kaczmarek LK, Colleaux L, Nabbout R. Nat Genet. 2012; 44:1255-9. eIF2Y mutation that disrupts eIF2 complex integrity links intellectual disability to impaired translation initiation. Borck G, Shin BS, Stiller B, P, Munnich A, Schwartz CE, Gothelf D, Colleaux L, Dever TE, Kubisch C, Basel-Vanagaite L. Mol Cell. 2012; 48:641-6. MED23 mutation links intellectual disability to dysregulation of immediate early gene expression.Hashimoto S, Boissel S, Zarhrate M, Rio M, Munnich A, Egly JM, Colleaux L. Science. 2011; 333:1161-3. 14 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Bonnefont dans le Pôle de Biologie Spécialisée. Pour relever ce défi, l’IHU a conçu IDFix, sur le modèle du Ciliome et en lien avec les plateformes de Génomique, de Bioinformatique, le Pôle de Biologie et plusieurs équipes de l’Institut. IDFix est une puce de re-séquençage ciblé permettant l’analyse à haut débit des 250 gènes connus pour donner un syndrome autistique ou une déficience intellectuelle. L’expérience théorique acquise par Laurence Colleaux et l’expertise en matière de re-séquençage des équipes de Corinne Antignac, Sophie Saunier (avec Vincent Moriniere), JeanMichel Rozet et Valérie Cormier-Daire, ont permis à Sylvain Hanein de concevoir une puce évolutive, qui va non seulement répondre aux besoins du diagnostic mais aussi identifier les cas inexpliqués, à orienter vers les équipes de recherche. Enfin et surtout, IDFix va permettre de regrouper les enfants souffrant de la même maladie pour de futurs essais cliniques. Emblématique des missions de l’IHU, IDFix est un bel exemple de partage d’expérience interéquipes et de coopération entre la recherche et le diagnostic hospitalier, bientôt possible dans des conditions d’exhaustivité et de rapidité incomparables. Tequila, a neurotrypsin ortholog, regulates long-term memory formation in Drosophila. Didelot G, Molinari F, Tchénio P, Comas D, Milhiet E, Munnich A, Colleaux L, Preat T. Science. 2006; 313:: 851-3. Truncating neurotrypsin mutation in autosomal recessive nonsyndromic mental retardation. Molinari F, Rio M, Meskenaite V, Encha-Razavi F, Augé J, Bacq D, Briault S, Vekemans M, Munnich A, Attié-Bitach T, Sonderegger P, Colleaux L. Science. 2002; 298 : 1779-81. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 15 OLIVIER HERMINE Grand prix de la Fondation de France Liste des prix obtenus par les médecins et chercheurs d’Imagine en 2013 PAULINE KRUG 2013 ESHG-European Society of Human Genetics Poster Award Finalist RANA ABOU-KHALIL Young Investigator award, Annual Meeting of the American Society for Bone and Mineral Research, Baltimore, USA NOS AVANCÉES 2013 PRIX ET RÉCOMPENSES JEAN-LAURENT CASANOVA Investigator, Howard Hughes Medical Institute, USA ARNOLD MUNNICH Officier de la légion d’honneur STANISLAS LYONNET Chevalier de la légion d’honneur NADINE CERF-BENSUSSAN Chevalier de la légion d’honneur VALÉRIE CORMIER-DAIRE Prix Jean Valade GUILLAUME VOGT Prix Albert Sézary de l’Académie Nationale de Médecine JEAN-PIERRE DE VILLARTAY ALAIN FISCHER Prix Sanofi - Institut Pasteur 2013 Prix Yvelines de la Ligue Contre le Cancer 2 16 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 17 Doubler le nombre d’études innovantes en 5 ans, notamment en thérapies géniques et cellulaires et accélérer leur mise en œuvre, quelle que soit la stratégie : médicament, biothérapie, thérapie cellulaire et génique. Augmenter le nombre de patients inclus dans ces études. Imagine apporte un soutien aux services cliniques et développe des projets de recherche clinique en collaboration avec le Centre de Recherche Clinique de l’Hôpital Necker, avec : Une équipe d’Infirmiers Mobiles de Recherche Clinique, capable d’intervenir dans la prise en charge des patients inclus dans des études cliniques au sein des services, Une aide ponctuelle, de certains services et/ou centres de référence avec le recrutement d’un technicien d’études cliniques et d’un médecin de recherche clinique à temps partiel. En parallèle, Imagine a renforcé sa structure promotion en intégrant à ses équipes un chef de projet dédié en octobre 2013. AVANCÉES EN RECHERCHE CLINIQUE LES MALADIES GÉNÉTIQUES SONT, LA PLUPART DU TEMPS, DES MALADIES COMPLEXES POUR LESQUELLES IL EXISTE UN DOUBLE BESOIN : DÉVELOPPER DE NOUVEAUX OUTILS DIAGNOSTICS ET DÉCOUVRIR DE NOUVEAUX TRAITEMENTS. POUR FAVORISER LES AVANCÉES, IMAGINE ÉTABLIT DES LIENS ÉTROITS ENTRE LA RECHERCHE APPLIQUÉE ET LA RECHERCHE CLINIQUE, EN APPORTANT DES MOYENS SUPPLÉMENTAIRES AUX STRUCTURES EXISTANTES. La recherche clinique représente l’ensemble des recherches en santé menées sur l’être humain. Elle est distincte de la recherche expérimentale, plus en amont, mais lui est très liée dans la pratique. C’est une évaluation scientifique prospective ou non, interventionnelle ou non, dont l’objectif est de répondre à une ou des questions pertinentes et précises. Il y a, dans le cadre défini par la loi, 3 types de recherche clinique : La recherche biomédicale : recherche interventionnelle ou essai clinique nécessitant une intervention sur le patient en dehors des soins classiques (nouveau médicament, nouveau dispositif médical…) La recherche de soins courants : recherche interventionnelle à risques et contraintes négligeables permettant d’évaluer des techniques ou des pratiques déjà validées. La recherche non-interventionnelle : recherche pour laquelle le patient est suivi de manière classique, sans aucune contrainte supplémentaire, avec un simple recueil de données. Toutes ces recherches peuvent nécessiter la collecte et l’utilisation d’échantillons biologiques humains. DESCRIPTION FINE DES SYMPTÔMES ET CONSTITUTION DES BASES DE DONNÉES BIOBANQUES MÉDECINS CLINICIENS MALADES COMPRÉHENSION DES MÉCANISMES DES MALADIES (MÉCANISMES D’ACTION ET VOIES DE SIGNALISATION) EVALUATION DE NOUVELLES MOLÉCULES, DE NOUVELLES STRATÉGIES THÉRAPEUTIQUES CRIBLAGE DE MOLÉCULES THÉRAPEUTIQUES 18 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Dans l’objectif de développer un lien étroit entre la recherche appliquée et la clinique, et pour aider à la structuration des services cliniques, Imagine a continué à renforcer son équipe Candice Brunet dédiée en finançant les salaires de deux infirmiers mobiles de recherche clinique (IMRC), recrutés par l’Hôpital Necker-Enfants malades en juillet 2013. Candice Brunet et Jérôme Jeannette sont rattachés fonctionnellement à Jérôme Jeannette Elisabeth Hulier-Ammar, responsable de la recherche clinique Imagine, et hiérarchiquement au coordonnateur général des soins de l’Hôpital Necker-Enfants malades via le pôle 9 de l’hôpital. Ce projet est donc le fruit d’une collaboration étroite entre la direction des soins de l’hôpital et Imagine. NOS AVANCÉES 2013 Les objectifs d’Imagine pour la recherche clinique Ces infirmiers ont suivi dès leur arrivée un parcours d’intégration de trois mois dans plusieurs services de l’hôpital correspondant au périmètre de compétences de l’IHU, et bénéficié de formations spécifiques sur l’administration du médicament et sur la règlementation de la recherche biomédicale. Les IMRC travaillent dans le respect des Bonnes Pratiques Cliniques et de la règlementation en vigueur. Leurs missions incluent des activités d’aide à l’inclusion, d’administration de traitement(s) et bien entendu de soins, dans le cadre des protocoles de recherche clinique, interventionnels ou non, en hospitalisation conventionnelle, en hôpital de jour ou en consultation. Ils complètent ainsi l’offre proposée par le Centre d’Investigation Clinique dirigé par le Pr Jean-Marc Tréluyer. Afin de faciliter la conduite des études et essais, des outils de communication communs à Necker et l’équipe de recherche clinique Imagine ont été créés. Entre septembre et novembre 2013, les IMRC ont été intégrés aux équipes de trois essais cliniques : dermatologie, maladies métaboliques et transplantation rénale. Le développement de projets CHERCHEURS Une première étude clinique portant sur l’évaluation d’une nouvelle technique de détection de pathogènes a été mise en place en octobre 2013 pour le compte d’une société de biotechnologie. > Au 31 décembre 2013, 18 patients étaient inclus dans cette étude. Le recutement d’Isabelle Buffet, Chef de Projets, a également Isabelle Buffet permis de débuter les démarches pour la mise en place de deux nouvelles études, à Promotion Imagine, portant sur la caractérisation du microbiome chez les patients atteints d’entéropathie à début précoce. