Examen Multiplex-PCR en cas de diarrhées du voyageur : rapide et

MCL Freiburgstrasse 634 3172 Niederwangen www.mcl.ch
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mai 2016
de Medisupport, le Réseau Suisse de Laboratoires Régionaux n 8 www.medisupport.ch
Examen Multiplex-PCR en cas de diarrhées du voyageur :
rapide et peu coûteux
Les tests de biologie moléculaire (PCR) permettent une détection d’agents pathogènes de la diarrhée plus rapide et plus sensible que
les méthodes conventionnelles. Nous proposons désormais la détection simultanée de plus de 20 agents pathogènes (bactéries, virus et
protozoaires) par Multiplex-PCR. Cette technologie est particulièrement recommandée en présence de diarrhées au retour d’un voyage
et permet d’augmenter de manière significative la sensibilité diagnostique chez ce groupe de patients. De plus, elle met en évidence au
minimum 2 agents pathogènes chez plus de la moitié des patients positifs.
Avantages du Multiplex-PCR
Les tests de biologie moléculaire sont nettement supérieurs
aux méthodes conventionnelles :
»» Meilleure sensibilité
»» Résultats plus rapides
»» Plus grande pertinence clinique
»» Mise en évidence simultanée d’un grand nombre d’agents
pathogènes à partir d’un seul échantillon
»» Notre étude a permis de mettre en évidence au moins 1 agent
pathogène chez près de la moitié des patients en retour de
voyage (46.7%) ayant un diagnostic de base négatif (Salmonella, Shigella, Campylobacter, E. coli entérohémorragique)
»» Cette même étude a mis en évidence au minimum 2 agents
pathogènes chez plus de la moitié des patients positifs (57.1%).
»» Réduction significative des coûts en comparaison avec une
recherche séparée
Indications
La recherche par Multiplex-PCR est particulièrement indiquée
pour l’investigation des diarrhées du voyageur, ainsi que lors
d’épidémies de gastro-entérites d’étiologie inconnue. Elle est
par contre moins indiquée chez des patients sans anamnèse
de voyage.
Disponibilité des résultats
Les échantillons reçus au laboratoire dans le courant de la
matinée sont traités généralement le jour même. Les résultats
sont disponibles en soirée. Les autres échantillons sont analysés et rendus au plus tard le jour suivant.
Les demandes urgentes sont également traitées le week-end,
sur demande téléphonique.
Confirmation par culture
Une culture ciblée est effectuée d’office en cas de résultat
PCR positif nécessitant des investigations supplémentaires.
Cela s’applique en particulier aux Salmonella (sérotypage),
Campylobacter, Yersinia et Shigella/ECEI (test de résistance).
La recherche par PCR étant plus sensible, il faut s’attendre à
des résultats de culture négatifs.
Matériel de prélèvement
Selles en milieu de transport Cary-Blair
Shigella : agent pathogène courant de la diarrhée du voyageur.
(3D-Computer-Illustration, source
CDC/James Archer)
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Germes détectés, prix
Germes détectés
Prix
Diagnostic de base
Salmonella, Shigella, Campylobacter, ECEH
Négatif
Positif
100 PT
177 PT
Multiplex-PCR
Salmonella, Shigella, Campylobacter, Vibrio
Négatif
cholerae, Yersinia enterocolitica, Plesiomonas
Positif
shigelloides, ECET, ECEP, ECEA, ECEI, ECEH,
Adénovirus, Norovirus, Rotavirus, Astrovirus,
Sapovirus, Cryptosporidium, Cyclospora
cayetanensis, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia
303 PT
380 PT
Recherche isolée
Culture uniquement, en plus du diagnostic de base :
(Selon liste des analyses)
Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica,
Plesiomonas shigelloides
Négatif
Positif
22 PT (chacun)
70 PT (chacun)
Seul ou en plus du diagnostic de base :
PCR: ETEC, EPEC, EAEC, EIEC, EHEC, Adénovirus,
Norovirus, Rotavirus, Entamoeba histolytica
180 PT (chacun)
Recherche d’antigènes : Rota-/Adénovirus
44 PT
Recherche d’antigènes : Giardia lamblia
33 PT
Microscopie: protozoaires (Cryptosporidium,
Cyclospora cayetanensis, Entamoeba histolytica/
dispar*, Giardia lamblia)
45 PT
* Si positif, différenciation par PCR / 180 PT
Uniquement sur demande :
Astrovirus, Sapovirus
Renseignements
Dr méd. Dobrila Dimitrijevic
Dr Angelika Ströhle
Dr Carola Maffioli
Tél. 031 329 78 35
Littérature
Altwegg M, A Burnens, A Ströhle. Quantensprung bei der Abklärung von Reisediarrhöen. Der Luzerner Arzt, April 2016
Knabl L, I Grutsch, D Orth-Höller. Comparison of the BD MAX® Enteric Bacterial Panel with conventional diagnostic procedures in diarrheal stool
samples. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2016, 35: 131-136.
Naef L, L Berlinger, E Claas, M Altwegg. The more, the better? When to use highly multiplexed assays for the detection of gastrointestinal pathogens. Eur
Congress Clin Microbiol Infect Dis 2016, Amsterdam, abstract 2218.
Robilotti E, B Deresinski, A Pinsky. Norovirus. Clin Microbiol Rev 2015, 28: 134-164.
Stark D, SE Al-Qassab, JLN Barratt, K Stanley, T Roberts, D Marriott, J Harkness, JT Ellis. Evaluation of multiplex tandem real-time PCR for detection of
Cryptosporidium spp., Dientamoeba fragilis, Entamoeba histolytica, and Giardia intestinalis in clinical stool samples. J Clin Microbiol 2011, 49: 257-262.
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