Dr. Philippe Verplancke

www.xclinical.com
eArchivierung von Studiendaten
im CDISC ODM-Standard
TMF-Workshop, 18. Januar 2012, Berlin
Dr. Philippe Verplancke
XClinical GmbH
XClinical GmbH, 2011
Ein paar Fakten zu XClinical
Foundation / Headquarters:
2002 / Munich, Germany
Legal entity:
XClinical GmbH, private ownership
CEO:
Dr. Philippe Verplancke
Business model:
Software products for clinical trials
(MARVIN, Study Composer, …)
Annual revenue:
1,8 Mio. Euro, profitable
No. of employees:
30
No. of direct, active customers: 32
Experience:
Clinical Trial Software from A to X
170+ trials, 140.000+ subjects
2
Die CDISC Organisation
• Clinical Data Interchange Standards Consortium
• Gegründet in 2000
• Nicht-kommerzielle Organisation mit freiwilliger Mitarbeit
• Aktuell mehr als 250 Industriemitglieder
(Pharma-Unternehmen, CROs, Softwarehersteller, TMF)
• Quasi gesetzlich vorgeschriebene Standards für ArzneimittelZulassungsanträge in USA (FDA), ebenfalls Interesse der
europäischen, japanischen und chinesischen Zulassungsbehörden
Clinical Trial Software from A to X
3
Bedeutung verschiedener CDISC Standards
Terminology
Structure
Format
How do we call things?
Where do we put things?
How do computers
store and exchange
things?
• Protocol (PRM)
• CDISC SHARE
Metadata Repository
• CRF pages (ODM)
• XML
• Lab forms (LAB)
• ASCII
• SAS
• Data tables
(SDTM, define.xml)
• Analysis tables (ADaM)
Clinical Trial Software from A to X
Vorteile von XML
•
•
•
•
•
•
Lesbar durch Mensch und Maschine
Unabhängig von Software oder Hardware
Herstellerunabhängig
Lizenzfrei
„Selbstauszeichnend“: Daten immer zusammen mit Metadaten
Konsistenz und Standard-Compliance kann automatisch
überprüft werden
• Durchsuchbar; leicht wieder in eine Datenbank überführbar
• Einfach in eine Vielzahl anderer Formate transformierbar
(z.B. HTML, PDF, …)
Clinical Trial Software from A to X
5
CDISC Operational Data Model (ODM)
Beispiel: Snapshot Export XML Datei
Clinical Trial Software from A to X
CDISC Operational Data Model (ODM)
Beispiel: Transactional Export XML Datei
Clinical Trial Software from A to X
CDISC ODM: Übersicht der XML Elemente
attributes
ODM
@ Description
Study
AdminData
@ FileType
@ Granularity
@ Archival
@ FileOID
ReferenceData
@ CreationDateTime
@ PriorFileOID
ClinicalData
Association
ds:signature
@ AsOfDateTime
@ ODMVersion
@ Originator
@ SourceSystem
@ SourceSystemVersion
@ ID
Clinical Trial Software from A to X
8
ODM XML Elemente für klinische Daten und
Metadaten
Study
XML Elements for Data
ClinicalData
XML Elements for Metadata
MetaDataVersion
Protocol
SubjectData
StudyEventData
StudyEventDef
FormDef
FormData
ItemGroupDef
ItemGroupData
ItemDef
ItemData
Clinical Trial Software from A to X
9
Referenzen zwischen Daten und Metadaten
attributes
ClinicalData
attributes
@ StudyOID
@ SubjectKey
SubjectData
@ StudyEventOID
attributes
@ StudyEventRepeatKey
StudyEventData
@ FormOID
attributes
FormData
ItemGroupData
ItemData
Clinical Trial Software from A to X
@ FormRepeatKey
attributes
attributes
@ ItemGroupOID
@ ItemGroupRepeatKey
@ ItemOID
10
XML Element für ein MetaData Item
ItemDef
Question
ExternalQuestion
MeasurementUnitRef
RangeCheck
attributes
@ OID
@ Name
@ DataType
@ Length
@ SignificantDigits
CodeListRef
Role
@ SASFieldName
@ SDSVarName
@ Origin
Alias
Clinical Trial Software from A to X
@ Comment
11
XML Element für ein Data Item + Audit Record
Archive
ItemData
attributes
@ ItemOID
@ TransactionType
AuditRecord
@ Value
attributes
UserRef
LocationRef
DateTimeStamp
@ IsNull
@ EditPoint
@ UsedImputationMethod
Who
What
ReasonForChange
SourceID
Signature
When
Why
MeasurementUnitRef
Annotation
Clinical Trial Software from A to X
12
ODM XML Element für die elektronische Unterschrift
von Ärzten , Monitoren, Data Managern, …
Signature
UserRef
• Auf jeder Ebene möglich!
(Items, Formulare, Visiten, Patient)
• Erfüllt 21CFR11
• Ohne Kryptographie
LocationRef
SignatureRef
DateTimeStamp
Clinical Trial Software from A to X
13
ds:Signature zum kryptographischen Schutz
einer ODM XML-Datei als Ganzes
• Auf oberster Ebene, im ODM root Element
• Benutzt den W3C-Standard xmldsig-core
• Wird genutzt von Applikationen, die XML-Dateien generieren
Clinical Trial Software from A to X
14
Praktischer Einsatz von CDISC ODM-XML
für die eArchivierung von Studiendaten
• Verschiedene Dateien werden zusammen archiviert:
• Metadata ODM XML (annotiertes CRF, blank CRF, …) in
sämtlichen Versionen (wg. Protokoll-Amendments)
• Snapshot ODM XML Datei
(letzter Stand der CRF-Daten bei Studienabschluss)
• Transactional ODM XML (Daten inkl. vorheriger Versionen,
Audit Trail Records, Signature Records, Administrative Daten
(User und Zentren), etc.
• PDF-Versionen aller obiger Dateien für einfache Sichtung
• Gesamtarchiv + Archiv pro Prüfzentrum
Clinical Trial Software from A to X
15
Was fehlt im heutigen CDISC ODM-XML Standard
zur vollständigen eArchivierung von Studiendaten?
• Definition von Datenprüfregeln („Queries“, „Edit Checks“)
• Tatsächlich generierte Queries
• Antworten auf die Queries
• Pragmatische Lösung: Speicherung dieser Informationen
innerhalb des ODM-XML Elements „Annotation“
Clinical Trial Software from A to X
16
www.xclinical.com
Kontakt
[email protected]
[email protected]
XClinical GmbH
Arnulfstrasse 19
80335 Munich
Germany
Tel:
Fax:
+49 (0)89 / 45 22 77 – 50 00
+49 (0)89 / 45 22 77 – 59 00
www.xclinical.com
[email protected]
XClinical GmbH, 2011