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 19 NOS AVANCÉES 2013 Enseignement LE PARTAGE DES SAVOIRS EST UNE MISSION À PART ENTIÈRE DE L’INSTITUT, PORTÉE DE MANIÈRE FORTE AVEC L’UNIVERSITÉ PARIS DESCARTES. IMAGINE SOUTIENT D’AILLEURS CHAQUE ANNÉE LE CONGRÈS DES JEUNES CHERCHEURS EN BIOLOGIE – PRIX RENÉ DESCARTES. Cette ambition commune a guidé la création de deux programmes destinés, pour l’un, à soutenir financièrement des étudiants en thèse de sciences, pour l’autre, à encourager de jeunes praticiens à la recherche en leur dégageant un « temps protégé ». Pour accomplir pleinement cette mission d’enseignement, disposer d’un lieu dédié à la transmission des connaissances et au débat était essentiel. Ce projet a pu être concrétisé en 2013 grâce à la Fondation Bettencourt Schueller. LES PROGRAMMES DE SOUTIEN AUX JEUNES TALENTS Programme MD PhD Maria Sara de Almeida Goncalves Alexandre Morel En 2013, pour la troisième année consécutive, Imagine a renouvelé son appel à candidature pour le programme MD-PhD. Ce programme aide des jeunes médecins et pharmaciens dans leur projet de recherche par le financement de leur thèse en sciences. Cette année, cinq candidatures ont été reçues, ainsi qu’une demande de renouvellement pour une troisième année. Les lauréats pour 2013 sont Alexandre MOREL (hématologie), Fabienne CHARBIT-HENRION (immunité intestinale) et Maria Sara DE ALMEIDA GONCALVES (néphrologie). La demande de renouvellement pour une troisième année pour Quentin VINCENT (génétique des maladies infectieuses) est validée. UN NOUVEAU CENTRE DE SÉMINAIRES EN 2013, GRÂCE AU GÉNÉREUX SOUTIEN DE LA FONDATION BETTENCOURT SCHUELLER, IMAGINE A AMÉNAGÉ, DANS DES CONDITIONS OPTIMALES POUR LES UTILISATEURS, UN CENTRE DE SÉMINAIRES DE 183 PLACES, AU 6e ÉTAGE DE L’INSTITUT. CE CENTRE DE SÉMINAIRES A VOCATION À ACCUEILLIR DES CONFÉRENCES INTERNATIONALES, DES DISCUSSIONS SCIENTIFIQUES, DES ÉVÉNEMENTS INTERNES OU EXTERNES. Quentin Vincent Programme Temps protégé Nadia Bahi-Buisson 20 Le programme « Temps protégé pour la recherche » a été lancé pour les médecins, odontologistes et pharmaciens qui travaillent dans les entités cliniques de l’hôpital, associées à l’IHU. Le programme, d’une durée de deux ans, permet de consacrer la partie hospitalière du temps médical, odontologique ou pharmacien à un projet de recherche. L’IHU verse une compensation financière à l’Hôpital Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Necker pour assurer la continuité des activités par le recrutement de praticiens attachés. En 2013, les deux candidatures reçues ont été sélectionnées. Les lauréats sont Muriel GIRARD (Étude des facteurs de prédisposition génétique à la destruction des voies biliaires en développement) et Nadia BAHI-BUISSON (Bases génétiques et moléculaires des Anomalies du Développement du Cortex cérébral). L’auditorium a été étudié pour répondre aux besoins des intervenants et participants : accessibilité aux personnes à mobilité réduite (5 places), écran de qualité, vidéoprojecteur, étude de l’acoustique, possibilité d’installation d’une régie, installations informatiques et électriques permettant un usage généralisé des ordinateurs individuels, fauteuils agréables et fonctionnels, système d’occultation de la lumière du jour… Une zone modulable permet, soit le déroulement en simultané de deux réunions, soit de libérer un espace de réception de 100 personnes. Le centre de séminaires dispose également d’une zone point presse, d’un espace de restauration et d’un accès direct aux terrasses du 7e étage. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 21 UN DES OBJECTIFS DE L’IHU IMAGINE EST D’AUGMENTER LE NOMBRE DE PARTENARIATS PUBLIC-PRIVÉ. EN VALORISANT LE FRUIT DE SES TRAVAUX DE RECHERCHE, L’INSTITUT SE DONNE LES MOYENS D’AUTOFINANCER DE NOUVEAUX CHANTIERS, D’ACCÉLÉRER LA MISE AU POINT DE TRAITEMENTS EN APPLICATION DES DÉCOUVERTES. Imagine coordonne le transfert de technologies en collaboration avec les structures de valorisation de ses institutions partenaires : Inserm Transfert, OTTPI (APHP) et SATT IDFInnov pour l’Université Paris Descartes. En 2013, sept accords de collaboration et un contrat de recherche clinique ont été signés, comme présenté ci-dessous. Accords de collaboration et contrat de recherche clinique signés en 2013 Company (alphabetical order) Imagine lead scientist Biomarin Laurence Legeai-Mallet In vivo assessment of a drug developed by Biomarin against achondroplasia CTRS Isabelle André-Schmutz Proof-of-concept of a new strategy for shortening the immune deficient phase in patients following HLA-partially incompatible hematopoietic stem cell transplantation In-kind only Danone / Bioaster Nadine Cerf-Bensussan Study of the interactions between probiotic strains and gut immune cells 184 Genzyme Laurence Legeai-Mallet In vivo assessment of a drug developed by Genzyme against achondroplasia 135 Novartis Sophie Saunier Identification and characterization of novel human mutations causing nephronophthisis (NPH) and associated ciliopathies 400 Pathoquest Marc Lecuit Clinical service agreement related to the clinical validation of high throughput sequencing technology for diagnosing infectious syndromes 284 Sanofi Alain Hovnanian Pathophysiological study of a rare syndrome in dermatology 98 Sanofi Agnès Rötig Topic Funding (KE)* 50 Transcriptomic study of a mitochondrial disease TOTAL NOS AVANCÉES 2013 Valorisation In-kind only 1151 * : multiyear funding includes funding of research programs plus overheads. D’autres opportunités de partenariat ont été discutées en 2013 mais sans signature d’accord (principalement pour des raisons stratégiques) ou étaient encore en négociations à la fin de l’année 2013. Le tableau 2, ci-après, présente les accords de confidentialité signés en 2013. 22 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 23 NOS AVANCÉES 2013 Accords de confidentialité signés en 2013 Company (alphabetical order) Imagine lead scientist Topic / Therapeutic area Led to an outsourcing agreement in the framework of a project funded by SATT IDFinnov Atlantic Bone Screen Valérie Cormier-Daire Preclinical proof-of-concept study in a bone disease Boehringer Ingelheim Sylvain Latour Drug discovery in immunology Still under discussion Calypso Nadine Cerf-Bensussan Preclinical proof-of-concept study in gastroenterology Still under discussion GSK Sylvain Latour Drug discovery in immunology Did not reach an agreement KLS partners Sylvain Latour Drug discovery in immunology Still under discussion KLS partners Jean-Michel Rozet Drug discovery in ophthalmology Did not reach an agreement Lucane Geneviève de Saint-Basile Drug discovery in immunology, gastroenterology Applied for an ANR grant – results expected in 2014 Prosensa Alain Hovnanian Preclinical proof-of-concept study in dermatology Still under discussion Shire Alain Hovnanian Preclinical proof-of-concept study dermatology Still under discussion Sygnature Sylvain Latour Drug discovery in immunology Still under discussion Valerion Geneviève Gourdon Preclinical proof-of-concept study in a muscular disease Still under discussion Des efforts permanents sont maintenus pour développer les partenariats industriels dans trois directions : - Aller plus loin sur des projets de découverte de nouveaux médicaments dans des cibles thérapeutiques découvertes et caractérisées au sein d’Imagine. - Développer des accords stratégiques liés aux activités de recherche ou de clinique (les discussions en cours avec Novartis ou GSK, par exemple) - Créer de la valeur à partir des ressources cliniques ou précliniques disponibles au sein d’Imagine. En novembre 2012, la signature d’un accord entre Imagine et ses partenaires (Inserm, AP-HP et l’Université Paris-Descartes) a donné un cadre à la protection et à la promotion des résultats de la recherche. Selon cet accord, les droits de propriété intellectuelle des activités Imagine sont partagés de manière équitable entre Imagine et 24 Comment Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 ses partenaires. Les signataires ont également accepté la désignation d’un référent unique pour chaque projet. Deux projets relatifs aux brevets Imagine déposés avant 2013 ont été soutenus par le SATT IDFInnov au cours de l’année dans le cadre d’études de preuve de concept : -L e développement d’un kit permettant de prédire le risque de la maladie du greffon contre l’autre dans le cas d’une greffe de cellules souches. Chercheur référent : Olivier Hermine. Soutien financier : 236 000 €. Aboutissement attendu : octroi de licence à une entreprise préexistante. -L e développement d’une nouvelle stratégie thérapeutique dans le traitement des désordres de la densité osseuse. Chercheurs référents : Arnold Munnich, Valérie CormierDaire. Soutien financier : 200 000 €. Aboutissement attendu : création d’une start-up ou octroi de licence à une entreprise préexistante. Nouveaux droits de propriété intellectuelle En 2013, six demandes de brevet ont été déposées et trois demandes étaient en cours d’investigation (demandes non remplies) à la fin de l’année 2013. Dans l’ordre chronologique : - Methods and pharmaceutical compositions for inhibiting T cell proliferation in a subject in need thereof, Main inventor: Sylvain Latour, priority date: April 18, 2013. - Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of inflammatory bowel diseases, Main inventor: Geneviève de Saint-Basile, priority date: May 3, 2013. - Methods for performing antisense oligonucleotide-mediated exon skipping in the retina of a subject in need thereof, Main inventor: Jean-Michel Rozet, priority date: Jul 8, 2013. - Methods for diagnosing and treating basal cell carcinoma, Main inventor: Asma Smahi, priority date: Sep 10, 2013. - Methods and compositions for the treatment of ß-thalassemia, Main inventor: Olivier Hermine, priority date: Nov 20, 2013. - Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of beta-thalassemias, Main inventor: Olivier Hermine, priority date: Nov 28, 2013. - Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of Netherton syndrome, Main inventor: Alain Hovnanian, not yet filed at end 2013. - Methods and pharmaceutical compositions for the treatment of diseases mediated by the NRP-1/OBR complex signaling pathway, Main inventor: Olivier Hermine, not yet filed at end 2013. - Method for generating T cell progenitors, Main inventor: Isabelle André-Schmutz, not yet filed at end 2013. Transfert de droits de propriété intellectuelle Trois des six demandes de brevets déposées ont mené à des discussions, encore en cours, avec des laboratoires pharmaceutiques et des sociétés de biotechnologie. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 25 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS 27 L’ACHAT DE NOUVEAUX ÉQUIPEMENTS ET LE RECRUTEMENT DE PERSONNELS DÉDIÉS ONT PERMIS L’OPTIMISATION DE PROCESS ET L’ACCÉLÉRATION DE NOMBREUX TRAVAUX. LE SOUTIEN À NOS MISSIONS Développement des plateformes technologiques LE SOUTIEN À NOS MISSIONS POUR TOUS LES TALENTS RASSEMBLÉS AUTOUR DE CE PROJET, IMAGINE INVESTIT, RECRUTE, ET FINALISE UN NOUVEAU BÂTIMENT AFIN DE LEUR OFFIR LES MEILLEURES CONDITIONS DE TRAVAIL. Notre objectif : encourager la créativité scientifique, favoriser les découvertes et accélérer la mise au point de solutions diagnostiques et thérapeutiques innovantes. Voilà la stratégie à laquelle l’Institut s’est fié en 2013 pour gagner du temps sur les maladies génétiques. PLATEFORME GÉNOMIQUE La plateforme génomique d’Imagine a été créée en 2008 avec pour mission d’offrir à la communauté scientifique du site Necker-Enfants malades des prestations de haut niveau dans le domaine du génotypage, du séquençage à haut-débit et de l’expression génique. Le design expérimental, l’analyse et l’interprétation des résultats sont menés en collaboration avec les chercheurs de la plateforme bioinformatique 28 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 (Imagine/Université Paris Descartes). Le parc d’équipements de la plateforme s’est étoffé et a évolué au fil du temps. La plateforme dispose aujourd’hui d’une station de microarrays Affymetrix (disponible depuis l’ouverture de la plateforme en 2008) et de 4 séquenceurs nouvelle génération : 2 HiSeq2500 et 1 Mi-Seq d’Illumina, 1 PGM Ion Torrent de Life Technologies (mis en place entre 2010 et fin 2013). Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 29 PUCES À ADN 2008 : Plateforme Affymetrix SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION 2010 à 2013 : Séquençeurs de nouvelle génération (haut et moyen débit) 1 PGM IonTorrent (Life Technologies) 1 HiSeq 2500 (Illumina) 1 MiSeq (Illumina) Le nombre d’échantillons totaux traités sur la plateforme double tous les ans depuis 2011. En 2013, près de 2300 échantillons ont été analysés au total dont environ 300 puces hybridées pour des études de liaison, de l’analyse du nombre de copies, et des études transcriptomiques et près de 2000 échantillons analysés sur séquenceur nouvelle génération pour majoritairement des applications de séquençage ciblé. En 2013, près de 1000 éxomes ont été séquencés sur HiSeq2500 et plus de 1000 autres échan- PLATEFORME BIOINFORMATIQUE tillons ont été analysés sur HiSeq2500, MiSeq ou PGM, pour d’autres types d’applications du séquençage ciblé. Les applications de séquençage ciblé mises en place se diversifient de plus en plus depuis 2012 (pour la recherche et pour le diagnostic). Pour faire face à cette augmentation d’activité, un assistant ingénieur supplémentaire a été recruté en mars 2013. L’effectif de la plateforme est donc passé de 4 personnes en 2012 à 5 personnes en 2013 (2 ingénieurs et 3 assistants ingénieurs). EN TANT QUE PARTENAIRES DE L’UNIVERSITÉ ET DE LA FACULTÉ DE MÉDECINE PARIS DESCARTES, LES ÉQUIPES DE RECHERCHE D’IMAGINE BÉNÉFICIENT DU SUPPORT DE LA PLATEFORME BIOINFORMATIQUE DE PARIS-DESCARTES. C’EST DANS CE CADRE QU’IMAGINE SOUTIENT ET RENFORCE LE POTENTIEL DE CETTE PLATEFORME. Progression de l’activité de la plateforme génomique Nombre d’échantillons traités par an 2500 Exomes 2290 2000 NGS 1500 1294 1000 500 0 343 415 505 2008 2009 2010 514 2011 2012 2013 Microarrays affymetrix 600 2011 2012 2013 Autres projets NGS Projets types 600 300 400 200 200 100 0 2008 2009 2010 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 2011 2012 2013 gine. Ces équipements sont gérés par la plateforme de Bioinformatique. Pour l’année 2013, la plateforme a analysé 1500 éxomes et 322 échantillons en captures ciblées (ciliome). Depuis l’an dernier, afin d’aider au développement des activités de sé-quencage dans le cadre du diagnostic, nous avons réalisé un pipeline d’analyse et une interface d’interprétation des résultats (PolyDiag). Cette interface répond à la problématique spécifique du diagnostic, découverte des mutations, vérification des couvertures, validation en Sanger, etc. Nous avons réalisé au cours de cette année l’analyse de 126 patients. Cette activité devrait croître très fortement l’année prochaine. En 2013, la plateforme a également réalisé l’étude de 46 projets de transcriptomique (puces à ADN) et de 19 nouvelles études de liaisons (puces à ADN). 1200 800 400 30 2010 1000 500 0 1000 900 800 700 600 500 400 300 200 100 0 La plateforme a développé un pipeline original d’analyse des données issues des projets de reséquençage. Notre pipeline (polyPipeline) permet l’intégration des principaux outils bioinformatiques publics d’analyse de séquences (alignement, recherche de variations). La baisse des coûts de séquençage a entraîné une augmentation du nombre moyen d’échantillons par projet. Pour gérer ce nombre important d’échantillons, nous avons également mis en place une base de données de suivis de projet et d’échantillons (polyProject). La visualisation et l’interprétation biologique des résultats peuvent alors être réalisées par les chercheurs eux-mêmes à l’aide d’une interface graphique (Polyweb). Ces applications sont mises en œuvre sur des serveurs et un cluster de calcul acheté en 2010 et upgradé en 2011. L’ensemble de ces investissements ont été financés par Ima- LE SOUTIEN À NOS MISSIONS Équipements 2010 2011 2012 2013 Projets analysés Echantillons Exomes complets Ciliome Diagnostic (PGM 123 5 25 1500 322 613 Etudes de liaison génétique (génotypage) 24 212 (250 000 SNPs) Expression différentielle du transcriptome 46 1199 (RNA-Chips) Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 31 LA PLATEFORME DE CYTOMÉTRIE DE LA STRUCTURE FÉDÉRATIVE DE RECHERCHE (SFR) CONTINUE SA MISSION DE METTRE À DISPOSITION POUR LES ÉQUIPES DU SITE DE NECKER DES APPAREILLAGES LOURDS DE CYTOMÉTRIE (2 TRIEURS ET UN ANALYSEUR) AFIN DE LEUR FACILITER L’ACCÈS À CETTE TECHNIQUE GRÂCE À LA PRÉSENCE DE 3 EXPERTS. L’année 2013 a vu l’activité du trieur BD Aria 2 SORP continuer de progresser (fig.1) pour atteindre un taux d’utilisation quasiment à saturation. Ce taux d’utilisation nous a permis de justifier une demande de financement d’un troisième trieur. Ce 3e trieur, le SH-800 de la société Sony, a été installé sur la plateforme au sein du bâtiment Imagine à la fin du 1er trimestre 2014. Le bilan de l’activité de 2013 nous permet de constater que les efforts réalisés par le per- sonnel en termes de formation porte ses fruits puisque la proportion d’utilisateurs autonomes a continué de progresser (fig. 2) pour atteindre un peu moins des 2 tiers des créneaux utilisés. De plus nous pouvons constater (fig. 3) qu’une très grande partie des équipes présentes sur le site de Necker est utilisatrice de l’antenne Imagine de la plateforme de tri, même si en fonction de la thématique spécifique à chaque équipe le volume d’utilisation diffère entre les laboratoires. PLATEFORME D’IMAGERIE CELLULAIRE ET MOLÉCULAIRE L’ÉVOLUTION EN ÉQUIPEMENT DE LA PLATEFORME D’IMAGERIE CELLULAIRE ET SON ACTIVITÉ N’ONT CESSÉ DE CROÎTRE DEPUIS 2005. CHAQUE ANNÉE, POUR RÉPONDRE AUX NOUVEAUX BESOINS DES CHERCHEURS DU SITE, ELLE A FAIT L’ACQUISITION D’UN NOUVEL APPAREIL APRÈS L’OBTENTION DE FINANCEMENTS AUPRÈS D’IMAGINE ET DE FONDATIONS EXTERNES (LA FONDATION POUR LA RECHERCHE MÉDICALE (FRM), FONDATION ARC. En 2013, l’occupation des microscopes confocaux avoisine les 100%. C’est pourquoi l’achat d’un nouvel appareil est envisagé pour l’année 2014, d’autant que le site accueillera de nouvelles équipes, utilisatrices de la plateforme. % d’occupation des confocaux et biphopon par institut en 2013 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS PLATEFORME CYTOMÉTRIE DE FLUX Volume horaire d’utilisation de l’aria II SORP au cours des 3 dernières années 840:00:00 720:00:00 45% 600:00:00 55% 480:00:00 360:00:00 Les systèmes de la plateforme sont occupés à hauteur de 55% par les équipes rattachées à l’Institut Imagine. 240:00:00 120:00:00 0 Institut Necker 2011 Autonome 32 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 2012 Imagine 2013 Non Autonome Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 33 Microscope Confocal Leica TCS SP5 Depuis son installation en mai 2008, l’utilisation du Leica TCS SP5 n’a cessé de croître pour arriver à saturation dès 2010. Nous avons enregistré pour cette année 2013 une fréquentation moyenne de 84% sur la base de 40 séances/ mois en jours ouvrables. L’appareil a été utilisé en proportion un peu moindre par les équipes de l’Institut (46% Imagine versus 54%). Ceci s’explique par le fait que le système est situé sur le site Broussais et le déménagement des équipes Imagine a diminué cette fréquentation. Vidéomicroscope / TIRF Nikon Le plateau dispose d’un système d’imagerie complet pour la réalisation de vidéomicroscopie. Ce système a été cofinancé par Imagine. Nous pouvons ainsi réaliser des expériences sur des temps très courts telles que le suivi de la réponse calcique suite à un stimulus ou à l’inverse suivre des phénomènes sur de longues périodes tels que la croissance cellulaire ou le changement de cycles des cellules. Le vidéomicroscope TIRF est utilisé à 100% par les équipes Imagine. D’autre part, l’appareil est équipé d’un module TIRF (Total Internal Reflection Fluorescence) permettant l’observation de phénomènes au niveau des membranes cellulaires. De nombreux résultats ont ainsi pu être obtenus, certains ont d’ores et déjà fait l’objet de publications notamment dans Blood : « Terminal transport of lytic granules to the immune synapse is mediated by the kinesin-1/Slp3/Rab27a complex, M.Kurowska and al. » et d’autres sont en cours de publication. CENTRE DE RESSOURCES BIOLOGIQUES CRÉÉ À L’ORIGINE EN 1992 DANS LE DÉPARTEMENT DE GÉNÉTIQUE DE L’HÔPITAL NECKER, LE CENTRE DE RESSOURCES BIOLOGIQUES (CRB-ADN) A POUR OBJECTIF DE CONSERVER DES ÉCHANTILLONS BIOLOGIQUES SANGUINS ISSUS DE PATIENTS (ET DE LEUR FAMILLE) ATTEINTS DE MALADIES GÉNÉTIQUES INCLUANT DES PATHOLOGIES RARES, SOIT À VISÉE DE « SAUVEGARDE » ET REQUALIFIÉS ULTÉRIEUREMENT POUR DES PROJETS DE RECHERCHE, SOIT ENTRANT DIRECTEMENT DANS LE CADRE DE COLLECTIONS BIOLOGIQUES. Dans ce but, le CRB-ADN effectue le traitement des échantillons de sang : réception, transformation des échantillons en produits dérivés sous différentes formes (ADN, culots de leucocytes, lymphocytes du sang périphérique, lignées cellulaires transformées par l’EBV), stockage à long terme sécurisé et mise à disposition des échantillons biologiques, dans le respect des règlementations nationales et internationales. L’équipe du CRB-ADN a obtenu la Certification en décembre 2012, selon la norme française de Centres de Ressources Biologiques (NF S 96-900). Le CRB-ADN participe aux projets nationaux « Infrastructure Nationale en Biologie et Santé » 34 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS Investissements matériels réalisés par Imagine (Biobanques, Cohortes Maladies Rares, Institut Hospitalo-Universitaire) et au programme européen « Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure » (BBMRI). L’activité du CRB-ADN ne cesse d’augmenter. En 2013, le nombre de prélèvements reçus dans la biobanque est de 5600, cette activité a progressé de 10 % par rapport à 2012, entraînant le recrutement d’un technicien financé par Imagine dès juillet 2013. De même, les demandes de sorties d’échantillons du CRB-ADN en vue de leur utilisation ont progressé : alors qu’en 2012 elles représentaient 47 % du nombre total de prélèvements entrés en banque au cours de l’année, elles atteignent 60 % en 2013. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 35 - 14235 lames pour la coupe en paraffine - 400 lames pour la coupe en congélation - 3211 lames colorées (1411 HE, 223 PAS, 1390 Trichrome, 187 Picrosirius) - Et 21 personnes ont été formées à la microtomie (coupe congélation et paraffine). Les volumes des prestations demandées par les équipes Imagine restent stables entre 2012 et 2013. 100% 929 80% 3211 3475 318 400 224 60% 5059 13053 14235 1026 1823 1576 2011 2012 2013 40% LE SOUTIEN À NOS MISSIONS En 2013, 14 équipes ont fait des demandes de prestations, dont 7 de l’unité d’A. Munnich, 2 de l’unité d’A. Fischer, 3 de l’unité de C. Antignac, les demandes restantes provenant de l’équipe de N. Cerf-Bensussan et l’équipe d’O. Hermine. Sur les 214 demandes de prestations, la plateforme a effectué : - 1576 inclusions en paraffine 20% 0 PLATEFORME D’HISTOLOGIE LA PLATEFORME D’HISTOLOGIE ET DE MORPHOLOGIE DU PETIT ANIMAL A ÉTÉ CRÉÉE EN 2007 PAR LE CENTRE DE RECHERCHE « CROISSANCE ET SIGNALISATION » INSERM U845. Jusqu’en Juin 2011, cette plateforme n’était dédiée qu’aux équipes du Centre de Recherche. Grâce au financement d’Imagine, un poste d’assistant ingénieur s’est ouvert sur la plateforme en mai 2011 avec achat de matériel pour la microtomie (1 microtome, 1 plaque froide, 1 bain-marie et 1 étuve). Depuis Juillet 2011, la plateforme s’est ouverte aux équipes Imagine. Au cours de l’année 2013, l’Institut Imagine a participé au financement de 2 appareils : -U ne imprimante de lame Slidemate (Thermo Fisher) associée à un ordinateur en juillet. Elle nous permet un gain de temps, une meilleure lisibilité et plus d’informations sur les lames par rapport à l’écriture manuelle. - Un scanner de lame Nanozoomer (Hamamatsu) et le logiciel de gestion et d’analyse d’Image Calopix (Tribvn) ainsi que des serveurs associés en septembre. Cet appareil permet de créer une lame virtuelle en lumière blanche ou en fluorescence (Dapi, FITC, TRITC) au grossissement x20 ou x40, qui pourra être stockée et/ou analysée via Calopix. Ce financement incluant une enveloppe pour un CDD de 21 mois d’un assistant ingénieur, nous avons recruté Laura Charles-Vaton. Arrivée en novembre, elle assure la gestion et les demandes de lames virtuelles. Lames colorées Coupes OCT Coupes Paraffine Inclusions Environ 40 % des prestations effectuées par la plateforme sont demandées par les équipes rattachées à l’Institut Imagine. Répartition des prestations sur 3 ans Imagine U845 100% 5069 1026 1823 80% 1576 3053 4235 318 224 400 929 3475 3211 6717 6833 60% 40% 4853 28380 1199 4943 3327 36644 33063 2011 2012 2013 2011 2012 2013 2011 2012 2013 2011 2012 2013 Inclusions Coupes Paraffine Coupes OCT Lames colores 3929 425 1484 20% 0 En 2013, les appareils (microtomie et microdissecteur laser) ont été utilisés en majorité par les équipes rattachées à l’Institut Imagine. 36 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 37 PLATEFORMES SPECTROMÉTRIE DE MASSE ET PROTÉOMIQUE LES APPROCHES PROTÉOMIQUES SONT ESSENTIELLES À LA COMPRÉHENSION DES MÉCANISMES À L’ORIGINE DES MALADIES GÉNÉTIQUES, TANT SUR LES ASPECTS FONDAMENTAUX (IDENTIFICATION, CARACTÉRISATION, INTERACTIONS) INVESTIGUÉS SUR LA PLATEFORME PROTÉOMIQUE DE NECKER, QUE SUR LES ASPECTS APPLIQUÉS À LA CLINIQUE (DOSAGE ET NOUVEAUX DIAGNOSTICS) SUR LA PLATEFORME SPECTROMÉTRIE DE MASSE. IMAGINE CONTRIBUE À FACILITER LA CONDUITE DE PROJETS EN FINANÇANT DES ÉQUIPEMENTS ET DES RECRUTEMENTS POUR LA PLATEFORME DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE ET LA PLATEFORME PROTÉOMIQUE. La plateforme protéomique de Necker (PPN) Fondée en 2004, la plateforme protéomique de Necker (PPN) permet aux équipes de Necker de mener à bien leurs projets portant sur les protéines. Elle est ouverte aux instituts de recherche et aux services cliniques. Cette plateforme fait partie de la structure fédérative de recherche (SFR) Necker,. 38 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Elle est commune au pôle de biologie de l’Hôpital Necker-Enfants malades, à l’institut de recherche Necker-Enfants malades et Imagine. Elle s’est constituée progressivement à partir de mars 2012, pour comprendre aujourd’hui 7 appareils, 2 GC-MS/MS dédiés au dosage des acides organiques et 5 LC-MS/ MS triple quadripôle dont 4 de sensibilité moyen-ne dédiés aux activités de soin et dont 1 de très grande sensibilité (xevoTQS), plus particulièrement dédié au dosage ciblé de molécules nécessitant une grande sensibilité comme les protéines et les activités enzymatiques. Les activités de la plateforme s’articulent autour de deux axes, soins et recherche. L’axe de soins comprend l’extension des dosages de routine de petites molécules à différents services de l’Hôpital NeckerEnfants malades, et l’axe de recherche, le développement de nouveaux tests nécessitant une très grande sensibilité. Certains de ces développements pourront passer dans le champ des soins courants pour devenir de nouveaux outils diagnostiques.. - Projet CTP synthèse Nucléotides, désoxynucléotides de l’unité 768 d’Imagine : ce projet a généré 1200 profils chromatographiques (soit 5000 dosages ciblés de petites molécules) et a donné lieu à une publication dans Nature. - Le projet Immunosup Test (université Paris Descartes, financement SESAME) sur la pharmacodynamie des immunosuppresseurs (activité calcineurine, IMPDH et mTOR/p70S6 kinase) a généré environ 4000 profils (soit 7 500 dosages ciblés). Le projet Immunosup Test a permis d’obtenir un brevet européen, Calci test, pour le développement du dosage de l’activité calcineurine, et un PHRC national pour évaluer l’intérêt du suivi de l’activité calcineurine pour l’adaptation de la posologie des immunosuppresseurs en transplantation pulmonaire. - Six projets de développement protéique, dont le projet ZAG de l’unité 1163 et le pro-jet TGF de l’unité 845, ont été réalisés et ont généré 1000 dosages ciblés. LE SOUTIEN À NOS MISSIONS La plateforme spectrométrie de masse L’encadrement de la plateforme est assuré par une biologiste du service de Biochimie Métabolomique et Protéomique, un ingénieur, recruté en 2013 par Imagine, chargé de renforcer les activités de développement et un ingénieur AP-HP qui rejoindra la plateforme en 2014 et qui sera en charge des activités de soins. Aucun personnel technique n’est affecté à la plateforme spectrométrie de masse; les activités de coordination générale de la plateforme et d’aide au développement de nouveaux dosages étant assurées par les responsables de la plateforme. L’appareil de haute sensibilité Xevo-TQS, acquis grâce au soutien de l’hôpital, de l’INEM et d’un financement SESAME, est plus spécifiquement utilisé pour les activités de développement. L’utilisation de cet appareil a été répartie à 50% pour l’INEM et Imagine et 50% pour l’AP-HP. En 2013, l’activité du Xevo-TQS a concerné le dosage d’activités enzymatiques, de protéines et de petites molécules et elle s’est répartie comme suit : Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 39 La plateforme dispose des technologies et équipements suivants : - Un Nano-RSLC associé à un Q Exactive Plus Orbitrap (Thermoscientifics) : acquis en 2013 et co-financé par Imagine - Un UPLC associé à un TQS Xevo (Waters) (partagé avec la Platforme Necker APHP MS) - Un MALDI TOF TOF Autoflex (Bruker) - Un Nano-HPLC associé à un Ion Trap HCTplus (Bruker) - Des équipements 1D and 2D PAGE (Biorad) - Un OFFgel Fractionator (Agilent) La plateforme a accès à : - Un Nano-RSLC associé à un Q Exactive Orbitrap (Thermoscientifics) (3P5, site Cochin) - Un Nano-RSLC associé à un LTQ Orbitrap Velos (Thermoscientifics) (3P5, site Cochin). Elle réalise des prestations de : - Conseil aux chercheurs et conception de stratégies sur mesure pour leurs projets - Identification de protéines pour des mélanges simples ou complexes - Identification et quantification de protéines (méthodes SILAC, ITRAQ, Labelfree) 40 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS Depuis 2011, la PPN a construit un fort partenariat avec la plateforme de spectrométrie de masse Necker-APHP pour développer des approches protéomiques translationnelles innovantes. Le parc d’équipements de la PPN comprend deux spectromètres de masse nouvelle génération dédiés à l’analyse à haut débit et la quantification de protéines. A travers ses activités de service, de collaboration et de recherche et développement, la PPN offre une expertise et une technologie des plus avancées pour aider à comprendre les maladies (modifications post translationnelles, protéomique différentielle et d’interaction) et développer des tests cliniques de diagnostic et pronostic par MS (protéomique translationnelle et ciblée). - Quantification absolue de protéines (méthodes MRM et PRM) - L’analyse statistique et bioinformatique de données (en utilisant principalement Mascot, Skyline, MaxQuant, et le logiciel Perseus) - Analyse de systems biologiques grâce à des graphiques de réseau de protéines (logiciels Ingenuity, AmiGO). Applications proposées : • Identification d’interactions nouvelle protéineprotéine, ARN-protéine, ADN-protéine • Identification et quantification de PTM, telles que l’acétylation et la phosphorylation • Etude du protéome différentiel global dans la maladie vs contrôle • Dosage multiplexé de protéines connues • Découverte et la validation de biomarqueurs • Contrôles de qualité des protéines recombinantes. PLATEFORME DE GÉNÉTIQUE TRANSLATIONNELLE LES MALADIES GÉNÉTIQUES RARES CONSTITUENT LA PREMIÈRE CAUSE DE CONSULTATIONS ET D’HOSPITALISATION SUR LE SITE DE L’HÔPITAL NECKER-ENFANTS MALADES. LA PLUPART DE CES MALADIES GÉNÉTIQUES SONT INVESTIGUÉES PAR LES ÉQUIPES DE RECHERCHE DE L’INSTITUT IMAGINE. Cependant, un nombre significatif de ces « cas génétiques » ne sont pas ne sont pas pris en compte et restent donc orphelins. C’est le cas pour les patients dont le tableau clinique, en général complexe, ne permet pas d’identifier un axe de recherche et donc une équipe concernée par Claude Besmond la pathologie ainsi décrite. C’est également le cas pour des patients présentant un tableau clinique pour lesquels les défauts géniques habituels ou plausibles ont déjà été recherchés sans succès par d’autres équipes de recherche. Le rôle de la plateforme de génétique translationnelle est d’identifier la cause génique de ces maladies génétiques qui restent non étiquetées. La plupart des cas qui nous sont adressés sont uniques et présentent le plus souvent un assemblage complexe de symptômes qui, pris dans leur globalité, ne peuvent pas être associés à un défaut génétique ou une maladie du développement déjà identifiés. Notre stratégie est basée sur des approches à haut débit comme l’éxome ou le séquençage du génome qui sont réalisés au sein de notre plateforme génomique dans l’Institut Imagine. L’analyse des données est réalisée en collaboration avec la plateforme de bioinformatique grâce à un algorithme créé en interne. Les profils génomiques issus de l’analyse éxomique sont stockés dans une base de données dédiée et rendus accessibles aux services cliniques et également aux équipes de recherche intéressées. La plateforme de génétique translationnelle se situe à l’interface entre i) les services cliniques de l’IHU, ii) les 32 centres de références maladies rares de l’hôpital NeckerEnfants Malades, iii) les laboratoires cliniques, iv) les équipes de recherche INSERM du site, v) la Fondation Maladies Rares et vi) les services cliniques ou équipes de recherche avec lesquels nous pourrions être amenés à collaborer dans le cadre des cas que nous étudions. La décision de référer des patients vers l’Équipe de Génétique Translationnelle se fait lors de réunions pluridisciplinaires au sein du Département de Génétique. Le bilan des études effectuées durant l’année 2013 indique que notre équipe atteint un taux de résolution de 50% des cas qui nous sont adressés, quel que soit le génotype phénotypique ou le mode de transmission. Nous avons ainsi pu étiqueter huit nouvelles maladies génétiques en relation avec des processus cellulaires tels que l’exosome, l’épissage, la glycosylation, les transports ioniques, ou avec des organites telles que la mitochondrie, le reticulum endoplasmique et l’appareil de Golgi. En conclusion, nous avons montré que les études réalisées au sein de la plateforme de Génétique Translationnelle permettent de i) de mieux caractériser la complexité génétique de maladies rares voire ultra-rares et ainsi d’acquérir une meilleure compréhension du développement humain précoce et ii) de fournir aux cliniciens la possibilité d’affiner le diagnostic clinique des patients concernés et d’assurer un service plus élargi à leur entourage. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 41 Séminaires dont Imagine a été partenaire en 2013 RENFORCEMENT DU PERSONNEL LES PERSONNES SUIVANTES ONT REJOINT IMAGINE EN 2013. Nom 42 Prénom work package SEMILOG (Association Séminaires de génétique à Necker) Séminaire Pierre Royer de génétique 18 et 19/03/2013 Association Robert Debré pour la recherche médicale Séminaire Pierre Royer de néphrologie pédiatrique 21/03/2013 AARCBP (Association pour l'Aide à la Recherche Clinique et Biologique en Pédiatrie) Séminaire d'immunologie, d'hématologie et de rhumatologie pédiatriques Séminaire Pierre Royer 05 au 07/07/2013 AMPS (Association Médecine Pharmacie) 2e Congrès de l'AMPS 04/10/2013 Institut Cochin - APEMM (Association de prévention et d'Etudes des Maladies Moléculaires) 30e journée scientifique de l'Hôpital Cochin 09/10/2013 Association Jeunes Chercheurs et Avenir 9e Congrès des jeunes chercheurs en biologie - Prix René Descartes Emploi occupé BANAL Céline WP1 Technicienne de laboratoire BOUJEMAOUI Malika WP1 Technicienne d’études clinique ALIBEU Olivier WP2 Assistant ingénieur FRIGO Amandine WP2 Assistant ingénieur BENHAMOU Jonathan WP3 Assistant ingénieur BOSCHAT Anne-Claire WP3 Ingénieur d’études ELGANFOUD Nadia WP3 Ingénieur d’études PANAFIEU Emilie WP3 Technicienne de laboratoire SCHIAVONE Séverine WP3 Assistant ingénieur BERDJANE-BROUK Zohra WP4 Technicienne d’études clinique BLONDEAU Johanna WP4 Ingénieur d’études BUFFET Isabelle WP4 Chef de projet recherche clinique MAGNANI Alessandra WP5 Post-doctorant MASCHALIDI Sofia WP5 Post-doctorant METODIEV Metodi WP5 Post-doctorant NGUYEN Lam Son WP5 Post-doctorant CHARBIT-HENRION Fabienne WP6 Doctorant DE ALMEIDA GONCALVES Maria Sara WP6 Doctorant MOREL Alexandre WP6 Doctorant CHIOCCARELLO Amélie WP8 Juriste DE DRWESKI Hélène WP8 Assistante de direction DUPONT Marie-Françoise WP8 Responsable comptable MARLEIX Sophie WP8 Assistante technique NAZANERO Wilfredo WP8 Agent de nettoyage RANNAUD Marie WP8 Chargée de communication SY Moussa WP8 Technicien de maintenance ANDRIAMANGA Chantal WP9 Attaché de recherche clinique BIZET Albane WP9 Post-doctorante BOUCHERIT Soraya WP9 Médecin recherche clinique BRASSIER Anaïs WP9 Médecin Rédacteur FILHOL Emilie WP9 Ingénieur d’études GUIBBAL Laure WP9 Ingénieur d’études HOLLEBECQUE Simon WP9 Technicien de laboratoire LEMALE Julie WP9 Médecin Rédacteur NIEL Olivier WP9 Post-doctorant Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 14 et 15/03/2013 LE SOUTIEN À NOS MISSIONS ANIMATION ET RAYONNEMENT SCIENTIFIQUE Discussions scientifiques organisées à l’Institut en 2013 Jean Gachignard Jean-Pierre Hugot 24/01/2013 Maladie de Crohn et mycobactéries Emmanuelle Jouanguy 14/02/2013 Prédisposition génétique à l'Epidermodysplasie verruciforme Anita Burgun 07/03/2013 Entrepôt de données Zakia Belaid-Choucair 04/04/2013 La Neuropilin-1 (NRP-1), un nouveau co-récepteur de la Leptine. Pierre Quartier 25/04/2013 « Forme systémique d’Arthrite Juvénile Idiopathique (maladie de Still de l’enfant), avancées en recherche clinique, comment progresser sur la physiopathologie ? » Rana Abou-Khalil 27/06/2013 "Role of Skeletal Muscle During Bone Regeneration" Sylviane PACHECO Julie Steffann 04/07/2011 Au6delà des limites de la PCR quantitative avec la Droplet Digital PCR Bio-Rad : Quantification d'ADN et d'ARN rares, étude de CNV, single cell PCR et autres applications Emmanuel Martin 11/07/2013 Inherited cytidine nucleotide triphosphate synthetase 1 deficiency in humans reveals a central role of CTPS1 induction in activated T lymphocytes proliferation. N. Garcelon/ R. Salomon 10/10/2013 Point entrepôts de données Alexandra Henrion-Caude 07/11/2013 Revisiting old knowledge in an RNA world Stéphanie Tomé, PhD 05/12/2013 Rôle du MMR dans l'instabilité des répétitions de triplets pathologiques Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 43 Mars 2013 Fin du hors d’eau – hors d’air Mai 2013 Début des Opérations Préalables à la Réception Octobre 2013 Commission de sécurité favorable 3 décembre 2013 Réception du bâtiment et remise des clés 19 décembre 2013 Fiesta Prima (inauguration interne) 09/10/2013 Association Jeunes Chercheurs et Avenir Rappel du financement du bâtiment NOUVEAU BÂTIMENT : UN CHANTIER ABOUTI DANS LES DELAIS ET LE BUDGET VUE DU BÂTIMENT AU CROISEMENT DE LA RUE DU CHERCHE-MIDI ET DU BOULEVARD DU MONTPARNASSE Ministère de la Santé 20 000 000 € Assistance Publique-Hôpitaux de Paris 12 500 000 € Imagine 12 360 000 € Région Ile-de France 9 000 000 € Inserm 3 000 000 € Département de Paris 2 000 000 € Ministère de la Recherche 1 140 000 € Total 60 000 000 € LE SOUTIEN À NOS MISSIONS Dates clés de la réalisation du bâtiment JARDIN DE L’ATRIUM , OÙ PATIENTENT LES FAMILLES VENUES POUR CONSULTER 2013 MARQUE L’ACHÈVEMENT DE LA CONSTRUCTION DU BÂTIMENT DE L’INSTITUT. LA VOLONTÉ DE RAPPROCHER MÉDECINS, PATIENTS ET CHERCHEURS EST PARFAITEMENT INCARNÉE DANS LES PARTIS-PRIS ARCHITECTURAUX. JEAN NOUVEL ET BERNARD VALÉRO, ARCHITECTES DE L’INSTITUT, ONT SU PARFAITEMENT TRADUIRE L’ESPRIT DU PROJET ET LES ESPOIRS QU’IL NOURRIT EN CONCEVANT UN LIEU PROPICE À DES RENCONTRES FÉCONDES ENTRE DIFFÉRENTES DISCIPLINES, MÉTHODES ET CULTURES PROFESSIONNELLES ; MAIS AUSSI ENTRE LES FAMILLES ET LA COMMUNAUTÉ MÉDICALE ET SCIENTIFIQUE. 44 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 45 NOTRE GOUVE RNANCE 46 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 47 Conseil d’administration Le conseil d’administration de la Fondation est composé des représentants des membres fondateurs, des représentants élus des enseignants et des chercheurs et de personnalités qualifiées choisies par les fondateurs en raison de leur compétence dans le domaine d’activité de la Fondation. NOTRE GOUVERNANCE L’INSTITUT IMAGINE EST PORTÉ PAR UNE FONDATION DE COOPÉRATION SCIENTIFIQUE (FCS) CRÉÉE EN 2007. CETTE STRUCTURE PRIVÉE PERMET À DES ACTEURS PUBLICS DE S’ALLIER À DES ACTEURS PRIVÉS ET DE GÉRER DES FONDS À LA FOIS PUBLICS ET PRIVÉS, CE QUI EST ABSOLUMENT NÉCESSAIRE POUR ACCÉLÉRER LA RECHERCHE SUR LES MALADIES GÉNÉTIQUES. Ce statut a donc été choisi pour apporter un maximum de souplesse de fonctionnement et de réactivité, pour pouvoir associer le meilleur du domaine public et du secteur privé. La gouvernance de l’Institut repose sur quatre instances aux fonctions bien définies: le conseil d‘administration, le comité de direction, le conseil d’institut hospitalo-universitaire (IHU) et le conseil scientifique international (ou Scientific Advisory Board, SAB). Nous vous en présentons ici les principales orientations de l’année 2013. NOTRE GOUVERNANCE Nos instances : faits marquants 2013 Les 6 membres fondateurs de l’Institut Le conseil d’administration a été réuni deux fois en 2013, le 19 juin et le 28 novembre. Le mandat du commissaire aux comptes, KPMG, a été renouvelé pour 6 ans. Les représentants des enseignants et des chercheurs, au nombre de trois depuis la modification des statuts en 2011, ont été renouvelés. Laurent ABEL a été réélu. Alain HOVNANIAN et Frédéric RIEUX-LAUCAT ont fait leur entrée au conseil. Le mandat de Stéphane FOUKS, en qualité de personnalité qualifiée, est arrivé à son terme. Trois sièges de personnalité qualifiée sont désormais vacants. Comité de direction Institut Imagine LE CONSEIL SCIENTIFIQUE INTERNATIONAL (SAB) LE COMITÉ DE DIRECTION LE CONSEIL D’IHU - Directeurs de laboratoires -D irecteurs des plateformes scientifiques -M embres élus 48 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 LE CONSEIL D’ADMINISTRATION DE LA FONDATION Le comité de direction est composé de neuf membres, médecins et chercheurs. Il définit les grandes orientations du projet et la mise en œuvre du plan opérationnel, tant sur les évolutions à apporter aux laboratoires que sur le développement des outils nécessaires à la recherche, et les moyens à déployer pour accélérer la mise en œuvre des essais cliniques. Il conduit le recrutement des nouvelles équipes, décide de l’organisation et de la stratégie de l’enseignement, la valorisation, la recherche clinique, la communication et la levée de fonds. Il s’est réuni 17 fois en 2013 sous la direction d’Alain FISCHER et a modifié le règlement intérieur de l’Institut. Une attention particulière a été accordée à la mutualisation des ressources et aux procédures de prise de décision fondées sur la collégialité. Les 5 unités mixtes de recherche Inserm et Université Paris Descartes et l’équipe CNRS Université au fondement de l’Institut seront regroupées en une seule unité mixte de recherche Inserm Université « Imagine – Institut des maladies génétiques » 1163 au 1er janvier prochain, organisée en laboratoires. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 49 RAPPORT ANNUEL DU TRÉSORIER SUR LES COMPTES - EXERCICE 2013 NOTRE GOUVERNANCE Nos finances Conseil d’IHU Il rassemble les directeurs des 23 laboratoires de recherche que compte Imagine afin d’échanger sur les grandes orientations scientifiques et les outils de la recherche. Le 19 septembre, des élections ont permis aux enseignants et chercheurs, doctorants et post-doctorants, aux ingénieurs, techniciens et personnels administratifs de désigner leurs représentants. Ils participent aux réunions du conseil d’IHU avec les directeurs de laboratoire. Le conseil d’IHU s’est réuni 3 fois en 2013 aux fins de promouvoir « l’esprit d’Institut » et de rassembler les directeurs de laboratoire et les représentants des personnels dans la perspective de l’ouverture du bâtiment en début d’année 2014. Les représentants des enseignants et des chercheurs sont Isabelle ANDRE-SCHMUTZ, Jacinta BUSTAMANTE, Emmanuelle JOUANGUY, Laurence LEGEAI-MALLET, Capucine PICARD et Anne PUEL. Les représentants des doctorants et post-doctorants sont Anthony DRECOURT, Julien ETTERSPERGER, Antoine GUERIN, Flavia GUILLEM, Maéva LANGOUËT et Sofia MASCHALIDI. Les représentants des ingénieurs, techniciens et personnels administratifs sont Corinne de CHAPPEDELAINE, Melinda DEJEAN, Meriem GARFA-TRAORE, Corinne LEBRETON, Anna PELET et Olivier PELLE. Conseil scientifique international (SAB) Le SAB se compose d’éminents scientifiques mondialement reconnus. Il apporte des éclairages au conseil d’administration et au comité de direction sur l’ensemble du projet de l’Institut. Suite au premier appel à candidatures international en 2012, le Conseil scientifique international (SAB) avait recommandé un appel à candidatures spécifique pour la recherche en bioinformatique. Il a été publié en mars 2013. Seize candidatures ont été adressées. Stylianos ANTONARAKIS, Aravinda CHAKRAVARTI et Pierre CHAMBON, membres du SAB, ont auditionné les 50 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 candidats le 14 octobre. L’appel à candidatures a été déclaré infructueux suite au désistement de la lauréate qui a rejoint IBM Research. Un nouvel appel général à candidatures a été publié en novembre 2013. Elizabeth BLACKBURN a présidé une réunion le 21 novembre sur l’évolution du SAB. Conformément au renouvellement prévu dans les statuts, les mandats d’Éric OLSON et Emil UNANUE ont pris fin. Trois nouvelles personnalités scientifiques internationales seront installées en 2014 lors de la Conférence scientifique inaugurale prévue en octobre 2014. IL S’EST AGI DU SIXIÈME EXERCICE D’IMAGINE. UN APPEL À CANDIDATURES A ÉTÉ LANCÉ EN 2013 POUR PROCÉDER AU RENOUVELLEMENT DU COMMISSAIRE AUX COMPTES. NOTRE CONSEIL A CHOISI LORS DE SA SÉANCE DU 28 NOVEMBRE DERNIER DE RENOUVELER KPMG POUR UN NOUVEAU MANDAT DE SIX ANS. L’exercice 2012 devait être le dernier avant l’ouverture de l’Institut des maladies génétiques, prévue en 2013. L’emménagement des laboratoires et des plateformes technologiques a finalement été repoussé en début d’année 2014 après la remise des clefs le 6 décembre 2013. L’analyse globale des comptes 2013 fait ressortir les chiffres suivants. Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 51 Le compte de résultat Pour mémoire, le bilan est un état de synthèse qui permet de décrire en terme d´emplois et de ressources la situation patrimoniale d’Imagine à la date de clôture des comptes, soit le 31 décembre 2013. Il s’équilibre, à cette date, à la somme de 21.119.945 euros (+18% par rapport au 31 décembre 2012). Après une baisse de 23% de l’exercice 2011 à l’exercice 2012, nous témoignons ainsi d’une redressement de la situation patrimoniale d’Imagine, compte tenu notamment de la fin du plan de financement de l’Institut pour lequel Imagine a particulièrement contribué. Au 31 décembre 2013, le patrimoine d’Imagine se décompose ainsi : Pour mémoire, le compte de résultat recense l’ensemble des flux qui modifient positivement ou négativement le patrimoine d’Imagine en 2013 avec des produits qui génèrent de la richesse et des charges qui en détruisent. Le compte de résultat d’Imagine se présente comme suit : roduits : 17.170.698 (contre 15.710.944 en 2012), -P -C harges : 14.395.298 (contre 14.813.385 en 2012). Actif net Passif net 1. Actifs immobilisés : 8.877.645 (+53%) (représentant notamment les équipements des plateformes technologiques) 3. Fonds associatifs : 11.560.290 (-7%) (dotation initiale et complémentaire, résultat de l’exercice et subventions d’investissement) 2. Actif circulant : 12.242.299 (-8%) (représentant les valeurs mobilières de placement et les créances) 4. Fonds dédiés : 6 617.700 (+32%) (sur subventions de fonctionnement) 5. Dettes : 2.941.954 (+154%) (concours bancaires, dettes fournisseurs, dettes fiscales et sociales) Actifs immobilisés Imagine poursuit son effort d’investissement sur les plateformes technologiques indispensables aux scientifiques pour mener à bien leurs recherches. Des équipements ont été acquis en 2012 pour un montant total de près de 6 millions d’euros. Cet effort exceptionnel est lié à l’opération d’équipement de l’Institut des maladies génétiques. Actif circulant L’actif circulant reste stable. Le choix des placements financiers n’est pas large dans un contexte de taux de placement historiquement bas. Le contrat de capitalisation Neuflize recueille désormais la totalité de la dotation initiale d’Imagine (4,2 millions au 31 décembre 2012). Fonds associatifs Les fonds associatifs avaient diminué de 32% en 2012. La perte est réduite à 7% en 2013 grâce à la fin du plan de financement de la construction du bâtiment et au conséquent résultat de l’exercice de 2,8 millions d’euros. L’effort de reconstitution de la dotation (4,1 millions au 31 décembre 2012) doit être poursuivi conformément aux recommandations de notre conseil. Une proposition de réallocation de 2 millions d’euros à la dotation vous sera proposée afin de respecter l’engagement de reconstitution de la dotation. L’excédent de l’exercice est donc de 2.775.400 euros contre 897.558 en 2012. Produits 2013 Les produits d’Imagine sont passés de 15,7 millions en 2012 à 17,2 millions en 2013. Ils se décomposent en produits d’exploitation, en produits financiers et produits exceptionnels. Les produits d’exploitation passent de 15 millions en 2012 à 11,4 millions en 2013. Si les subventions d’exploitation versées à Imagine (CPER et IHU) augmentent conséquemment dans le contexte de l‘aménagement de l’Institut des maladies génétiques, les produits issus de la dotation d’Imagine diminue dans le contexte de la dernière annuité du plan de financement de la construction de l’Institut des maladies génétiques. Les produits financiers continuent à diminuer en 2013 (-25%) dans un contexte de morosité générale des marchés monétaires. Une solution nouvelle de diversification a été mise en œuvre avec la société de prêt entre particuliers Prêt d’Union. Notre conseil historique Neuflize OBC élabore une offre de placement qui sera déployée sur le second semestre 2014. Le contrat de capitalisation en cours a permis de générer 0,2 million d’euros de produits financiers qui ne seront versés qu’au retrait des capitaux. Les produits exceptionnels sont augmentés par les engagements à réaliser sur ressources affectées (6,9 millions en 2013 contre 4,5 en 2012). NOTRE GOUVERNANCE Le bilan Charges 2013 Parallèlement à l’augmentation conséquente des produits, les charges d’Imagine ont diminué de 14,8 millions en 2012 à 14,4 en 2013. La relative stabilité des dépenses d’exploitation d’Imagine correspond à la poursuite de la montée en charge des activités d’Imagine, à travers le recrutement de nouveaux personnels (Effectif total en 2013 : 64 personnes physiques soit 3 fois plus qu’en 2012, pour un montant total de dépenses de 1,8 millions d’euros) tempéré par le dernier versement de la subvention de 2,8 millions à l’AP-HP pour la construction de l’Institut des maladies génétiques (contre 8 millions d’euros en 2012). Nous poursuivons en 2014 notre politique de gestion financière prudente et attentive. La politique de levée de fonds et les partenariats internationaux sont mis en œuvre pour obtenir de nouvelles sources de financement des activités de recherche. Fonds dédiés Le report de fonds dédiés sur l’exercice suivant passe de 4.503.039 à 6.617.700 euros. Imagine respecte en cela l’obligation de report des ressources du programme IHU non consommées sur les exercices 2012 et 2013 sur les exercices suivants pour remplir les missions scientifiques des programmes de recherche constitués en work packages. Dettes Les dettes comptabilisées au 31 décembre 2013 se montent à près de 3 millions d’euros dont une part importante de 2,5 millions auprès des fournisseurs et de l’administration fiscale. Le tout est bien évidemment régularisé dès 2014. 52 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 53 NOTRE GOUVERNANCE Bilan social Evolution des effectifs. Année 2013. 60 POUR LA DEUXIÈME ANNÉE CONSÉCUTIVE, IMAGINE A RÉALISÉ SON BILAN SOCIAL. LES EFFECTIFS ONT DOUBLÉ EN UN AN EN PASSANT DE 24 À 48 SALARIÉS IMAGINE. ILS SERONT AMENÉS À CROÎTRE ENCORE AVEC L’ARRIVÉE DE NOUVELLES ÉQUIPES SCIENTIFIQUES SUITE À L’APPEL À D’OFFRE INTERNATIONAL PUBLIÉ À L’INITIATIVE DU CONSEIL SCIENTIFIQUE INTERNATIONAL DE L’INSTITUT. 50 40 30 20 10 EFFECTIFS Nombre de salariés au 31/12/2012 : 24 Nombre de salariés au 31/12/2013 : 48 Nombre d’équivalent temps plein (ETP) au 31/12/2013 : 43,9 Nombre d’ETP moyen pour 2013 : 23,8 Ao ût Se pt em br e Oc to br e No ve m br e Dé ce m br e n lle t Ju i Ju i ai M Av ril ar s M Fé vr ier Ja n vie r 0 Nombre de salariés Répartition des salariés 31% 69% 45,8% 54,2% Femmes Hommes CDD CDI Nationalité des salariés 5% 6% Française Union européenne 89% 54 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Hors union européenne Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 55 Répartition des salariés par contrat Age moyen 36,04 35 Age moyen des hommes 39,41 30 Age moyen des femmes 33,92 25 21 20 CDD 15 Pyramide des âges 12 5 55 - 60 50 - 54 45 - 49 40 - 44 35 - 39 30 - 34 25 - 29 20 - 24 CDI 5 10 0 10 Femmes Hommes Répartition des salariés par work-packages (programme IHU) WP 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 1 Femmes 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 Développement des cohortes 6% WP2 Développement des plateformes génomiques et bioinformatiques 14 % WP3 Renforcement de la phisyopathologie et développement de nouveaux outils diagnostics / biomarqueurs 10 % WP4 Développement des thérapies innovantes 10 % WP5 Recrutement de nouveaux talents 10 % WP6 Développement des programmes de formation 8% WP7 Sciences humaines et sociales 0% WP8 Support services 22 % WP9 Fonds dédiés 21 % Ancienneté des salariés 10 9 8 7 6 5 4 3 % salariés WP1 Hommes Nombre de salariés Thématique NOTRE GOUVERNANCE Age des salariés en 2013 Taux d’absentéisme en 2013 2 1 0 1 2 mois 3 4 6 7 9 10 15 18 20 21 23 26 31 Jours de travail Jours d’absence Taux absentéisme 7.179 111 1,50 % 36 40 49 53 60 Répartition des salariés par statut 34,9% Cadre Non cadre 65,1% 56 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 57 NOTRE GOUVERNANCE Communication et levée de fonds IL EST ESSENTIEL POUR IMAGINE DE BÉNÉFICIER D’UNE NOTORIÉTÉ À LA HAUTEUR DE SON EXPERTISE ET DE SON AMBITION, AFIN DE POUVOIR DONNER À LA RECHERCHE TOUS LES MOYENS D’ACCÉLÉRER LA DÉCOUVERTE DE NOUVEAUX DIAGNOSTICS ET DE TRAITEMENTS INNOVANTS POUR LES PATIENTS. L’INSTITUT EST RECONNAISSANT ENVERS SES PARTENAIRES ET MÉCÈNES QUI SE SONT MOBILISÉS À SES CÔTÉS, AVANT MÊME L’INCARNATION DU PROJET DANS UN BÂTIMENT UNIQUE. Un carré Hermès aux couleurs d’Imagine La maison Hermès s’est engagée aux côtés de l’Institut Imagine, avec qui elle partage des valeurs de créativité, d’innovation et d’excellence, en créant une édition limitée du carré Circuit 24 Faubourg. Les maillons dessinés sur ce célèbre carré symbolisent les liens de solidarité entre Hermès, les amoureux du carré et l’Institut ; mais aussi l’ADN, dont la compréhension des maillons permet-tra aux chercheurs et médecins d’Imagine de diagnostiquer et guérir des maladies génétiques. 322 carrés de cette édition particulière ont été vendus du 30 juin au 10 septembre 2013 par souscription. L’Institut est également reconnaissant envers la chanteuse Kylie Minogue, qui a souhaité afficher son soutien à Imagine en posant, parée du fameux carré, pour la presse. Les bénéfices de cette opération permettront à l’Institut de financer ses travaux de recherche. LES ACTIONS DE LEVÉE DE FONDS IMAGINE EN 2013 Un premier grand mécène En 2013, grâce au soutien de la Fondation Bettencourt Schueller, Imagine a aménagé, dans des conditions optimales pour les utilisateurs, un centre de séminaires de 183 places, au 6e étage de l’Institut. Ce centre de séminaires a pour vocation le partage et la transmission des savoir-faire et des connaissances ; séminaires scientifiques internationaux, cours d’écoles doctorales, événements.. Depuis sa création il y a 25 ans par André et Liliane Bettencourt et leur fille Françoise Bettencourt Meyers, la Fondation Bettencourt Schueller « donne des ailes au talent » pour contribuer au rayonnement de notre pays. Dans cet esprit cohérent avec son statut d’utilité publique, elle s’est donné trois missions : faire reculer les frontières du savoir dans les sciences de la vie pour améliorer la santé ; révéler les talents et transmettre les savoir-faire dans les métiers d’art ; favoriser la réussite éducative ainsi que l’insertion et la qualité de vie des personnes handicapées ou éloignées de l’emploi. Tombola avec le Comité du Faubourg Saint-Honoré Comme l’année dernière, Imagine s’est associé au Comité du Faubourg Saint-Honoré pour organiser une tombola de luxe, au profit de la recherche sur les maladies génétiques. Du 15 novembre au 15 janvier, plus de 50 lots offerts par les maisons de luxe du Comité du Faubourg Saint-Honoré ont été mis en jeu avec des billets de tombola d’une valeur de 10€. Le lancement des illuminations des rues membres du Comité a été l’occasion d’une grande soirée à l’Eclaireur pour le lancement de cette deuxième édition de la tombola Imagine Noël. Un noel sous le signe de l’excellence Tentez votre chance ! Du 15 novembre 2012 au 5 janvier 2013, des lots exceptionnels offerts par les Maisons du Faubourg Saint Honoré sont à gagner sur : www.excellencespournoel.fr Ce jeu est organisé par Imagine avec le soutien du comité du Faubourg-Saint-Honoré. L’intégralité des bénéfices sera versée directement à la Fondation Imagine. Le règlement est déposé chez la SCP Yves de Forcade la Roquette et Gaëlle Contentin, Huissiers de Justice, 7 rue de la Garenne - 92310 Sèvres. Le tirage au sort aura lieu sous son contrôle le 9 janvier 2013 en son étude à Sèvres. Flyer-IMAGINE-Noel-FSH-100x150mm-ok.indd 1 58 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 08/11/12 19:32 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 59 « Le cheval a du cœur » : une journée sur les maladies rares Les chaînes de télévision Le Trot et Equidia se sont mobilisées, le dimanche 20 janvier 2013, pour organiser une journée de sensibilisation auprès du grand public sur les maladies rares à l’hippodrome de Paris-Vincennes. Cette journée a été organisée au profit de la recherche menée par les équipes d’Imagine, l’Institut des maladies génétiques, sur 4 maladies : albinisme, cardiomyopathie, incontinentia pigmenti et dysplasie ectodermique. Au programme, du sport hippique bien entendu, avec 9 courses de trot dont 5 courses au nom des associations et d’Imagine mais aussi de nombreux spectacles et animations entre les cour-ses. Le parrain d’Imagine, Teddy Riner, était également présent lors de cette grande journée de mobilisation, pour soutenir l’Institut. Le public, composé à la fois des passionnés de courses, mais aussi de familles venues profiter de toutes les animations offertes par l’hippodrome, est venu nombreux. Les enchères montent pour Imagine avec le LYCEUM Club de Paris Le LYCEUM Club de Paris a décidé de soutenir l’Institut en organisant notamment le 10 décembre 2013, une vente aux enchères au profit d’Imagine à l’hôtel Kergorlay Langsdorff à Paris, en présence de Pierre Cornette de St Cyr. Cette vente a permis de récolter 11 000 € au profit d’Imagine. DÉMO organise un nouveau marché de Noël au profit de la recherche Ramer pour collecter : Imagine a relevé le défi ! Lors du défi rameur du 22 juin 2013, une équipe sportive Imagine a permis de récolter 6000 € pour l’Institut grâce à cet événement organisé par MM Sport. Merci à Olivier HERMINE, Moussa SY, Guillaume HUART, Aude MAGERUS CHATINET, Thierry HIEU et Coath pour leurs efforts et leur esprit d’équipe ! L’association DÉMO (Défis Espoirs pour les Maladies Orphelines), est un groupe de bénévoles unis autour d’une famille dont le fils est atteint d’une maladie orpheline. DÉMO a été créée pour organiser des manifestations et animations en faveur de la recherche et des soins sur les maladies orphelines. L’évènement phare de l’année est le marché de Noël, organisé dans la commune de Corcoué-sur-Logne (44) où DÉMO a vu le jour. Depuis 2009, les bénéfices de ce marché sont reversés à l’Institut Imagine. Cette année, la mobilisation de DÉMO a permis de récolter 5000 € pour l’Institut. NOTRE GOUVERNANCE LES ACTIONS DE LEVÉE DE FONDS RÉALISÉES PAR DES TIERS EN 2013 LES PARTENAIRES 2013 Des réseaux mobilisés pour Imagine Ebay France choisit Imagine pour l’opération « un cadeau est un don » Du 26 novembre au 25 décembre, Ebay France a organisé « un cadeau est un don », une grande vente au profit de 4 associations et fondations dont l’Institut Imagine. De nombreux cadeaux ont été vendus en ligne au profit de l’Institut, des cadeaux offerts par Ebay mais aussi des objets dédicacés par des célébrités françaises, par notre parrain Teddy Riner et des golfeurs renommés. 60 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Le LYCEUM Club International est un club pour les femmes s’intéressant aux arts, aux lettres, aux sciences, aux problèmes sociaux et à la promotion continue du savoir. La Fédération Françai-se du Lyceum Club International a été créée en 1963. Elle fait partie de L’association Internationa-le des Lyceum Club. L’Institut Imagine est soutenu par le LYCEUM Club de Paris qui est présidé par Madame Véronique Mattéoli de Rode. l’action en faveur de la jeunesse, ou la collecte de fonds. Le Rotary Club de Paris est un soutien important pour Imagine. Un appui visible en ligne : une présentation du projet d’Imagine et des différentes manières de le soutenir est proposée aux visiteurs sur la page d’accueil du Rotary Club de Paris. Le Rotary Club de Paris, qui vient de fêter son 91ème anniversaire, compte 245 membres. Il est présidé par un président élu pour un an, et dirigé par un comité de 14 membres. Ses 19 commissions agissent dans des domaines aussi variés que l’action sociale, l’action internationale, Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 61 NOTRE GOUVERNANCE DANS LES COULISSES DE L’INSTITUT : UNE INAUGURATION INTERNE 2013 A BEAUCOUP MOBILISÉ LES ÉQUIPES POUR PRÉPARER L’EMMÉNAGEMENT DANS LE NOUVEAU BÂTIMENT DE L’INSTITUT. L’ÉQUIPE DE COMMUNICATION A DONC ORGANISÉ, EN COLLABORATION AVEC LES DIFFÉRENTES STRUCTURES, UNE PREMIÈRE INAUGURATION RÉSERVÉE AUX ÉQUIPES EN DÉCEMBRE 2013. LA « FIESTA PRIMA » A RÉUNI 400 PERSONNES DANS UNE AMBIANCE CHALEUREUSE, POUR UNE SOIRÉE MARQUÉE PAR PLUSIEURS ANIMATIONS, DONT L’EXPOSITION DES PORTRAITS RÉALISÉS GRACIEUSEMENT PAR LAURENT ATTIAS ET LA PROJECTION D’ŒUVRES NUMÉRIQUES DANS L’ATRIUM. 62 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 63 NOS PUBLIC ATIONS SCIENTIFIQU ES 64 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 65 Articles originaux publiés en 2013 1 .ABADIE V, COULY G. Congenital feeding and swallowing disorders. Handb Clin Neurol. 2013;113:1539-49. 2. Abadie V; Vaivre-Douret L; Lasserre. Psychomotor and cognitive impairments of children with CHARGE syndrome: Common and variable features, Child Neuropsychol. E 2013 ; 449-46519.C 2,243 100 3. ABISROR N, MEKINIAN A, LACHASSINNE E, NICAISE-ROLAND P, DE PONTUAL L, CHOLLET-MARTIN S, BODDAERT N, CARBILLON L, FAIN O. Autism spectrum disorders in babies born to mothers with antiphospholipid syndrome. Semin Arthritis Rheum. 2013 Dec; 43(3):348-51. 4. A L A I N S, R E V E S T M, V E Y E R D, E S S I G M, R E R O L L E S J P, RAWLINSON W, MENGELLE C,HUYNH A, KAMAR N, GARRIGUE I, KAMINSKI H, SEGARD C, PRESNE C, MAZERON MC, AVETTANTFENOËL V, LECUIT M, LORTHOLARY O, COAQUETTE A, HANTZ S, LERUEZ-VILLE M, PLOY MC. Maribavir use in practice for cytomegalovirus infection in French transplantation centers. Transplant Proc. 2013 May; 45(4):1603-7. 5. ALBY C, BESSIERES B, BIETH E, ATTIE-BITACH T, FERMONT L, CITONY I, RAZAVI F, VEKEMANS M, ESCANDE F, MANOUVRIER S, MALAN V, AMIEL J. Contiguous gene deletion of TBX5 and TBX3 leads to a varible phenotype with combined features of Holt-Oram and ulnar-mammary syndromes. Am J Med Genet A. 2013 Jul; 161A (7):1797-802. 6. ALDAVE JC, CACHAY E, NUNEZ L, CHUNGA A, MURILLO S, CYPOWYJ S, BUSTAMANTE J, PUEL A, CASANOVA JL, KOO A. A 1-year-old girl with a gain-of-function STAT1 mutation treated with hematopoietic stem cell transplantation. 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Genotoxic signature in cord blood cells of newborns exposed in utero to a Zidovudine-based antiretroviral combination, J Infect Dis. 2013 Jul 15;208(2):235-43. 66 Imagine • RAPPORT D’ACTIVITÉ 2013 10. ANGULO I, VADAS O, GARÇON F, BANHAM-HALL E, PLAGNOL V, LEAHY TR, BAXENDALE H, COULTER T, CURTIS J, WU C, BLAKEPALMER K, PERISIC O, SMYTH D, MAES M, FIDDLER C, JUSS J, CILLIERS D, MARKELJ G, CHANDRA A, FARMER G, KIELKOWSKA A, CLARK J, KRACKER S, DEBRÉ M, PICARD C, PELLIER I, JABADO N, MORRIS JA, BARCENAS-MORALES G, FISCHER A, STEPHENS L, HAWKINS P, BARRETT JC, ABINUN M, CLATWORTHY M, DURANDY A, DOFFINGER R, CHILVERS ER, CANT AJ, KUMARARATNE D, OKKENHAUG K, WILLIAMS RL, CONDLIFFE A, NEJENTSEV S. Phosphoinositide 3-kinase δ gene mutation predisposes to respiratory infection and airway damage, Science. 2013 Nov 15; 342(6160):866-71. 18. BAHI-BUISSON N, SOUVILLE I, FOURNIOL FJ, TOUSSAINT A, MOORES CA, HOUDUSSE A, LEMAITRE JY, POIRIER K, KHALAFNAZZAL R, HULLY M, LEGER PL, ELIE C, BODDAERT N, BELDJORD C, CHELLY J, FRANCIS F. SBH-LIS European Consortium. New insights into genotype-phenotype correlations for the doublecortinrelated lissencephaly spectrum. Brain. 2013 Jan;136(Pt 1):223-44. 11. ARENDRUP MC, BOEKHOUT T, AKOVA M, MEIS JF, CORNELY OA, LORTHOLARY O. THE ESCMID EFISG STUDY GROUP AND ECMM, ARIKAN-AKDAGLI S, CUENCA-ESTRELLA M, DANNAOUI E, VAN DIEPENINGEN AD, GROLL AH, GUARRO J, GUINEA J, HOPE W, LACKNER M, LAGROU K, LANTERNIER F, LASS-FLÖRL C, MELETIADIS J, M U N OZ P, PAG A N O L , R I C H A R D S O N M D, R O I L I D E S E , TORTORANO AM, ULLMANN AJ. ESCMID/ECMM. Joint Clinical Guideline for the Diagnosis and Management of Rare Invasive Yeast Infections. Clin Microbiol Infect. 2013 Sep 18. [Epub ahead of print] 20. 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BERGLUND LJ, AVERY DT, MA CS, MOENS L, DEENICK EK, BUSTAMANTE J, BOISSON-DUPUIS S, WONG M, ADELSTEIN S, ARKWRIGHT PD, BACCHETTA R, BEZRODNIK L, DADI H, ROIFMAN CM, FULCHER DA, ZIEGLER JB, SMART JM, KOBAYASHI M, PICARD C, DURANDY A, COOK MC, CASANOVA JL, UZEL G, TANGYE SG. IL-21 signalling via STAT3 primes human naive B cells to respond to IL-2 to enhance their differentiation into plasmablasts. Blood. 2013 Dec 5;122(24):3940-3950. 29. BERNARD C, MAUCORT-BOULCH D, VARRON L, CHARLIER C, SITBON K, FREYMOND N, BOUHOUR D, HOT A, MASQUELET AC, VALEYRE D, COSTEDOAT-CHALUMEAU N, ETIENNE M, GUEIT I, JOUNEAU S, DELAVAL P, MOUTHON L, POUGET J, SERRATRICE J, BRION JP, VAYLET F, BREMONT C, CHENNEBAULT JM, JAFFUEL S, BROUSSOLLE C, LORTHOLARY O, SÈVE P. French Cryptococcosis Study Group. Cryptococcosis in sarcoidosis: cryptOsarc, a comparative study of 18 cases. QJM. 2013 Jun; 106(6):523-39. 30. BERTRAND D, DESBUISSONS G., PALLET N., SARTORIUS A., LEGENDRE C., MAMZER M-F., SBERRO-SOUSSAN R. 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SATGÉ D, STILLER CA, RUTKOWSKI S, VON BUEREN AO, LACOUR B, SOMMELET D, NISHI M, MASSIMINO M, GARRÉ ML, MORENO F, HASLE H, JAKAB Z, GREENBERG M, VON DER WEID N, KUEHNI C, ZURRIAGA O, VICENTE ML, PERIS-BONET R, BENESCH M, VEKEMANS M, SULLIVAN SG, RICKERT C. A very rare cancer in Down syndrome: medulloblastoma. Epidemiological data from 13 countries. J Neurooncol. 2013 Mar; 112(1):107-14. 302. SCERRA S, COIGNARD-BIEHLER H, LANTERNIER F, SUAREZ F, CHARLIER-WOERTHER C, BOUGNOUX ME, GILQUIN J, LECUIT M, HERMINE O, LORTHOLARY O. Disseminatedtoxoplasmosis in nonallografted patients with hematologic malignancies: report of two cases and literature review. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2013 Oct; 32(10):1259-68. 303. SCHÄPPI MG, STAIANO A, MILLA PJ, SMITH VV, DIAS JA, HEUSCHKEL R, HUSBY S, MEARIN ML, PAPADOPOULOU A, RUEMMELE FM, VANDENPLAS Y, KOLETZKO S. A practical guide for the diagnosis of primary enteric nervous system disorders. 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VAN MALDERGEM L, HOU Q, KALSCHEUER VM, RIO M, DOCOFENZY M, MEDEIRA A, DE BROUWER AP, CABROL C, HAAS SA, CACCIAGLI P, MOUTTON S, LANDAIS E, MOTTE J, COLLEAUX L, BONNET C, VILLARD L, DUPONT J, MAN HY. Loss of function of KIAA2022 causes mild to severe intellectual disability with an autism spectrum disorder and impairs neurite outgrowth.Hum Mol Genet. 2013 Aug 15; 22(16):3306-14. 3 3 6. VA N S M E D E N, J. , J A N S S E N S M . , B O I T E N W. A . , VA N DRONGELEN V., FURIO L., VREEKEN R.J., HOVNANIAN, A., BOUWSTRA, J.A. (2013). Intercellular Skin Barrier Lipid Composition and Organization in Netherton Syndrome Patients. The Journal of investigative dermatology. J Invest Dermatol. 2013 Nov 29. Epub ahead of print] 337. VAN TIL NP, SARWARI R, VISSER TP, HAUER J, LAGRESLEPEYROU C, VAN DER VELDEN G, MALSHETTY V, CORTES P, JOLLET A, DANOS O, CASSANI B, ZHANG F, THRASHER AJ, FONTANA E, POLIANI PL, CAVAZZANA M, VERSTEGEN MM, VILLA A, WAGEMAKER G. 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WIECZOREK D, BÖGERSHAUSEN N, BELEGGIA F, STEINERHALDENSTÄTT S, POHL E, LI Y, MILZ E, MARTIN M, THIELE H, ALTMÜLLER J, ALANAY Y, KAYSERILI H, KLEIN-HITPASS L, BÖHRINGER S, WOLLSTEIN A, ALBRECHT B, BODUROGLU K, CALIEBE A, CHRZANOWSKA K, COGULU O, CRISTOFOLI F, CZESCHIK JC, DEVRIENDT K, DOTTI MT, ELCIOGLU N, GENER B, GOECKE TO, KRAJEWSKA-WALASEK M, GUILLÉN-NAVARRO E, HAYEK J, HOUGE G, KILIC E, SIMSEK-KIPER PÖ, LÓPEZ-GONZÁLEZ V, KUECHLER A, LYONNET S, MARI F, MAROZZA A, MATHIEU DRAMARD M, MIKAT B, MORIN G, MORICE-PICARD F, OZKINAY F, RAUCH A, RENIERI A, TINSCHERT S, UTINE GE, VILAIN C, VIVARELLI R, ZWEIER C, NÜRNBERG P, RAHMANN S, VERMEESCH J, LÜDECKE HJ, ZESCHNIGK M, WOLLNIK B. A comprehensive molecular study on Coffin-Siris and Nicolaides-Baraitser syndromes identifies a broad molecular and clinical spectrum converging on altered chromatin remodeling, Hum Mol Genet. 2013 Dec 20; 22(25):5121-35. 350. 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INSTITUT IMAGINE 24 boulevard du Montparnasse - 75015 Paris [email protected] www.institutimagine.org